More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2182 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2182  b-glycosyltransferase  100 
 
 
379 aa  786    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.935401  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2238  glycosyl transferase family 2  36.91 
 
 
374 aa  249  7e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2026  glycosyl transferase family 2  38.32 
 
 
384 aa  242  7e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0402  glycosyl transferase family 2  34.25 
 
 
359 aa  219  6e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.20489 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1040  glycosyl transferase family 2  32.47 
 
 
380 aa  208  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1379  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 
367 aa  172  9e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.500878  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04930  putative transmembrane glycosyltransferase  25.6 
 
 
371 aa  127  4.0000000000000003e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.74238  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0221  glycosyl transferase family protein  25.75 
 
 
368 aa  98.2  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6919  glycosyl transferase family 2  24.43 
 
 
408 aa  88.2  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2174  polysaccharide-forming b-glycosyltransferase-like protein  24.92 
 
 
376 aa  88.2  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.486335 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2236  glycosyl transferase family 2  26.8 
 
 
343 aa  86.7  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4080  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 
401 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.606735  normal  0.10978 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1196  b-glycosyltransferase  24.52 
 
 
349 aa  77.4  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.959593  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1890  glycosyl transferase family protein  25.07 
 
 
443 aa  76.3  0.0000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2222  glycosyl transferase family 2  30.98 
 
 
384 aa  76.3  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0065  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  36.76 
 
 
398 aa  75.5  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  24.24 
 
 
789 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  24.24 
 
 
789 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  24.24 
 
 
789 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4129  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  27.03 
 
 
392 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1431  glycosyl transferase family 2  23.93 
 
 
376 aa  72.4  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.679301 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  23.1 
 
 
399 aa  71.6  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4672  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 
399 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  30.2 
 
 
450 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0372  glycosyl transferase family 2  28.43 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0194499  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0120  glycosyl transferase family protein  27.64 
 
 
375 aa  70.5  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2168  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 
391 aa  70.5  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0242  glycosyl transferase  30.11 
 
 
378 aa  70.1  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0472  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
365 aa  69.7  0.00000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1457  glycosyl transferase family protein  37.62 
 
 
356 aa  69.7  0.00000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.7433 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3358  glycosyl transferase family 2  24.71 
 
 
389 aa  69.7  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0515299  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0847  glycosyl transferase family 2  26.85 
 
 
429 aa  67.8  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3050  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  26.48 
 
 
397 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.824313 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4721  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  27.17 
 
 
395 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7038  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  28.12 
 
 
390 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000681734 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22610  glycosyl transferase  25.83 
 
 
497 aa  67  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.634128  normal  0.441487 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3255  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  26.62 
 
 
395 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.630561  normal  0.127154 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  21.41 
 
 
337 aa  66.6  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  25.15 
 
 
495 aa  66.6  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5422  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  27.44 
 
 
395 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4875  glycosyl transferase family protein  27.44 
 
 
395 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.596859  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0212  glycosyl transferase  32.85 
 
 
382 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000843162  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5309  glycosyl transferase family protein  27.82 
 
 
395 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.286135  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07871  hypothetical protein  19.86 
 
 
364 aa  65.5  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5551  glycosyl transferase family protein  27.82 
 
 
395 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4598  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  33.09 
 
 
400 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.617719  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0523  glycosyl transferase family protein  37.62 
 
 
356 aa  65.1  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.343071 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0107  glycosyl transferase family protein  27.82 
 
 
395 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0949  glycosyltransferase  28.88 
 
 
442 aa  64.7  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.157522  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2926  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.89 
 
 
396 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.896752  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2356  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
380 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1462  putative glycosyltransferase  32.62 
 
 
401 aa  64.7  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046931  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0020  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 
390 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1265  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.11 
 
 
394 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.949141  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2239  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.11 
 
 
394 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0978  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.11 
 
 
394 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1283  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.11 
 
 
396 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3051  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.11 
 
 
396 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.074487  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  24.45 
 
 
1099 aa  63.5  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1960  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.11 
 
 
389 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  27.49 
 
 
315 aa  63.2  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1994  glycosyl transferase family 2  27.11 
 
 
383 aa  63.2  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.713499 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0674  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
382 aa  62.8  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3101  glycosyl transferase family 2  26.19 
 
 
396 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4171  family 2 glycosyl transferase  25.91 
 
 
380 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.147106  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2211  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
357 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276702  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  26.78 
 
 
422 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20620  Glycosyl transferase, family 2  24.19 
 
 
368 aa  62.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268109  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3862  glycosyl transferase family 2  24.4 
 
 
403 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245073  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0829  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 
535 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.759846  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0119  glycosyl transferase family protein  25.12 
 
 
232 aa  61.6  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1491  glycosyl transferase family 2  34.43 
 
 
355 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000591503 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  23.35 
 
 
509 aa  61.2  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4242  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  31.47 
 
 
397 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1272  glycosyl transferase family 2  26.21 
 
 
494 aa  61.2  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102707  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4304  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  31.47 
 
 
397 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  24.38 
 
 
461 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3925  glycosyl transferase family 2  31.07 
 
 
379 aa  61.2  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0774  glycosyl transferase family protein  28.86 
 
 
385 aa  60.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00080815  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1083  glycosyltransferase  27.85 
 
 
458 aa  60.8  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014105 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4954  glycosyl transferase family protein  22.67 
 
 
391 aa  60.5  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00767556  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0595  glycosyl transferase family protein  24.45 
 
 
402 aa  60.5  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  22.75 
 
 
1115 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0362  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 
364 aa  60.1  0.00000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.279909  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  23.75 
 
 
694 aa  60.1  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1829  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  26.4 
 
 
398 aa  60.1  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  24.11 
 
 
425 aa  59.7  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5703  glycosyl transferase family protein  28.31 
 
 
454 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0459973  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4949  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 
446 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816666  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  25.57 
 
 
410 aa  59.3  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2431  glycosyl transferase family 2  27.1 
 
 
397 aa  59.3  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  23.13 
 
 
445 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  22.52 
 
 
927 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  24.03 
 
 
872 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1512  glycosyl transferase family protein  28.34 
 
 
397 aa  58.9  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.342198  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0228  glycosyl transferase family protein  20.86 
 
 
333 aa  58.2  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000082788  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1372  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 
397 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.704698  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  22.96 
 
 
1119 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4122  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
311 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.408918  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3171  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 
297 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675731  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>