More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0829 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_0829  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
535 aa  1050    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.759846  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5703  glycosyl transferase family protein  61.61 
 
 
454 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0459973  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4598  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  49.07 
 
 
400 aa  350  5e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.617719  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4672  glycosyl transferase family protein  44.42 
 
 
399 aa  342  9e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3050  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  42.86 
 
 
397 aa  330  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.824313 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1372  glycosyl transferase family protein  40.26 
 
 
397 aa  318  1e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.704698  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4304  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  45.08 
 
 
397 aa  317  4e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4242  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  45.08 
 
 
397 aa  317  4e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0065  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  47 
 
 
398 aa  305  2.0000000000000002e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1462  putative glycosyltransferase  46.29 
 
 
401 aa  301  1e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046931  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0443  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  45.23 
 
 
382 aa  301  1e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000679717 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0266  glycosyl transferase, group 2 family protein  45.23 
 
 
408 aa  301  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1829  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  44.97 
 
 
398 aa  293  4e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4129  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  43.73 
 
 
392 aa  280  5e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4171  family 2 glycosyl transferase  43.12 
 
 
380 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.147106  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1722  glycosyl transferase family protein  44.58 
 
 
430 aa  278  2e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.948662  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5422  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  42.39 
 
 
395 aa  272  9e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4875  glycosyl transferase family protein  42.39 
 
 
395 aa  272  9e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.596859  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5309  glycosyl transferase family protein  42.82 
 
 
395 aa  270  5e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.286135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5551  glycosyl transferase family protein  42.82 
 
 
395 aa  270  5e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3255  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  42.82 
 
 
395 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.630561  normal  0.127154 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4721  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  42.56 
 
 
395 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7038  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  43.65 
 
 
390 aa  266  5e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000681734 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0107  glycosyl transferase family protein  42.42 
 
 
395 aa  265  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0020  glycosyl transferase family protein  43.22 
 
 
390 aa  264  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0120  glycosyl transferase family protein  45.99 
 
 
375 aa  260  3e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2239  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.93 
 
 
394 aa  259  7e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1265  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.93 
 
 
394 aa  259  7e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.949141  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0978  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.93 
 
 
394 aa  259  7e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0064  squalene-phytoene synthase  44.91 
 
 
687 aa  258  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2926  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.46 
 
 
396 aa  259  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.896752  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1960  glycosyl transferase, group 2 family protein  43.56 
 
 
389 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1283  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.21 
 
 
396 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3051  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.21 
 
 
396 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.074487  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2242  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.79 
 
 
397 aa  251  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.9 
 
 
347 aa  247  3e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4896  glycosyl transferase family protein  43.57 
 
 
382 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20620  Glycosyl transferase, family 2  39.89 
 
 
368 aa  214  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268109  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0372  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
381 aa  150  5e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0194499  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1158  glycosyl transferase family protein  32.61 
 
 
403 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1994  glycosyl transferase family 2  30.11 
 
 
383 aa  146  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.713499 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0386  glycosyl transferase family protein  32.63 
 
 
393 aa  146  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.737923  normal  0.151625 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0774  glycosyl transferase family protein  31.44 
 
 
385 aa  136  8e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00080815  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0212  glycosyl transferase  28.37 
 
 
382 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000843162  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2168  glycosyl transferase family 2  30.11 
 
 
391 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2356  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 
380 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0674  glycosyl transferase family 2  30.85 
 
 
382 aa  121  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0242  glycosyl transferase  31.81 
 
 
378 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2211  glycosyl transferase family protein  33.76 
 
 
357 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276702  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2222  glycosyl transferase family 2  29.1 
 
 
384 aa  114  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3292  glycosyl transferase family 2  33.1 
 
 
379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2307  glycosyl transferase family protein  37.34 
 
 
360 aa  110  8.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1835  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 
395 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0991  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 
407 aa  100  6e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.400762  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0952  glycosyl transferase family 2  32.36 
 
 
377 aa  100  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17181  glycosyl transferase family protein  26.37 
 
 
407 aa  100  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.793323 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1491  glycosyl transferase family 2  31.79 
 
 
355 aa  99.8  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000591503 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0595  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
402 aa  99.8  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3247  glycosyl transferase family protein  33.87 
 
 
375 aa  99.8  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14939  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3925  glycosyl transferase family 2  27.97 
 
 
379 aa  98.2  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2496  glycosyl transferase family 2  32.57 
 
 
378 aa  95.5  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000682881  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1665  glycosyl transferase family 2  27.01 
 
 
401 aa  94.7  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1512  glycosyl transferase family protein  26.5 
 
 
397 aa  95.1  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.342198  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2431  glycosyl transferase family 2  25.63 
 
 
397 aa  95.1  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1393  glycosyl transferase family protein  32.95 
 
 
395 aa  94.7  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0519554  hitchhiker  0.000418344 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3224  glycosyl transferase family 2  30.9 
 
 
367 aa  94.4  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.210562  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3832  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.67 
 
 
413 aa  91.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.956349  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3474  glycosyl transferase family protein  32.11 
 
 
375 aa  91.7  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288784  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4949  glycosyl transferase family 2  30.75 
 
 
385 aa  89  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000550956  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2547  glycosyl transferase family 2  32.46 
 
 
378 aa  89  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3743  glycosyl transferase family 2  31.48 
 
 
386 aa  87.4  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178999  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0385  family 2 glycosyl transferase  30.17 
 
 
362 aa  86.3  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.361045  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3434  glycosyl transferase family protein  31.91 
 
 
386 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.394564 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0167  glycosyl transferase family 2  23.78 
 
 
365 aa  86.7  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00277804  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1512  glycosyl transferase family protein  31.69 
 
 
396 aa  85.5  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00217287  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5123  glycosyl transferase family protein  32.24 
 
 
441 aa  84.3  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.0746579 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2509  glycosyl transferase family 2  29.88 
 
 
408 aa  84.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.790074 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0337  glycosyl transferase family 2  27.07 
 
 
349 aa  79.7  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5029  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 
378 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0141962  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0335  glycosyl transferase family 2  23.61 
 
 
346 aa  78.2  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3630  glycosyl transferase family 2  30.66 
 
 
386 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0987324  normal  0.0592371 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0427  family 2 glycosyl transferase  26.15 
 
 
388 aa  77.8  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0550  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 
391 aa  77.8  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000102779  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3101  glycosyl transferase family 2  24.26 
 
 
396 aa  77.4  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0749  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 
410 aa  76.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.702214  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2824  glycosyl transferase family 2  27.44 
 
 
375 aa  71.6  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04191  hypothetical protein  22.28 
 
 
394 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1868  glycosyl transferase family 2  29.61 
 
 
369 aa  68.6  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  29 
 
 
450 aa  67.8  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 
433 aa  67  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3158  glycosyl transferase family protein  32.85 
 
 
364 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0796  glycosyl transferase family 2  32.34 
 
 
410 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.048346  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5599  N-acetylglucosaminyltransferase  26.67 
 
 
262 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0041999  hitchhiker  0.0000000000128208 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  29.66 
 
 
495 aa  65.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  27.39 
 
 
433 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0800  glycosyl transferase family 2  31.84 
 
 
410 aa  63.9  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  29.77 
 
 
637 aa  63.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  27.39 
 
 
433 aa  63.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  27.39 
 
 
433 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  27.39 
 
 
433 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>