More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4171 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4171  family 2 glycosyl transferase  100 
 
 		 380 aa  754    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.147106  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4896  glycosyl transferase family protein  75.66 
 
 		 382 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3255  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  62.98 
 
 		 395 aa  450  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.630561  normal  0.127154 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5422  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  62.4 
 
 		 395 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4721  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  63.4 
 
 		 395 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5309  glycosyl transferase family protein  63.66 
 
 		 395 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.286135  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4875  glycosyl transferase family protein  62.4 
 
 		 395 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.596859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2926  glycosyl transferase, group 2 family protein  62.4 
 
 		 396 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.896752  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5551  glycosyl transferase family protein  63.66 
 
 		 395 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2239  glycosyl transferase, group 2 family protein  61.18 
 
 		 394 aa  441  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0978  glycosyl transferase, group 2 family protein  61.18 
 
 		 394 aa  441  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1265  glycosyl transferase, group 2 family protein  61.18 
 
 		 394 aa  441  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.949141  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1960  glycosyl transferase, group 2 family protein  61.34 
 
 		 389 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0020  glycosyl transferase family protein  61.5 
 
 		 390 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4129  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  60.94 
 
 		 392 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7038  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  62.5 
 
 		 390 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000681734 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1283  glycosyl transferase, group 2 family protein  61.89 
 
 		 396 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3051  glycosyl transferase, group 2 family protein  61.89 
 
 		 396 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.074487  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0107  glycosyl transferase family protein  62.89 
 
 		 395 aa  434  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2242  glycosyl transferase, group 2 family protein  62.24 
 
 		 397 aa  425  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4672  glycosyl transferase family protein  44.16 
 
 		 399 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4598  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  48.66 
 
 		 400 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.617719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1829  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  48.05 
 
 		 398 aa  316  4e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3050  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  42.42 
 
 		 397 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.824313 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1372  glycosyl transferase family protein  41.93 
 
 		 397 aa  311  9e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.704698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4304  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  43.93 
 
 		 397 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4242  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  43.93 
 
 		 397 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0065  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  48.54 
 
 		 398 aa  311  2e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0266  glycosyl transferase, group 2 family protein  48.77 
 
 		 408 aa  309  5.9999999999999995e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0443  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  49.18 
 
 		 382 aa  309  5.9999999999999995e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000679717 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0064  squalene-phytoene synthase  54.05 
 
 		 687 aa  296  5e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5703  glycosyl transferase family protein  47.8 
 
 		 454 aa  290  4e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0459973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1462  putative glycosyltransferase  42.38 
 
 		 401 aa  269  5e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046931  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0829  glycosyl transferase family protein  43.12 
 
 		 535 aa  258  8e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.759846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0120  glycosyl transferase family protein  42.86 
 
 		 375 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20620  Glycosyl transferase, family 2  42.51 
 
 		 368 aa  233  6e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268109  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.67 
 
 		 347 aa  218  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1722  glycosyl transferase family protein  40 
 
 		 430 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.948662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1994  glycosyl transferase family 2  29.92 
 
 		 383 aa  146  6e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.713499 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0386  glycosyl transferase family protein  35.16 
 
 		 393 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.737923  normal  0.151625 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1158  glycosyl transferase family protein  33.68 
 
 		 403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0774  glycosyl transferase family protein  30.96 
 
 		 385 aa  136  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00080815  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0372  glycosyl transferase family 2  29.46 
 
 		 381 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0194499  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0674  glycosyl transferase family 2  32.2 
 
 		 382 aa  132  9e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1512  glycosyl transferase family protein  34.76 
 
 		 397 aa  126  8.000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.342198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0991  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 		 407 aa  123  5e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.400762  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2222  glycosyl transferase family 2  29.16 
 
 		 384 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0212  glycosyl transferase  28.99 
 
 		 382 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000843162  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3292  glycosyl transferase family 2  33.92 
 
 		 379 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2211  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 		 357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276702  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2356  glycosyl transferase family protein  29.6 
 
 		 380 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2168  glycosyl transferase family 2  27.32 
 
 		 391 aa  114  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0242  glycosyl transferase  30.9 
 
 		 378 aa  113  5e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17181  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 		 407 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.793323 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3101  glycosyl transferase family 2  29.64 
 
 		 396 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0595  glycosyl transferase family protein  24.72 
 
 		 402 aa  103  7e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2307  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 360 aa  101  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2496  glycosyl transferase family 2  28.86 
 
 		 378 aa  100  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000682881  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0952  glycosyl transferase family 2  34.33 
 
 		 377 aa  99.4  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1491  glycosyl transferase family 2  29.38 
 
 		 355 aa  97.1  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000591503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3247  glycosyl transferase family protein  28.36 
 
 		 375 aa  97.1  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14939  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04191  hypothetical protein  27.84 
 
 		 394 aa  96.7  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2431  glycosyl transferase family 2  28.38 
 
 		 397 aa  96.3  7e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3474  glycosyl transferase family protein  28.08 
 
 		 375 aa  95.1  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288784  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1512  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 396 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00217287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0385  family 2 glycosyl transferase  30.68 
 
 		 362 aa  94.7  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.361045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1835  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 		 395 aa  94  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0427  family 2 glycosyl transferase  30.42 
 
 		 388 aa  92  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3925  glycosyl transferase family 2  28.18 
 
 		 379 aa  92  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2509  glycosyl transferase family 2  28.27 
 
 		 408 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.790074 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3832  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.77 
 
 		 413 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.956349  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3743  glycosyl transferase family 2  33.73 
 
 		 386 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3434  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 		 386 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.394564 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1393  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0519554  hitchhiker  0.000418344 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3630  glycosyl transferase family 2  31.6 
 
 		 386 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0987324  normal  0.0592371 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2547  glycosyl transferase family 2  32.16 
 
 		 378 aa  79.7  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5029  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 378 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0141962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1665  glycosyl transferase family 2  26.11 
 
 		 401 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4949  glycosyl transferase family 2  32.83 
 
 		 385 aa  76.6  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000550956  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3224  glycosyl transferase family 2  28.78 
 
 		 367 aa  75.9  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.210562  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0749  glycosyl transferase family protein  32.09 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.702214  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3158  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 		 364 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0167  glycosyl transferase family 2  23.68 
 
 		 365 aa  70.9  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00277804  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0550  glycosyl transferase family protein  24.9 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000102779  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0337  glycosyl transferase family 2  24.35 
 
 		 349 aa  65.5  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5123  glycosyl transferase family protein  29.67 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.0746579 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1868  glycosyl transferase family 2  25.57 
 
 		 369 aa  63.2  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0335  glycosyl transferase family 2  21.24 
 
 		 346 aa  61.6  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2182  b-glycosyltransferase  25.58 
 
 		 379 aa  62  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.935401  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0796  glycosyl transferase family 2  31.5 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.048346  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2824  glycosyl transferase family 2  26.63 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2541  putative glycosyl transferase  25 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4113  glycosyl transferase family 2  26.03 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.902695  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0800  glycosyl transferase family 2  31.5 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 		 495 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  29.81 
 
 		 1099 aa  57.8  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1988  glycosyl transferase family 2  30.5 
 
 		 445 aa  58.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1040  glycosyl transferase family 2  23.5 
 
 		 380 aa  57  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22610  glycosyl transferase  28.88 
 
 		 497 aa  57  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.634128  normal  0.441487 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0402  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 		 359 aa  56.6  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.20489 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>