More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0443 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0443  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  100 
 
 
382 aa  763    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000679717 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0266  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
408 aa  764    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4598  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  54.3 
 
 
400 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.617719  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4672  glycosyl transferase family protein  49.22 
 
 
399 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3050  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  47.8 
 
 
397 aa  349  4e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.824313 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1372  glycosyl transferase family protein  42.2 
 
 
397 aa  333  2e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.704698  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4242  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  46.32 
 
 
397 aa  322  8e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4304  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  46.32 
 
 
397 aa  322  8e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4129  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  50.8 
 
 
392 aa  318  9e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5422  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  49.47 
 
 
395 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3255  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  49.08 
 
 
395 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.630561  normal  0.127154 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4875  glycosyl transferase family protein  49.47 
 
 
395 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.596859  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5309  glycosyl transferase family protein  49.08 
 
 
395 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.286135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5551  glycosyl transferase family protein  49.08 
 
 
395 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4171  family 2 glycosyl transferase  48.66 
 
 
380 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.147106  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1960  glycosyl transferase, group 2 family protein  51.19 
 
 
389 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4721  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  48.82 
 
 
395 aa  309  4e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2239  glycosyl transferase, group 2 family protein  51.19 
 
 
394 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1265  glycosyl transferase, group 2 family protein  51.19 
 
 
394 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.949141  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0978  glycosyl transferase, group 2 family protein  51.19 
 
 
394 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2926  glycosyl transferase, group 2 family protein  50.92 
 
 
396 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.896752  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7038  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  49.73 
 
 
390 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000681734 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0020  glycosyl transferase family protein  50 
 
 
390 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0107  glycosyl transferase family protein  48.42 
 
 
395 aa  301  9e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1283  glycosyl transferase, group 2 family protein  49.34 
 
 
396 aa  299  6e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3051  glycosyl transferase, group 2 family protein  49.34 
 
 
396 aa  299  6e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.074487  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0064  squalene-phytoene synthase  53.1 
 
 
687 aa  296  6e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2242  glycosyl transferase, group 2 family protein  50.52 
 
 
397 aa  291  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0829  glycosyl transferase family protein  45.69 
 
 
535 aa  290  4e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.759846  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1829  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  44.36 
 
 
398 aa  289  7e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5703  glycosyl transferase family protein  46.89 
 
 
454 aa  288  9e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0459973  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0065  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  45.41 
 
 
398 aa  283  4.0000000000000003e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4896  glycosyl transferase family protein  47.73 
 
 
382 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1462  putative glycosyltransferase  44.19 
 
 
401 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046931  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0120  glycosyl transferase family protein  45.31 
 
 
375 aa  265  8e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1722  glycosyl transferase family protein  43.15 
 
 
430 aa  265  8e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.948662  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20620  Glycosyl transferase, family 2  42.43 
 
 
368 aa  240  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268109  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  44.41 
 
 
347 aa  235  8e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2222  glycosyl transferase family 2  33.7 
 
 
384 aa  165  9e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1994  glycosyl transferase family 2  28.86 
 
 
383 aa  147  3e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.713499 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1158  glycosyl transferase family protein  40.66 
 
 
403 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0386  glycosyl transferase family protein  32.98 
 
 
393 aa  146  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.737923  normal  0.151625 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0774  glycosyl transferase family protein  31.04 
 
 
385 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00080815  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0372  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 
381 aa  143  6e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0194499  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2168  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 
391 aa  137  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0242  glycosyl transferase  32.84 
 
 
378 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0212  glycosyl transferase  28.93 
 
 
382 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000843162  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2356  glycosyl transferase family protein  28.17 
 
 
380 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0674  glycosyl transferase family 2  31.75 
 
 
382 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2211  glycosyl transferase family protein  33.96 
 
 
357 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276702  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1512  glycosyl transferase family protein  30.9 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.342198  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17181  glycosyl transferase family protein  26.52 
 
 
407 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.793323 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0595  glycosyl transferase family protein  24.4 
 
 
402 aa  114  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0991  glycosyl transferase family protein  32.38 
 
 
407 aa  110  3e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.400762  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3832  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.08 
 
 
413 aa  106  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.956349  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1835  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 
395 aa  105  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04191  hypothetical protein  25.33 
 
 
394 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2431  glycosyl transferase family 2  30.31 
 
 
397 aa  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2307  glycosyl transferase family protein  36.86 
 
 
360 aa  100  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0952  glycosyl transferase family 2  33.96 
 
 
377 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0385  family 2 glycosyl transferase  33.33 
 
 
362 aa  100  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.361045  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3925  glycosyl transferase family 2  29.19 
 
 
379 aa  100  6e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1491  glycosyl transferase family 2  32.35 
 
 
355 aa  95.9  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000591503 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1665  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 
401 aa  95.1  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2509  glycosyl transferase family 2  31.8 
 
 
408 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.790074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1512  glycosyl transferase family protein  32.5 
 
 
396 aa  93.2  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00217287  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3292  glycosyl transferase family 2  33.94 
 
 
379 aa  88.2  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3101  glycosyl transferase family 2  28.06 
 
 
396 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0427  family 2 glycosyl transferase  30.34 
 
 
388 aa  85.9  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2496  glycosyl transferase family 2  30.37 
 
 
378 aa  84.3  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000682881  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0550  glycosyl transferase family protein  30.52 
 
 
391 aa  83.6  0.000000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000102779  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2824  glycosyl transferase family 2  30.37 
 
 
375 aa  83.6  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3630  glycosyl transferase family 2  30.24 
 
 
386 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0987324  normal  0.0592371 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0335  glycosyl transferase family 2  25.29 
 
 
346 aa  83.2  0.000000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2547  glycosyl transferase family 2  33.49 
 
 
378 aa  80.9  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1393  glycosyl transferase family protein  35 
 
 
395 aa  80.1  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0519554  hitchhiker  0.000418344 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0749  glycosyl transferase family protein  35.84 
 
 
410 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.702214  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3247  glycosyl transferase family protein  30.18 
 
 
375 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14939  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  33.8 
 
 
752 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3743  glycosyl transferase family 2  30.8 
 
 
386 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178999  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0337  glycosyl transferase family 2  25.22 
 
 
349 aa  76.6  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3434  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 
386 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.394564 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0167  glycosyl transferase family 2  26.18 
 
 
365 aa  75.9  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00277804  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5123  glycosyl transferase family protein  34.63 
 
 
441 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.0746579 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4949  glycosyl transferase family 2  33.74 
 
 
385 aa  74.3  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000550956  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 
425 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5029  glycosyl transferase family protein  32.04 
 
 
378 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0141962  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3474  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 
375 aa  67.8  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288784  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1868  glycosyl transferase family 2  28.32 
 
 
369 aa  67.4  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  30.35 
 
 
1099 aa  66.6  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3224  glycosyl transferase family 2  27.76 
 
 
367 aa  66.2  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.210562  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0796  glycosyl transferase family 2  35.5 
 
 
410 aa  66.2  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.048346  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5026  glycosyl transferase family protein  38.89 
 
 
485 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4643  glycosyl transferase family protein  38.89 
 
 
485 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  27.5 
 
 
450 aa  66.2  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4731  glycosyl transferase family protein  38.89 
 
 
485 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2368  glycosyl transferase family protein  39.68 
 
 
378 aa  64.7  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  34.02 
 
 
637 aa  62.8  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0800  glycosyl transferase family 2  34.67 
 
 
410 aa  63.2  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3521  glycosyl transferase family protein  27.52 
 
 
479 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>