123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2547 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2547  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
378 aa  736    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1393  glycosyl transferase family protein  54.89 
 
 
395 aa  333  2e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0519554  hitchhiker  0.000418344 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3292  glycosyl transferase family 2  53.87 
 
 
379 aa  318  7.999999999999999e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5123  glycosyl transferase family protein  55.06 
 
 
441 aa  304  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.0746579 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4949  glycosyl transferase family 2  54.2 
 
 
385 aa  295  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000550956  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3224  glycosyl transferase family 2  52.3 
 
 
367 aa  284  2.0000000000000002e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.210562  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3474  glycosyl transferase family protein  48.15 
 
 
375 aa  276  3e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288784  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3247  glycosyl transferase family protein  49.86 
 
 
375 aa  269  7e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14939  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0212  glycosyl transferase  33.6 
 
 
382 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000843162  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0372  glycosyl transferase family 2  31.68 
 
 
381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0194499  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2222  glycosyl transferase family 2  36.98 
 
 
384 aa  158  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0242  glycosyl transferase  33.06 
 
 
378 aa  155  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2824  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 
375 aa  154  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2356  glycosyl transferase family protein  32.11 
 
 
380 aa  153  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1491  glycosyl transferase family 2  34.04 
 
 
355 aa  153  5e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000591503 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3925  glycosyl transferase family 2  30.29 
 
 
379 aa  152  8.999999999999999e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1994  glycosyl transferase family 2  31.68 
 
 
383 aa  151  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.713499 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2168  glycosyl transferase family 2  31.07 
 
 
391 aa  145  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0385  family 2 glycosyl transferase  36.99 
 
 
362 aa  144  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.361045  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5029  glycosyl transferase family protein  32.65 
 
 
378 aa  142  8e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0141962  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2307  glycosyl transferase family protein  36.34 
 
 
360 aa  142  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3158  glycosyl transferase family protein  34.15 
 
 
364 aa  136  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3434  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 
386 aa  136  8e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.394564 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3743  glycosyl transferase family 2  31.2 
 
 
386 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178999  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0674  glycosyl transferase family 2  34.94 
 
 
382 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3630  glycosyl transferase family 2  31.56 
 
 
386 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0987324  normal  0.0592371 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2496  glycosyl transferase family 2  36.07 
 
 
378 aa  127  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000682881  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0774  glycosyl transferase family protein  33.8 
 
 
385 aa  125  9e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00080815  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1512  glycosyl transferase family protein  35.15 
 
 
397 aa  124  4e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.342198  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1158  glycosyl transferase family protein  32.54 
 
 
403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0386  glycosyl transferase family protein  34.32 
 
 
393 aa  121  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.737923  normal  0.151625 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2211  glycosyl transferase family protein  30.5 
 
 
357 aa  116  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276702  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20620  Glycosyl transferase, family 2  30.15 
 
 
368 aa  112  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268109  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17181  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 
407 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.793323 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2509  glycosyl transferase family 2  26.05 
 
 
408 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.790074 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4598  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  26.74 
 
 
400 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.617719  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0595  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 
402 aa  102  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04191  hypothetical protein  26.35 
 
 
394 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3832  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.11 
 
 
413 aa  96.7  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.956349  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0120  glycosyl transferase family protein  29.97 
 
 
375 aa  96.7  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0991  glycosyl transferase family protein  30.15 
 
 
407 aa  96.3  8e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.400762  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1512  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 
396 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00217287  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0427  family 2 glycosyl transferase  28.09 
 
 
388 aa  91.7  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0337  glycosyl transferase family 2  27.57 
 
 
349 aa  91.3  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0065  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  29.66 
 
 
398 aa  90.9  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3101  glycosyl transferase family 2  26.22 
 
 
396 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0829  glycosyl transferase family protein  30.99 
 
 
535 aa  90.1  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.759846  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0550  glycosyl transferase family protein  25.15 
 
 
391 aa  88.2  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000102779  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.41 
 
 
347 aa  85.5  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4672  glycosyl transferase family protein  25.99 
 
 
399 aa  85.5  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1722  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 
430 aa  84.3  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.948662  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1829  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  30.81 
 
 
398 aa  84  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5703  glycosyl transferase family protein  32.41 
 
 
454 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0459973  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0443  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  30.34 
 
 
382 aa  82.8  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000679717 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0335  glycosyl transferase family 2  26.47 
 
 
346 aa  82.4  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0266  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.34 
 
 
408 aa  82.4  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3050  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  24.18 
 
 
397 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.824313 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4171  family 2 glycosyl transferase  28.53 
 
 
380 aa  80.1  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.147106  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4896  glycosyl transferase family protein  28.26 
 
 
382 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1462  putative glycosyltransferase  26.82 
 
 
401 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046931  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1372  glycosyl transferase family protein  22.93 
 
 
397 aa  77.4  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.704698  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2236  glycosyl transferase family 2  26.65 
 
 
343 aa  77  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0952  glycosyl transferase family 2  30.48 
 
 
377 aa  76.6  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4129  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  28.52 
 
 
392 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1868  glycosyl transferase family 2  28.17 
 
 
369 aa  75.1  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1574  glycosyl transferase family 2  31.14 
 
 
315 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2431  glycosyl transferase family 2  25.54 
 
 
397 aa  73.9  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0167  glycosyl transferase family 2  24.5 
 
 
365 aa  72  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00277804  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1665  glycosyl transferase family 2  25.83 
 
 
401 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1835  glycosyl transferase family protein  25.58 
 
 
395 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4242  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  22.37 
 
 
397 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4304  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  22.37 
 
 
397 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3255  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  26.48 
 
 
395 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.630561  normal  0.127154 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2585  glycosyl transferase family protein  24.01 
 
 
375 aa  63.5  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2639  glycosyl transferase family protein  24.01 
 
 
375 aa  63.5  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5422  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  25.44 
 
 
395 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7038  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  29.47 
 
 
390 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000681734 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5309  glycosyl transferase family protein  25.78 
 
 
395 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.286135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5551  glycosyl transferase family protein  25.78 
 
 
395 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4875  glycosyl transferase family protein  25.44 
 
 
395 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.596859  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2926  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.78 
 
 
396 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.896752  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4721  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  25.44 
 
 
395 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1960  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.93 
 
 
389 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1283  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.93 
 
 
396 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0107  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 
395 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0978  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.93 
 
 
394 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1265  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.93 
 
 
394 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.949141  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3051  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.93 
 
 
396 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.074487  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2239  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.93 
 
 
394 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0020  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 
390 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2026  glycosyl transferase family 2  30.14 
 
 
384 aa  56.2  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2174  polysaccharide-forming b-glycosyltransferase-like protein  23.32 
 
 
376 aa  55.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.486335 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0749  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 
410 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.702214  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2242  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.56 
 
 
397 aa  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0111  glycosyl transferase family protein  25.34 
 
 
318 aa  51.2  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375009  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  45.16 
 
 
1032 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0796  glycosyl transferase family 2  28.87 
 
 
410 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.048346  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0359  glycosyl transferase family protein  28.08 
 
 
568 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143693  normal  0.385412 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1166  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.9 
 
 
297 aa  46.6  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2447  glycosyl transferase family protein  28.93 
 
 
352 aa  46.6  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>