More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0402 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0402  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
359 aa  738    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.20489 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1040  glycosyl transferase family 2  42.02 
 
 
380 aa  287  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2026  glycosyl transferase family 2  41.42 
 
 
384 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2238  glycosyl transferase family 2  38.1 
 
 
374 aa  240  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2182  b-glycosyltransferase  34.25 
 
 
379 aa  207  3e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.935401  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1379  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 
367 aa  181  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.500878  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04930  putative transmembrane glycosyltransferase  33.52 
 
 
371 aa  152  8e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.74238  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0221  glycosyl transferase family protein  28.61 
 
 
368 aa  120  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2236  glycosyl transferase family 2  32.24 
 
 
343 aa  113  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1196  b-glycosyltransferase  26.97 
 
 
349 aa  109  7.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.959593  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2174  polysaccharide-forming b-glycosyltransferase-like protein  27.87 
 
 
376 aa  100  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.486335 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3358  glycosyl transferase family 2  29.46 
 
 
389 aa  98.6  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0515299  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1431  glycosyl transferase family 2  27.17 
 
 
376 aa  97.4  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.679301 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  32.89 
 
 
337 aa  93.2  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4080  glycosyl transferase family 2  29.08 
 
 
401 aa  93.2  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.606735  normal  0.10978 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6919  glycosyl transferase family 2  27.44 
 
 
408 aa  89.4  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1244  glycosyl transferase family 2  28.86 
 
 
328 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.161463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1214  glycosyl transferase family 2  28.86 
 
 
328 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  26.42 
 
 
1099 aa  87.4  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  28.94 
 
 
461 aa  86.3  7e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07871  hypothetical protein  25.79 
 
 
364 aa  85.5  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  28.28 
 
 
752 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  30.3 
 
 
422 aa  83.6  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0949  glycosyltransferase  27.99 
 
 
442 aa  83.2  0.000000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.157522  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 
322 aa  82.8  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  25.82 
 
 
789 aa  82.8  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  25.82 
 
 
789 aa  82.8  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  25.82 
 
 
789 aa  82.8  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  26.88 
 
 
549 aa  82.4  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1890  glycosyl transferase family protein  24.92 
 
 
443 aa  81.3  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1781  glycosyl transferase family 2  28.76 
 
 
326 aa  80.5  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.456914  normal  0.601286 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0847  glycosyl transferase family 2  32.08 
 
 
429 aa  80.1  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  25.42 
 
 
509 aa  78.2  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1994  glycosyl transferase family 2  38.56 
 
 
383 aa  78.2  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.713499 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.34 
 
 
1115 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  29.22 
 
 
236 aa  76.6  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
528 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
425 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  27.63 
 
 
475 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  27.63 
 
 
475 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  32.02 
 
 
235 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0337  glycosyl transferase family 2  28.01 
 
 
349 aa  75.5  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0242  glycosyl transferase  31.05 
 
 
378 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  25.89 
 
 
1115 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0335  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
346 aa  74.3  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.34 
 
 
1115 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0057  putative glycosyltransferase  26.36 
 
 
443 aa  73.9  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1662  glycosyl transferase family protein  26.81 
 
 
345 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.363785  hitchhiker  0.00433752 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  27.59 
 
 
927 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  25.57 
 
 
1119 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1977  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.79 
 
 
380 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  25.57 
 
 
872 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  27.59 
 
 
1115 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
233 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2222  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 
384 aa  72  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1291  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 
351 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  25.26 
 
 
442 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0372  glycosyl transferase family 2  26.01 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0194499  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  24.77 
 
 
442 aa  72  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  27.5 
 
 
445 aa  72  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  25.21 
 
 
311 aa  72  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2989  family 2 glycosyl transferase  26.09 
 
 
322 aa  71.6  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  24.89 
 
 
309 aa  71.6  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0968  hypothetical protein  32.31 
 
 
235 aa  71.6  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.683686  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2356  glycosyl transferase family protein  32.42 
 
 
380 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  27.23 
 
 
1120 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0774  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 
385 aa  70.1  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00080815  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  25.32 
 
 
321 aa  69.3  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0550  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 
391 aa  68.9  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000102779  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  23.34 
 
 
1101 aa  68.9  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1256  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 
240 aa  68.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000223583  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3231  glycosyl transferase family protein  25.54 
 
 
316 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000094491  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1078  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 
232 aa  68.6  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892634  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2154  glycosyl transferase family protein  27.05 
 
 
466 aa  68.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.119958 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3111  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 
297 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3171  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 
297 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675731  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3583  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 
395 aa  67.4  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1457  glycosyl transferase family protein  38.68 
 
 
356 aa  67.8  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.7433 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  25.56 
 
 
694 aa  67  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  26.34 
 
 
637 aa  67.4  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0120  glycosyl transferase family protein  26.81 
 
 
375 aa  67  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2307  glycosyl transferase family protein  27.46 
 
 
360 aa  67  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17851  glycosyl transferase family protein  25.51 
 
 
437 aa  66.6  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1665  glycosyl transferase family 2  27.15 
 
 
401 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0119  glycosyl transferase family protein  27.41 
 
 
232 aa  66.2  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1844  glycosyl transferase family 2  25.11 
 
 
387 aa  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  24.55 
 
 
315 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2330  glycosyl transferase family protein  29.71 
 
 
376 aa  65.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000511851  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4588  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 
307 aa  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.151626  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  24.22 
 
 
410 aa  65.5  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0167  glycosyl transferase family 2  24.9 
 
 
365 aa  65.1  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00277804  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  23.79 
 
 
305 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  24.21 
 
 
633 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3925  glycosyl transferase family 2  28.26 
 
 
379 aa  63.9  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1536  glycosyl transferase family 2  27.37 
 
 
238 aa  63.9  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3219  glycosyl transferase family 2  26.45 
 
 
314 aa  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  22.49 
 
 
1118 aa  63.5  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20620  Glycosyl transferase, family 2  22.41 
 
 
368 aa  63.9  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268109  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  24.8 
 
 
418 aa  63.2  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1491  glycosyl transferase family 2  28.34 
 
 
355 aa  63.2  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000591503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>