More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2541 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2541  putative glycosyl transferase  100 
 
 
341 aa  688    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3875  glycosyl transferase family 2  83.03 
 
 
331 aa  566  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0718  family 2 glycosyl transferase  77.67 
 
 
352 aa  499  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00805458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1349  glycosyltransferase  73.99 
 
 
343 aa  488  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4113  glycosyl transferase family 2  71.52 
 
 
343 aa  476  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.902695  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7649  glycosyl transferase family 2  62.39 
 
 
352 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08480  glycosyl transferase  60.63 
 
 
324 aa  377  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.525807 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0838  glycosyl transferase family 2  46.63 
 
 
368 aa  278  1e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1029  glycosyl transferase family protein  35.36 
 
 
360 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0604  putative glycosyl transferase  35.44 
 
 
340 aa  171  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.781878  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3183  glycosyl transferase family 2  34.56 
 
 
358 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292304  decreased coverage  0.0000016442 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0722  succinoglycan biosynthesis protein ExoA  34.26 
 
 
353 aa  160  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5927  succinoglycan biosynthesis protein  33.65 
 
 
341 aa  155  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4957  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
330 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.083679 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1038  glycosyl transferase family protein  33.07 
 
 
355 aa  153  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.378242  normal  0.03094 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4805  glycosyl transferase family protein  32.81 
 
 
339 aa  146  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4622  glycosyl transferase family protein  32.02 
 
 
355 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0686248 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3564  glycosyl transferase family protein  33.07 
 
 
389 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0228  glycosyl transferase family protein  28.18 
 
 
333 aa  133  3.9999999999999996e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000082788  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05860  glycosyl transferase  32.06 
 
 
351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000181902 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  35.15 
 
 
822 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1959  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 
329 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.465626 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0657  glycosyl transferase family protein  31.33 
 
 
331 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1222  glycosyl transferase family protein  31.39 
 
 
329 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.966529  normal  0.285342 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2563  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 
329 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4523  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 
336 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131272  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0913  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.58 
 
 
341 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000688111  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1661  glycosyl transferase family protein  28.18 
 
 
316 aa  101  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  22.73 
 
 
337 aa  99.4  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  26.35 
 
 
322 aa  86.3  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  28.89 
 
 
477 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  26.95 
 
 
260 aa  78.6  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1291  glycosyl transferase family protein  29.78 
 
 
351 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  28.19 
 
 
428 aa  77  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
352 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 
924 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  29.59 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  31.4 
 
 
752 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  26.35 
 
 
1101 aa  70.5  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1880  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.26 
 
 
336 aa  70.1  0.00000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  25.11 
 
 
403 aa  70.1  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  27.78 
 
 
792 aa  68.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  25.66 
 
 
441 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  25.66 
 
 
441 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  26.84 
 
 
475 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  24.76 
 
 
412 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  25.66 
 
 
441 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2585  glycosyl transferase family 2  39.29 
 
 
264 aa  68.2  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  25.66 
 
 
441 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  28.25 
 
 
421 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  28.45 
 
 
373 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  24.76 
 
 
412 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  26.84 
 
 
475 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  25.66 
 
 
441 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 
410 aa  67.4  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  28.07 
 
 
1099 aa  67  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  28.25 
 
 
421 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  25.35 
 
 
509 aa  67  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1791  b-glycosyltransferase  25.46 
 
 
344 aa  66.6  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1662  glycosyl transferase family protein  27.11 
 
 
345 aa  66.2  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.363785  hitchhiker  0.00433752 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  27.35 
 
 
421 aa  65.9  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0179  N-glycosyltransferase  26.75 
 
 
451 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574055  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2628  glycosyl transferase family protein  27.98 
 
 
350 aa  65.1  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0354  glycosyl transferase family 2  23.17 
 
 
331 aa  65.1  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2217  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 
468 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368513  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7079  putative (ceramide) glucosyltransferase  25.98 
 
 
404 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.806825 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3996  N-glycosyltransferase  26.14 
 
 
423 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.706651  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1462  putative glycosyltransferase  28.34 
 
 
401 aa  63.9  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046931  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3513  N-glycosyltransferase  26.14 
 
 
423 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1844  glycosyl transferase family 2  33.98 
 
 
387 aa  63.9  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  24.35 
 
 
424 aa  63.5  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1781  glycosyl transferase family 2  25.78 
 
 
326 aa  63.2  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.456914  normal  0.601286 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  24.57 
 
 
425 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  24.57 
 
 
425 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  27.18 
 
 
746 aa  62.8  0.000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0802  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 
338 aa  62.8  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  34.58 
 
 
280 aa  62  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7038  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  28.15 
 
 
390 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000681734 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0058  glycosyl transferase family 2  28.78 
 
 
337 aa  62.4  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.246717 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3280  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 
341 aa  62.4  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3874  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 
313 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0495804  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  23.94 
 
 
461 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0752  N-glycosyltransferase  25.76 
 
 
433 aa  61.2  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  30.21 
 
 
334 aa  61.2  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  28.65 
 
 
380 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  30.5 
 
 
327 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  24.7 
 
 
261 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  26.98 
 
 
442 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1078  glycosyl transferase family protein  26.94 
 
 
232 aa  61.2  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892634  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  24.24 
 
 
398 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0218  glycosyl transferase family protein  31.73 
 
 
379 aa  60.8  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2143  N-glycosyltransferase  27.07 
 
 
444 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.382592  normal  0.0135691 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  27.59 
 
 
927 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2200  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  26.77 
 
 
386 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  24.53 
 
 
418 aa  60.5  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2129  N-glycosyltransferase  27.07 
 
 
444 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.772993  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  26.72 
 
 
872 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0647  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 
354 aa  60.5  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2239  N-glycosyltransferase  27.07 
 
 
444 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.423629  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  26.44 
 
 
235 aa  60.5  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>