More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0020 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4129  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  86.01 
 
 
392 aa  659    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0020  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
390 aa  781    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7038  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  97.69 
 
 
390 aa  729    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000681734 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5422  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  82.99 
 
 
395 aa  634  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4875  glycosyl transferase family protein  82.74 
 
 
395 aa  632  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.596859  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4721  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  82.49 
 
 
395 aa  627  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3255  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  82.74 
 
 
395 aa  624  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.630561  normal  0.127154 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5309  glycosyl transferase family protein  81.98 
 
 
395 aa  624  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.286135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5551  glycosyl transferase family protein  81.98 
 
 
395 aa  624  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0107  glycosyl transferase family protein  81.47 
 
 
395 aa  610  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1283  glycosyl transferase, group 2 family protein  79.39 
 
 
396 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0978  glycosyl transferase, group 2 family protein  80.05 
 
 
394 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1265  glycosyl transferase, group 2 family protein  80.05 
 
 
394 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.949141  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3051  glycosyl transferase, group 2 family protein  79.39 
 
 
396 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.074487  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2926  glycosyl transferase, group 2 family protein  80.92 
 
 
396 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.896752  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2239  glycosyl transferase, group 2 family protein  80.05 
 
 
394 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1960  glycosyl transferase, group 2 family protein  80.21 
 
 
389 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2242  glycosyl transferase, group 2 family protein  81.47 
 
 
397 aa  585  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4171  family 2 glycosyl transferase  61.5 
 
 
380 aa  456  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.147106  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4672  glycosyl transferase family protein  48.37 
 
 
399 aa  373  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4598  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  55.29 
 
 
400 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.617719  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4896  glycosyl transferase family protein  59.48 
 
 
382 aa  371  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3050  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  49.74 
 
 
397 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.824313 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4242  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  47.8 
 
 
397 aa  348  9e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4304  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  47.8 
 
 
397 aa  348  9e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1372  glycosyl transferase family protein  45.29 
 
 
397 aa  347  2e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.704698  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0065  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  50.78 
 
 
398 aa  323  2e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1829  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  47.72 
 
 
398 aa  320  3.9999999999999996e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0443  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  49.73 
 
 
382 aa  315  6e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000679717 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0266  glycosyl transferase, group 2 family protein  49.73 
 
 
408 aa  315  8e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1462  putative glycosyltransferase  44.3 
 
 
401 aa  293  5e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046931  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5703  glycosyl transferase family protein  44.72 
 
 
454 aa  270  4e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0459973  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0064  squalene-phytoene synthase  47.18 
 
 
687 aa  268  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0829  glycosyl transferase family protein  43.22 
 
 
535 aa  262  1e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.759846  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0120  glycosyl transferase family protein  45.57 
 
 
375 aa  259  8e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20620  Glycosyl transferase, family 2  40.71 
 
 
368 aa  243  6e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268109  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.36 
 
 
347 aa  238  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1722  glycosyl transferase family protein  39.3 
 
 
430 aa  230  2e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.948662  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1158  glycosyl transferase family protein  32.4 
 
 
403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0386  glycosyl transferase family protein  35.8 
 
 
393 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.737923  normal  0.151625 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0674  glycosyl transferase family 2  31.46 
 
 
382 aa  134  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0774  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 
385 aa  133  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00080815  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0212  glycosyl transferase  30.77 
 
 
382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000843162  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1994  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 
383 aa  129  8.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.713499 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0372  glycosyl transferase family 2  30.46 
 
 
381 aa  127  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0194499  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2222  glycosyl transferase family 2  30.07 
 
 
384 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2211  glycosyl transferase family protein  36.02 
 
 
357 aa  119  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276702  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0242  glycosyl transferase  33.1 
 
 
378 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2168  glycosyl transferase family 2  30.55 
 
 
391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3925  glycosyl transferase family 2  30.86 
 
 
379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0595  glycosyl transferase family protein  25.65 
 
 
402 aa  117  5e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0991  glycosyl transferase family protein  32.18 
 
 
407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.400762  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2356  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 
380 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17181  glycosyl transferase family protein  33.07 
 
 
407 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.793323 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1665  glycosyl transferase family 2  28.8 
 
 
401 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1512  glycosyl transferase family protein  27.89 
 
 
397 aa  107  5e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.342198  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2431  glycosyl transferase family 2  29.97 
 
 
397 aa  106  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2307  glycosyl transferase family protein  38.33 
 
 
360 aa  103  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3292  glycosyl transferase family 2  32.35 
 
 
379 aa  102  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1835  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 
395 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0385  family 2 glycosyl transferase  29.67 
 
 
362 aa  99  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.361045  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3101  glycosyl transferase family 2  27.56 
 
 
396 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3832  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.24 
 
 
413 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.956349  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04191  hypothetical protein  25.7 
 
 
394 aa  93.2  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1491  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 
355 aa  92.4  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000591503 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2509  glycosyl transferase family 2  27.67 
 
 
408 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.790074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1512  glycosyl transferase family protein  31.67 
 
 
396 aa  89.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00217287  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0427  family 2 glycosyl transferase  31.82 
 
 
388 aa  89.4  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0952  glycosyl transferase family 2  32.22 
 
 
377 aa  81.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0167  glycosyl transferase family 2  27.75 
 
 
365 aa  79  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00277804  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3474  glycosyl transferase family protein  27.22 
 
 
375 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288784  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3247  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 
375 aa  77  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14939  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3224  glycosyl transferase family 2  29.23 
 
 
367 aa  77  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.210562  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5029  glycosyl transferase family protein  31.98 
 
 
378 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0141962  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3630  glycosyl transferase family 2  33.01 
 
 
386 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0987324  normal  0.0592371 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2496  glycosyl transferase family 2  30.24 
 
 
378 aa  75.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000682881  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3743  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
386 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178999  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3158  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
364 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0337  glycosyl transferase family 2  24.21 
 
 
349 aa  74.3  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3434  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
386 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.394564 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4949  glycosyl transferase family 2  31 
 
 
385 aa  73.9  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000550956  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1393  glycosyl transferase family protein  28.15 
 
 
395 aa  73.6  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0519554  hitchhiker  0.000418344 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2182  b-glycosyltransferase  27.68 
 
 
379 aa  73.6  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.935401  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0550  glycosyl transferase family protein  27.45 
 
 
391 aa  72  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000102779  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1868  glycosyl transferase family 2  27.25 
 
 
369 aa  72  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1083  glycosyltransferase  30.18 
 
 
458 aa  70.9  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014105 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2547  glycosyl transferase family 2  29.58 
 
 
378 aa  70.5  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0749  glycosyl transferase family protein  32.23 
 
 
410 aa  69.7  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.702214  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0335  glycosyl transferase family 2  24.88 
 
 
346 aa  69.3  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2541  putative glycosyl transferase  27.97 
 
 
341 aa  68.2  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1040  glycosyl transferase family 2  25.25 
 
 
380 aa  66.2  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  28.1 
 
 
450 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2824  glycosyl transferase family 2  25.83 
 
 
375 aa  65.5  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4113  glycosyl transferase family 2  27.63 
 
 
343 aa  60.8  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.902695  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  26.54 
 
 
433 aa  60.5  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  24.35 
 
 
433 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  37.38 
 
 
337 aa  59.3  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  26.15 
 
 
433 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  33.33 
 
 
694 aa  59.3  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0796  glycosyl transferase family 2  31.68 
 
 
410 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.048346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>