More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0952 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0952  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
377 aa  707    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0674  glycosyl transferase family 2  35.89 
 
 
382 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3292  glycosyl transferase family 2  37.76 
 
 
379 aa  129  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1994  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 
383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.713499 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0774  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00080815  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0242  glycosyl transferase  32.46 
 
 
378 aa  117  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0212  glycosyl transferase  28.86 
 
 
382 aa  117  3e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000843162  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0372  glycosyl transferase family 2  29.38 
 
 
381 aa  116  5e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0194499  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0386  glycosyl transferase family protein  34.02 
 
 
393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.737923  normal  0.151625 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2211  glycosyl transferase family protein  37.86 
 
 
357 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276702  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0065  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  34.8 
 
 
398 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2509  glycosyl transferase family 2  33.82 
 
 
408 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.790074 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2431  glycosyl transferase family 2  31.63 
 
 
397 aa  113  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3101  glycosyl transferase family 2  30.8 
 
 
396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2356  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 
380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2222  glycosyl transferase family 2  28.82 
 
 
384 aa  110  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1665  glycosyl transferase family 2  31.52 
 
 
401 aa  110  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1829  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  33.04 
 
 
398 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1158  glycosyl transferase family protein  34.2 
 
 
403 aa  109  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3925  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
379 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0443  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  32.45 
 
 
382 aa  106  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000679717 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0266  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.45 
 
 
408 aa  106  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4171  family 2 glycosyl transferase  34.12 
 
 
380 aa  105  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.147106  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0595  glycosyl transferase family protein  26.8 
 
 
402 aa  105  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5703  glycosyl transferase family protein  35.6 
 
 
454 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0459973  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1393  glycosyl transferase family protein  33.73 
 
 
395 aa  103  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0519554  hitchhiker  0.000418344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5123  glycosyl transferase family protein  34.12 
 
 
441 aa  102  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.0746579 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3434  glycosyl transferase family protein  38.81 
 
 
386 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.394564 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0829  glycosyl transferase family protein  32.36 
 
 
535 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.759846  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3224  glycosyl transferase family 2  38.12 
 
 
367 aa  101  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.210562  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0337  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 
349 aa  100  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3743  glycosyl transferase family 2  39.53 
 
 
386 aa  99.4  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178999  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0335  glycosyl transferase family 2  30.96 
 
 
346 aa  98.6  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04191  hypothetical protein  28.3 
 
 
394 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0167  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
365 aa  98.6  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00277804  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1835  glycosyl transferase family protein  26.57 
 
 
395 aa  97.8  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3832  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.33 
 
 
413 aa  97.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.956349  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0550  glycosyl transferase family protein  29.61 
 
 
391 aa  97.8  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000102779  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0120  glycosyl transferase family protein  37.93 
 
 
375 aa  96.7  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1722  glycosyl transferase family protein  33.98 
 
 
430 aa  96.7  6e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.948662  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0427  family 2 glycosyl transferase  30.6 
 
 
388 aa  95.5  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4672  glycosyl transferase family protein  27.63 
 
 
399 aa  95.5  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20620  Glycosyl transferase, family 2  29.75 
 
 
368 aa  95.5  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268109  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.31 
 
 
347 aa  94.7  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2926  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.62 
 
 
396 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.896752  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1512  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
396 aa  94.4  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00217287  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2168  glycosyl transferase family 2  29.31 
 
 
391 aa  93.6  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5029  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 
378 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0141962  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1462  putative glycosyltransferase  30.71 
 
 
401 aa  92.8  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046931  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2307  glycosyl transferase family protein  31.67 
 
 
360 aa  92.4  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4598  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  28.34 
 
 
400 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.617719  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3247  glycosyl transferase family protein  36.89 
 
 
375 aa  92.4  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14939  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7038  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  31.69 
 
 
390 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000681734 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1283  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.24 
 
 
396 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0978  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.24 
 
 
394 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1265  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.24 
 
 
394 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.949141  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3051  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.24 
 
 
396 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.074487  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2239  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.24 
 
 
394 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1960  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.24 
 
 
389 aa  91.3  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3474  glycosyl transferase family protein  35.04 
 
 
375 aa  91.3  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288784  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1372  glycosyl transferase family protein  30.32 
 
 
397 aa  90.9  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.704698  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5309  glycosyl transferase family protein  31.92 
 
 
395 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.286135  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4129  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  31.88 
 
 
392 aa  90.1  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5551  glycosyl transferase family protein  31.92 
 
 
395 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4721  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  31.92 
 
 
395 aa  90.1  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17181  glycosyl transferase family protein  28.79 
 
 
407 aa  90.1  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.793323 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3255  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  31.64 
 
 
395 aa  88.2  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.630561  normal  0.127154 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1868  glycosyl transferase family 2  27.56 
 
 
369 aa  88.2  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0991  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 
407 aa  87.4  4e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.400762  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0107  glycosyl transferase family protein  31.71 
 
 
395 aa  86.7  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4875  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 
395 aa  86.7  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.596859  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1491  glycosyl transferase family 2  32.43 
 
 
355 aa  86.7  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000591503 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3158  glycosyl transferase family protein  33.57 
 
 
364 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3630  glycosyl transferase family 2  36.11 
 
 
386 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0987324  normal  0.0592371 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5422  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  31.36 
 
 
395 aa  86.3  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4949  glycosyl transferase family 2  34.23 
 
 
385 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000550956  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1512  glycosyl transferase family protein  30.93 
 
 
397 aa  84.7  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.342198  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4896  glycosyl transferase family protein  30.86 
 
 
382 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0020  glycosyl transferase family protein  31.1 
 
 
390 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4242  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  28.96 
 
 
397 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4304  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  28.96 
 
 
397 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2242  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.82 
 
 
397 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0385  family 2 glycosyl transferase  33.33 
 
 
362 aa  82  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.361045  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0941  glycosyl transferase family 2  38.21 
 
 
376 aa  79.7  0.00000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4032  putative glycosyl transferase  30.95 
 
 
344 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0315657  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3987  putative glycosyl transferase  30.95 
 
 
344 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3050  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  30.58 
 
 
397 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.824313 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2547  glycosyl transferase family 2  31.21 
 
 
378 aa  78.2  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0749  glycosyl transferase family protein  37.8 
 
 
410 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.702214  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3925  putative glycosyl transferase  35.07 
 
 
344 aa  76.3  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2371  glycosyltransferase  25.5 
 
 
326 aa  76.3  0.0000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3906  putative glycosyl transferase  34.33 
 
 
344 aa  76.3  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66206  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  34.52 
 
 
1118 aa  75.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5165  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  38.84 
 
 
1168 aa  75.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4093  putative glycosyl transferase  30.48 
 
 
344 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  42.73 
 
 
785 aa  74.7  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  29.27 
 
 
325 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  40.19 
 
 
397 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  33.03 
 
 
403 aa  73.9  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  32.54 
 
 
398 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>