More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1393 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1393  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
395 aa  752    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0519554  hitchhiker  0.000418344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5123  glycosyl transferase family protein  70.25 
 
 
441 aa  440  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.0746579 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4949  glycosyl transferase family 2  59.43 
 
 
385 aa  340  2e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000550956  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3224  glycosyl transferase family 2  59.51 
 
 
367 aa  330  3e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.210562  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2547  glycosyl transferase family 2  54.89 
 
 
378 aa  323  3e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3292  glycosyl transferase family 2  56.41 
 
 
379 aa  322  8e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3474  glycosyl transferase family protein  52.07 
 
 
375 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288784  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3247  glycosyl transferase family protein  52.75 
 
 
375 aa  294  2e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14939  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0372  glycosyl transferase family 2  33.63 
 
 
381 aa  177  3e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0194499  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0242  glycosyl transferase  34.39 
 
 
378 aa  171  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1491  glycosyl transferase family 2  39.23 
 
 
355 aa  170  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000591503 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0212  glycosyl transferase  32.34 
 
 
382 aa  169  8e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000843162  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1994  glycosyl transferase family 2  34.38 
 
 
383 aa  166  5.9999999999999996e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.713499 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3434  glycosyl transferase family protein  41.53 
 
 
386 aa  160  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.394564 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2356  glycosyl transferase family protein  32.44 
 
 
380 aa  159  7e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3925  glycosyl transferase family 2  32.12 
 
 
379 aa  158  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3743  glycosyl transferase family 2  40.89 
 
 
386 aa  155  8e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178999  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3158  glycosyl transferase family protein  39.43 
 
 
364 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2222  glycosyl transferase family 2  34.12 
 
 
384 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2168  glycosyl transferase family 2  36.93 
 
 
391 aa  151  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2824  glycosyl transferase family 2  35.63 
 
 
375 aa  144  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2307  glycosyl transferase family protein  42.62 
 
 
360 aa  142  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0674  glycosyl transferase family 2  37.77 
 
 
382 aa  139  8.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0385  family 2 glycosyl transferase  38.27 
 
 
362 aa  137  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.361045  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3630  glycosyl transferase family 2  37.9 
 
 
386 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0987324  normal  0.0592371 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5029  glycosyl transferase family protein  38.1 
 
 
378 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0141962  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2211  glycosyl transferase family protein  36.67 
 
 
357 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276702  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0595  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 
402 aa  125  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0774  glycosyl transferase family protein  34.69 
 
 
385 aa  122  8e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00080815  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2431  glycosyl transferase family 2  33.21 
 
 
397 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2496  glycosyl transferase family 2  35.47 
 
 
378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000682881  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1512  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 
397 aa  114  3e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.342198  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17181  glycosyl transferase family protein  30.22 
 
 
407 aa  112  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.793323 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0386  glycosyl transferase family protein  34.85 
 
 
393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.737923  normal  0.151625 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0120  glycosyl transferase family protein  36.62 
 
 
375 aa  108  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1158  glycosyl transferase family protein  34.89 
 
 
403 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1868  glycosyl transferase family 2  32.2 
 
 
369 aa  106  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04191  hypothetical protein  26.02 
 
 
394 aa  106  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0550  glycosyl transferase family protein  27.46 
 
 
391 aa  104  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000102779  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0337  glycosyl transferase family 2  25.89 
 
 
349 aa  101  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0952  glycosyl transferase family 2  33.24 
 
 
377 aa  99.8  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1829  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  34.62 
 
 
398 aa  97.8  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1574  glycosyl transferase family 2  34.15 
 
 
315 aa  96.7  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1665  glycosyl transferase family 2  27.53 
 
 
401 aa  96.3  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0335  glycosyl transferase family 2  24.17 
 
 
346 aa  96.3  9e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5703  glycosyl transferase family protein  36.73 
 
 
454 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0459973  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0991  glycosyl transferase family protein  30.54 
 
 
407 aa  94  4e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.400762  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0829  glycosyl transferase family protein  34.01 
 
 
535 aa  93.2  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.759846  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0167  glycosyl transferase family 2  25.51 
 
 
365 aa  92.8  9e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00277804  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1462  putative glycosyltransferase  31.88 
 
 
401 aa  92.4  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046931  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0065  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  33.45 
 
 
398 aa  91.7  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2509  glycosyl transferase family 2  28.37 
 
 
408 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.790074 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0749  glycosyl transferase family protein  35.89 
 
 
410 aa  90.1  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.702214  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4896  glycosyl transferase family protein  31.14 
 
 
382 aa  88.6  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20620  Glycosyl transferase, family 2  27.81 
 
 
368 aa  87.4  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268109  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0266  glycosyl transferase, group 2 family protein  35 
 
 
408 aa  87.4  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1835  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 
395 aa  87  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0443  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  35 
 
 
382 aa  86.7  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000679717 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.88 
 
 
347 aa  85.9  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4598  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  30.53 
 
 
400 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.617719  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5309  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
395 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.286135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5551  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
395 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1722  glycosyl transferase family protein  35.53 
 
 
430 aa  84  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.948662  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3832  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.54 
 
 
413 aa  84  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.956349  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2585  glycosyl transferase family protein  24.78 
 
 
375 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4721  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  29.67 
 
 
395 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4171  family 2 glycosyl transferase  30.9 
 
 
380 aa  82.8  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.147106  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2639  glycosyl transferase family protein  24.78 
 
 
375 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5026  glycosyl transferase family protein  38.98 
 
 
485 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4643  glycosyl transferase family protein  39.47 
 
 
485 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4731  glycosyl transferase family protein  39.47 
 
 
485 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4875  glycosyl transferase family protein  29.04 
 
 
395 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.596859  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4129  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  29.64 
 
 
392 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0107  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 
395 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0796  glycosyl transferase family 2  35.21 
 
 
410 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.048346  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1372  glycosyl transferase family protein  25.36 
 
 
397 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.704698  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5422  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  29.04 
 
 
395 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3255  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  30.15 
 
 
395 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.630561  normal  0.127154 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0800  glycosyl transferase family 2  34.08 
 
 
410 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7038  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  27.35 
 
 
390 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000681734 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4304  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  27.1 
 
 
397 aa  76.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4242  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  27.1 
 
 
397 aa  76.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1960  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.78 
 
 
389 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3101  glycosyl transferase family 2  27.87 
 
 
396 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2926  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.78 
 
 
396 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.896752  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4672  glycosyl transferase family protein  27.03 
 
 
399 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0978  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.78 
 
 
394 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1265  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.78 
 
 
394 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.949141  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2239  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.78 
 
 
394 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1040  glycosyl transferase family 2  28.03 
 
 
380 aa  74.3  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1283  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.64 
 
 
396 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3051  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.64 
 
 
396 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.074487  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3050  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  24.69 
 
 
397 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.824313 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 
350 aa  69.3  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0745  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosphotransferase  35.9 
 
 
1169 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0402  glycosyl transferase family 2  25.87 
 
 
359 aa  69.3  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.20489 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2932  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  37.8 
 
 
264 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000763611  hitchhiker  0.000488065 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2242  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.62 
 
 
397 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0020  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 
390 aa  67  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0941  glycosyl transferase family 2  36.23 
 
 
376 aa  66.2  0.0000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>