More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1868 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1868  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
369 aa  718    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0372  glycosyl transferase family 2  31.23 
 
 
381 aa  145  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0194499  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0242  glycosyl transferase  34.02 
 
 
378 aa  143  6e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5123  glycosyl transferase family protein  34.08 
 
 
441 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.0746579 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0674  glycosyl transferase family 2  38.59 
 
 
382 aa  129  9.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0212  glycosyl transferase  35.71 
 
 
382 aa  126  8.000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000843162  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3925  glycosyl transferase family 2  31.67 
 
 
379 aa  120  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1994  glycosyl transferase family 2  28.88 
 
 
383 aa  120  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.713499 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3434  glycosyl transferase family protein  31.44 
 
 
386 aa  120  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.394564 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1491  glycosyl transferase family 2  34.66 
 
 
355 aa  119  6e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000591503 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3158  glycosyl transferase family protein  36.39 
 
 
364 aa  119  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3743  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
386 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178999  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2356  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 
380 aa  116  7.999999999999999e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2222  glycosyl transferase family 2  32.13 
 
 
384 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2168  glycosyl transferase family 2  30.46 
 
 
391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3292  glycosyl transferase family 2  32.39 
 
 
379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5029  glycosyl transferase family protein  34.19 
 
 
378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0141962  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1158  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 
403 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0335  glycosyl transferase family 2  27.22 
 
 
346 aa  109  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1393  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 
395 aa  109  7.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0519554  hitchhiker  0.000418344 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2824  glycosyl transferase family 2  29.6 
 
 
375 aa  107  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0337  glycosyl transferase family 2  29.68 
 
 
349 aa  107  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3247  glycosyl transferase family protein  31.53 
 
 
375 aa  106  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14939  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1665  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
401 aa  105  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3630  glycosyl transferase family 2  30.19 
 
 
386 aa  105  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0987324  normal  0.0592371 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0386  glycosyl transferase family protein  32.96 
 
 
393 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.737923  normal  0.151625 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3224  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 
367 aa  103  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.210562  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0774  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 
385 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00080815  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1835  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 
395 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1372  glycosyl transferase family protein  24.68 
 
 
397 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.704698  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0385  family 2 glycosyl transferase  32.84 
 
 
362 aa  99.8  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.361045  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3474  glycosyl transferase family protein  30.51 
 
 
375 aa  98.2  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288784  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2211  glycosyl transferase family protein  31.91 
 
 
357 aa  98.2  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276702  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2307  glycosyl transferase family protein  34.76 
 
 
360 aa  97.8  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0550  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 
391 aa  97.8  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000102779  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0595  glycosyl transferase family protein  26.91 
 
 
402 aa  94  4e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4598  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  29.16 
 
 
400 aa  92.8  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.617719  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0952  glycosyl transferase family 2  27.67 
 
 
377 aa  90.9  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0167  glycosyl transferase family 2  27.65 
 
 
365 aa  90.1  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00277804  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20620  Glycosyl transferase, family 2  29.63 
 
 
368 aa  87.8  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268109  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1829  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  27.87 
 
 
398 aa  86.7  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2431  glycosyl transferase family 2  29.6 
 
 
397 aa  86.7  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4129  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  28.02 
 
 
392 aa  86.7  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0991  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
407 aa  85.5  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.400762  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4949  glycosyl transferase family 2  30.94 
 
 
385 aa  85.5  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000550956  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0065  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  30.31 
 
 
398 aa  85.9  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1462  putative glycosyltransferase  29.49 
 
 
401 aa  84.7  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046931  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0829  glycosyl transferase family protein  29.34 
 
 
535 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.759846  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5309  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 
395 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.286135  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4721  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  28.03 
 
 
395 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5551  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 
395 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1512  glycosyl transferase family protein  32.49 
 
 
397 aa  80.1  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.342198  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0020  glycosyl transferase family protein  27.72 
 
 
390 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0107  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
395 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5422  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  27.78 
 
 
395 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4875  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
395 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.596859  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7038  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  28.16 
 
 
390 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000681734 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17181  glycosyl transferase family protein  26.75 
 
 
407 aa  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.793323 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3255  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  27.41 
 
 
395 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.630561  normal  0.127154 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3050  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  26.98 
 
 
397 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.824313 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4672  glycosyl transferase family protein  26.25 
 
 
399 aa  77  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0427  family 2 glycosyl transferase  29.27 
 
 
388 aa  77  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0749  glycosyl transferase family protein  31.06 
 
 
410 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.702214  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2639  glycosyl transferase family protein  37.84 
 
 
375 aa  74.3  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2547  glycosyl transferase family 2  28.73 
 
 
378 aa  74.7  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2585  glycosyl transferase family protein  37.84 
 
 
375 aa  74.3  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0443  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  30.37 
 
 
382 aa  74.3  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000679717 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  37.5 
 
 
461 aa  73.6  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0266  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.6 
 
 
408 aa  73.6  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3101  glycosyl transferase family 2  27.09 
 
 
396 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2509  glycosyl transferase family 2  28.06 
 
 
408 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.790074 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0221  glycosyl transferase family protein  29.84 
 
 
368 aa  71.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3254  glycosyl transferase family protein  38.02 
 
 
359 aa  70.5  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.415197  normal  0.277345 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04191  hypothetical protein  22.68 
 
 
394 aa  70.5  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2008  glycosyl transferase family protein  35.38 
 
 
379 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1512  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 
396 aa  69.7  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00217287  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  38.69 
 
 
410 aa  69.3  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  31.54 
 
 
418 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2749  glycosyl transferase family protein  34.34 
 
 
502 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924892  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1722  glycosyl transferase family protein  28.65 
 
 
430 aa  68.2  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.948662  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  30.72 
 
 
475 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4242  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  25.79 
 
 
397 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  30.72 
 
 
475 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  39.13 
 
 
445 aa  67.4  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4304  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  25.79 
 
 
397 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0245  glycosyl transferase family 2  31.62 
 
 
380 aa  67.8  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1890  glycosyl transferase family protein  38.84 
 
 
443 aa  67.4  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0120  glycosyl transferase family protein  40.43 
 
 
375 aa  67.4  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  41.44 
 
 
1101 aa  66.6  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  31.32 
 
 
422 aa  66.6  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2238  glycosyl transferase family 2  35.21 
 
 
374 aa  66.6  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 
450 aa  66.6  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5703  glycosyl transferase family protein  26.6 
 
 
454 aa  66.2  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0459973  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.66 
 
 
347 aa  66.2  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4171  family 2 glycosyl transferase  25.94 
 
 
380 aa  66.2  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.147106  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  40.43 
 
 
299 aa  65.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07871  hypothetical protein  31.51 
 
 
364 aa  65.5  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3583  glycosyl transferase family protein  34.39 
 
 
395 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18491  glycosyl transferase family protein  37.39 
 
 
433 aa  64.3  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.249822  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18491  glycosyl transferase family protein  31.33 
 
 
433 aa  63.5  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.468741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>