More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0386 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0386  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
393 aa  789    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.737923  normal  0.151625 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1158  glycosyl transferase family protein  81.93 
 
 
403 aa  623  1e-177  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0774  glycosyl transferase family protein  40.21 
 
 
385 aa  259  5.0000000000000005e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00080815  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0674  glycosyl transferase family 2  42.73 
 
 
382 aa  256  4e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2356  glycosyl transferase family protein  34.68 
 
 
380 aa  182  7e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1994  glycosyl transferase family 2  35.8 
 
 
383 aa  181  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.713499 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0372  glycosyl transferase family 2  33.52 
 
 
381 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0194499  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2168  glycosyl transferase family 2  36.41 
 
 
391 aa  179  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2211  glycosyl transferase family protein  40.43 
 
 
357 aa  173  5e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276702  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0212  glycosyl transferase  34.08 
 
 
382 aa  169  8e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000843162  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20620  Glycosyl transferase, family 2  33.61 
 
 
368 aa  168  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268109  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0595  glycosyl transferase family protein  28.53 
 
 
402 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0242  glycosyl transferase  34.49 
 
 
378 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0991  glycosyl transferase family protein  33.15 
 
 
407 aa  163  5.0000000000000005e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.400762  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1829  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  33.33 
 
 
398 aa  163  6e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2222  glycosyl transferase family 2  33.52 
 
 
384 aa  157  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04191  hypothetical protein  27.04 
 
 
394 aa  156  7e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1512  glycosyl transferase family protein  33.24 
 
 
397 aa  155  8e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.342198  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0550  glycosyl transferase family protein  35.86 
 
 
391 aa  153  5e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000102779  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0443  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  33.16 
 
 
382 aa  149  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000679717 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0266  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 
408 aa  149  8e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1491  glycosyl transferase family 2  34.94 
 
 
355 aa  149  9e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000591503 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17181  glycosyl transferase family protein  31.71 
 
 
407 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.793323 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1665  glycosyl transferase family 2  31.64 
 
 
401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4171  family 2 glycosyl transferase  30.93 
 
 
380 aa  144  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.147106  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0065  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  32.43 
 
 
398 aa  143  6e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2509  glycosyl transferase family 2  36.13 
 
 
408 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.790074 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4896  glycosyl transferase family protein  34.98 
 
 
382 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3247  glycosyl transferase family protein  40.08 
 
 
375 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14939  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2307  glycosyl transferase family protein  40.4 
 
 
360 aa  137  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3474  glycosyl transferase family protein  39.24 
 
 
375 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288784  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0829  glycosyl transferase family protein  33.16 
 
 
535 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.759846  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0335  glycosyl transferase family 2  33.2 
 
 
346 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3255  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  31.75 
 
 
395 aa  137  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.630561  normal  0.127154 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3101  glycosyl transferase family 2  34.71 
 
 
396 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2926  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.86 
 
 
396 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.896752  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.29 
 
 
347 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4129  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  30.49 
 
 
392 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1512  glycosyl transferase family protein  36.2 
 
 
396 aa  135  8e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00217287  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4598  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  31.49 
 
 
400 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.617719  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3925  glycosyl transferase family 2  30.03 
 
 
379 aa  135  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1283  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.14 
 
 
396 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0385  family 2 glycosyl transferase  37.61 
 
 
362 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.361045  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0427  family 2 glycosyl transferase  36.2 
 
 
388 aa  134  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1265  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.14 
 
 
394 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.949141  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0337  glycosyl transferase family 2  32 
 
 
349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3051  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.14 
 
 
396 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.074487  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2239  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.14 
 
 
394 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0978  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.14 
 
 
394 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1960  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.14 
 
 
389 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7038  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  33.06 
 
 
390 aa  133  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000681734 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0120  glycosyl transferase family protein  32.3 
 
 
375 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4672  glycosyl transferase family protein  27.12 
 
 
399 aa  129  7.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5309  glycosyl transferase family protein  32.49 
 
 
395 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.286135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5551  glycosyl transferase family protein  32.49 
 
 
395 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3050  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  35.44 
 
 
397 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.824313 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3292  glycosyl transferase family 2  39.15 
 
 
379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5422  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  31.93 
 
 
395 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4721  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  32.21 
 
 
395 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4875  glycosyl transferase family protein  31.93 
 
 
395 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.596859  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0107  glycosyl transferase family protein  30.32 
 
 
395 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1372  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 
397 aa  126  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.704698  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1835  glycosyl transferase family protein  28.53 
 
 
395 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4242  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  29.56 
 
 
397 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4304  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  29.56 
 
 
397 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0020  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 
390 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3224  glycosyl transferase family 2  38.7 
 
 
367 aa  124  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.210562  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1722  glycosyl transferase family protein  28.91 
 
 
430 aa  123  4e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.948662  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2242  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.55 
 
 
397 aa  122  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0167  glycosyl transferase family 2  27.62 
 
 
365 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00277804  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2431  glycosyl transferase family 2  27.11 
 
 
397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5029  glycosyl transferase family protein  37.29 
 
 
378 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0141962  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2547  glycosyl transferase family 2  31.37 
 
 
378 aa  120  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5703  glycosyl transferase family protein  33.99 
 
 
454 aa  120  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0459973  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3743  glycosyl transferase family 2  35.51 
 
 
386 aa  120  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178999  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1462  putative glycosyltransferase  33.63 
 
 
401 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046931  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3434  glycosyl transferase family protein  35.1 
 
 
386 aa  117  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.394564 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3630  glycosyl transferase family 2  33.76 
 
 
386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0987324  normal  0.0592371 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4949  glycosyl transferase family 2  39 
 
 
385 aa  111  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000550956  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3832  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.11 
 
 
413 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.956349  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2824  glycosyl transferase family 2  34.47 
 
 
375 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0952  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
377 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3158  glycosyl transferase family protein  35.34 
 
 
364 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2496  glycosyl transferase family 2  33.81 
 
 
378 aa  103  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000682881  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1393  glycosyl transferase family protein  35.32 
 
 
395 aa  102  9e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0519554  hitchhiker  0.000418344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5123  glycosyl transferase family protein  35.8 
 
 
441 aa  100  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.0746579 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1868  glycosyl transferase family 2  32.17 
 
 
369 aa  99.8  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0064  squalene-phytoene synthase  43.28 
 
 
687 aa  99  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2585  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 
375 aa  93.2  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0749  glycosyl transferase family protein  32.52 
 
 
410 aa  93.2  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.702214  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2639  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 
375 aa  93.2  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0800  glycosyl transferase family 2  32 
 
 
410 aa  80.5  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0796  glycosyl transferase family 2  31.56 
 
 
410 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.048346  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2236  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 
343 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1377  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
323 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0520964  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  27.54 
 
 
2401 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0487  glycosyl transferase family protein  25.33 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1005  glycosyl transferase family protein  34.96 
 
 
344 aa  70.1  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0221  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 
368 aa  69.7  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02661  glycosyltransferase  41.49 
 
 
248 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>