More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0487 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0487  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
284 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2580  glycosyl transferase family 2  38.43 
 
 
277 aa  155  8e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000593359  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  31.43 
 
 
328 aa  102  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  30.71 
 
 
315 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  34.76 
 
 
333 aa  97.1  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0353  glycosyl transferase family 2  29.1 
 
 
312 aa  94  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000439981  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4464  glycosyl transferase family 2  30.93 
 
 
335 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1427  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.15 
 
 
338 aa  87  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2467  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 
322 aa  85.9  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0219  glycosyl transferase family protein  32.98 
 
 
247 aa  85.1  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1525  glycosyl transferase family protein  34.16 
 
 
240 aa  85.5  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201491  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1549  glycosyl transferase family protein  34.16 
 
 
240 aa  83.2  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0584416  normal  0.851188 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  29.86 
 
 
581 aa  82.4  0.000000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1366  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 
247 aa  82  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0947  glycosyl transferase family 2  34.32 
 
 
227 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  33.7 
 
 
260 aa  81.6  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2355  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
232 aa  80.5  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  28.69 
 
 
233 aa  79.7  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  28.12 
 
 
345 aa  79.7  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  25.43 
 
 
1156 aa  79  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0760  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 
303 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2333  glycosyl transferase family protein  30.19 
 
 
327 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.012677  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  30.48 
 
 
311 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  29.05 
 
 
308 aa  77.8  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1158  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
403 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05340  Glycosyl transferase, family 2  26.91 
 
 
321 aa  77.4  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000520172  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1260  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 
309 aa  77  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.736334  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  26.99 
 
 
477 aa  77  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  31.41 
 
 
374 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  32.68 
 
 
326 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2451  glycosyl transferase family 2  32.57 
 
 
222 aa  76.3  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  32.68 
 
 
326 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3348  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
315 aa  76.3  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  31.09 
 
 
268 aa  76.3  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
311 aa  76.3  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  32.68 
 
 
326 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08321  glycosyl transferase family protein  27.92 
 
 
305 aa  75.9  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.389273  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  28 
 
 
672 aa  75.1  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  27.57 
 
 
689 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  30.46 
 
 
390 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  26.69 
 
 
1015 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  33.12 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3745  glycosyl transferase family 2  34.05 
 
 
226 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0914  glycosyl transferase family 2  30.29 
 
 
435 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.262835  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07275  glycosyl transferase  33.33 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.170431  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  31.65 
 
 
326 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1307  glycosyl transferase family protein  37.93 
 
 
335 aa  73.2  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2652  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 
290 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1813  glycosyl transferase family protein  26.75 
 
 
362 aa  73.2  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08131  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1461  glycosyl transferase family 2  27.41 
 
 
239 aa  72.8  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 
1177 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 
1177 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  25 
 
 
337 aa  72.4  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0335  glycosyl transferase family 2  47.19 
 
 
346 aa  72.4  0.000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1536  glycosyl transferase family 2  28.72 
 
 
238 aa  72.4  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0337  glycosyl transferase family 2  47.19 
 
 
349 aa  72.4  0.000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  31.32 
 
 
289 aa  72.4  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1256  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
291 aa  72  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.114174  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1040  glycosyl transferase family 2  32.28 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.852746  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1465  cell wall membrane glycosyltransferase  34.48 
 
 
391 aa  71.6  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0304  glycosyl transferase family protein  31.38 
 
 
458 aa  72  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3221  glycosyl transferase family protein  26.46 
 
 
238 aa  71.6  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 
289 aa  71.6  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1428  hypothetical protein  37.72 
 
 
346 aa  72  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.166911  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1078  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 
232 aa  72  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892634  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  28.51 
 
 
316 aa  71.2  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  30.46 
 
 
313 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2211  glycosyl transferase family protein  40.29 
 
 
357 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276702  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2592  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.232443 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05920  glycosyl transferase  29.51 
 
 
325 aa  71.2  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.829224  hitchhiker  0.0000012927 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  31.37 
 
 
326 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  28.8 
 
 
479 aa  70.5  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2388  glycosyl transferase family protein  37.61 
 
 
1007 aa  70.5  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257411  hitchhiker  0.0000141924 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1173  hypothetical protein  30.17 
 
 
422 aa  70.5  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4911  family 2 glycosyl transferase  27.54 
 
 
316 aa  70.5  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  28.95 
 
 
233 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08121  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 
303 aa  70.5  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0386  glycosyl transferase family protein  31.65 
 
 
393 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.737923  normal  0.151625 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5438  N-acetylglucosaminyltransferase  31.62 
 
 
353 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2017  glycosyl transferase family protein  27.49 
 
 
322 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  40 
 
 
312 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1165  glycosyl transferase CpsO(V)  34.75 
 
 
327 aa  69.7  0.00000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0353426  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.22 
 
 
327 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2081  glycosyl transferase family 2  32.6 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.15987 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3185  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
266 aa  69.7  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0269954  hitchhiker  0.00391718 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05661  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  28.89 
 
 
236 aa  69.7  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.287128  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  42.22 
 
 
327 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 
746 aa  69.3  0.00000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.22 
 
 
327 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  42.22 
 
 
327 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.22 
 
 
327 aa  69.3  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.15 
 
 
310 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  42.22 
 
 
327 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 
230 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.22 
 
 
327 aa  69.3  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2811  glycosyl transferase family 2  27.41 
 
 
307 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.104457 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1201  glycosyl transferase family protein  29.89 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3227  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
339 aa  69.3  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000210219  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  30.98 
 
 
302 aa  68.9  0.00000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>