More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3925 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3925  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
379 aa  768    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3434  glycosyl transferase family protein  43.65 
 
 
386 aa  281  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.394564 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3743  glycosyl transferase family 2  43.87 
 
 
386 aa  278  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178999  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5029  glycosyl transferase family protein  46.25 
 
 
378 aa  268  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0141962  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3630  glycosyl transferase family 2  44.58 
 
 
386 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0987324  normal  0.0592371 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3158  glycosyl transferase family protein  41.23 
 
 
364 aa  246  6e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1994  glycosyl transferase family 2  33.89 
 
 
383 aa  203  5e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.713499 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0212  glycosyl transferase  35.14 
 
 
382 aa  199  9e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000843162  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0372  glycosyl transferase family 2  32.17 
 
 
381 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0194499  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0242  glycosyl transferase  41.35 
 
 
378 aa  186  7e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2222  glycosyl transferase family 2  35.69 
 
 
384 aa  185  9e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2168  glycosyl transferase family 2  34.21 
 
 
391 aa  178  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3474  glycosyl transferase family protein  32.98 
 
 
375 aa  170  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288784  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2356  glycosyl transferase family protein  32.09 
 
 
380 aa  169  9e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3247  glycosyl transferase family protein  36.04 
 
 
375 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14939  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3224  glycosyl transferase family 2  41.18 
 
 
367 aa  160  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.210562  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0774  glycosyl transferase family protein  31.56 
 
 
385 aa  158  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00080815  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0674  glycosyl transferase family 2  32.28 
 
 
382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3292  glycosyl transferase family 2  33.72 
 
 
379 aa  153  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1393  glycosyl transferase family protein  32.12 
 
 
395 aa  150  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0519554  hitchhiker  0.000418344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5123  glycosyl transferase family protein  35.63 
 
 
441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.0746579 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2211  glycosyl transferase family protein  36.5 
 
 
357 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276702  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4949  glycosyl transferase family 2  33.43 
 
 
385 aa  146  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000550956  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1158  glycosyl transferase family protein  35.97 
 
 
403 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2547  glycosyl transferase family 2  30.5 
 
 
378 aa  143  5e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1665  glycosyl transferase family 2  32.69 
 
 
401 aa  140  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0385  family 2 glycosyl transferase  38.63 
 
 
362 aa  140  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.361045  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2824  glycosyl transferase family 2  35.08 
 
 
375 aa  138  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0386  glycosyl transferase family protein  34.25 
 
 
393 aa  134  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.737923  normal  0.151625 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1491  glycosyl transferase family 2  31.94 
 
 
355 aa  133  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000591503 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0550  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 
391 aa  122  9.999999999999999e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000102779  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0167  glycosyl transferase family 2  31.01 
 
 
365 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00277804  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20620  Glycosyl transferase, family 2  29.5 
 
 
368 aa  119  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268109  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2431  glycosyl transferase family 2  29.26 
 
 
397 aa  115  8.999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2307  glycosyl transferase family protein  37.61 
 
 
360 aa  115  8.999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1372  glycosyl transferase family protein  28.34 
 
 
397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.704698  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0595  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 
402 aa  113  6e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7038  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  31.14 
 
 
390 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000681734 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1868  glycosyl transferase family 2  31.67 
 
 
369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0020  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 
390 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0120  glycosyl transferase family protein  28.94 
 
 
375 aa  108  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5309  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 
395 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.286135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5551  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 
395 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2926  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.01 
 
 
396 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.896752  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4875  glycosyl transferase family protein  30.86 
 
 
395 aa  106  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.596859  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5422  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  30.86 
 
 
395 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4129  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  31.25 
 
 
392 aa  106  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3255  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  30.57 
 
 
395 aa  105  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.630561  normal  0.127154 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1283  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.2 
 
 
396 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4721  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  30.57 
 
 
395 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2239  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.2 
 
 
394 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0978  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.2 
 
 
394 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1265  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.2 
 
 
394 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.949141  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3051  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.2 
 
 
396 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.074487  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0337  glycosyl transferase family 2  25.63 
 
 
349 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1960  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.2 
 
 
389 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0107  glycosyl transferase family protein  29.71 
 
 
395 aa  105  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1835  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 
395 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0952  glycosyl transferase family 2  31 
 
 
377 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0991  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 
407 aa  100  3e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.400762  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0443  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  29.19 
 
 
382 aa  100  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000679717 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0266  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.19 
 
 
408 aa  100  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1512  glycosyl transferase family protein  32.97 
 
 
396 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00217287  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1462  putative glycosyltransferase  33.8 
 
 
401 aa  99.4  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046931  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2242  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.2 
 
 
397 aa  99  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4598  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  29.68 
 
 
400 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.617719  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04191  hypothetical protein  24.94 
 
 
394 aa  97.1  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4672  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 
399 aa  95.5  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1512  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 
397 aa  94.7  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.342198  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3050  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  27.54 
 
 
397 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.824313 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17181  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 
407 aa  93.6  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.793323 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2585  glycosyl transferase family protein  25.14 
 
 
375 aa  93.2  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2639  glycosyl transferase family protein  25.14 
 
 
375 aa  93.2  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3101  glycosyl transferase family 2  28.83 
 
 
396 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.08 
 
 
347 aa  92  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2509  glycosyl transferase family 2  30.51 
 
 
408 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.790074 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0335  glycosyl transferase family 2  23.68 
 
 
346 aa  91.7  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0427  family 2 glycosyl transferase  32.61 
 
 
388 aa  91.3  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1829  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  26.44 
 
 
398 aa  90.9  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4242  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  26.05 
 
 
397 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4171  family 2 glycosyl transferase  28.35 
 
 
380 aa  90.1  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.147106  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4304  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  26.05 
 
 
397 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0749  glycosyl transferase family protein  29.24 
 
 
410 aa  89.4  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.702214  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0829  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 
535 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.759846  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2496  glycosyl transferase family 2  36.09 
 
 
378 aa  87.8  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000682881  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0065  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  30.33 
 
 
398 aa  86.7  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0800  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 
410 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1574  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 
315 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0796  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 
410 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.048346  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4896  glycosyl transferase family protein  28.36 
 
 
382 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  40 
 
 
330 aa  74.3  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2236  glycosyl transferase family 2  31.71 
 
 
343 aa  72.8  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3832  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.82 
 
 
413 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.956349  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5703  glycosyl transferase family protein  25.85 
 
 
454 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0459973  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0221  glycosyl transferase family protein  32.98 
 
 
368 aa  69.7  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  35.38 
 
 
1118 aa  69.3  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0179  N-glycosyltransferase  31.36 
 
 
451 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574055  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  33.85 
 
 
872 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3023  glycosyl transferase family 2  32.48 
 
 
323 aa  67.8  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3521  glycosyl transferase family protein  28.93 
 
 
479 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>