More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1196 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1196  b-glycosyltransferase  100 
 
 
349 aa  721    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.959593  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4080  glycosyl transferase family 2  39.05 
 
 
401 aa  218  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.606735  normal  0.10978 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0221  glycosyl transferase family protein  37.72 
 
 
368 aa  211  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3358  glycosyl transferase family 2  44.44 
 
 
389 aa  208  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0515299  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1431  glycosyl transferase family 2  37.31 
 
 
376 aa  206  5e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.679301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6919  glycosyl transferase family 2  37.93 
 
 
408 aa  195  9e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07871  hypothetical protein  40.25 
 
 
364 aa  178  1e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0402  glycosyl transferase family 2  26.97 
 
 
359 aa  109  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.20489 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2238  glycosyl transferase family 2  26.13 
 
 
374 aa  96.3  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1040  glycosyl transferase family 2  26.38 
 
 
380 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1379  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 
367 aa  91.3  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.500878  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2026  glycosyl transferase family 2  25.75 
 
 
384 aa  87.8  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04930  putative transmembrane glycosyltransferase  32.64 
 
 
371 aa  83.6  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.74238  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2182  b-glycosyltransferase  24.52 
 
 
379 aa  74.7  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.935401  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2431  glycosyl transferase family 2  28.14 
 
 
397 aa  73.9  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2222  glycosyl transferase family 2  28.42 
 
 
384 aa  70.1  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1994  glycosyl transferase family 2  31.06 
 
 
383 aa  68.9  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.713499 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2168  glycosyl transferase family 2  26.73 
 
 
391 aa  67  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2174  polysaccharide-forming b-glycosyltransferase-like protein  23.33 
 
 
376 aa  67  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.486335 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1665  glycosyl transferase family 2  31.94 
 
 
401 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  34.38 
 
 
927 aa  63.5  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  33.59 
 
 
872 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  34.38 
 
 
1115 aa  63.2  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  34.38 
 
 
1115 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  30.68 
 
 
236 aa  62.8  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0242  glycosyl transferase  29.32 
 
 
378 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  27.4 
 
 
309 aa  62.4  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  33.59 
 
 
1119 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1890  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 
443 aa  61.6  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2211  glycosyl transferase family protein  38.1 
 
 
357 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276702  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2236  glycosyl transferase family 2  20.24 
 
 
343 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  33.59 
 
 
1115 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0752  N-glycosyltransferase  36.7 
 
 
433 aa  60.8  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  33.05 
 
 
412 aa  60.5  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1844  glycosyl transferase family 2  33 
 
 
387 aa  60.5  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 
270 aa  59.7  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0212  glycosyl transferase  30.83 
 
 
382 aa  59.7  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000843162  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  37.23 
 
 
1099 aa  59.7  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  34.58 
 
 
337 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  37.76 
 
 
337 aa  59.3  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0372  glycosyl transferase family 2  31.75 
 
 
381 aa  58.9  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0194499  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  33.94 
 
 
792 aa  58.9  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  35.87 
 
 
336 aa  58.9  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  30.65 
 
 
333 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  34 
 
 
399 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  34 
 
 
399 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  38.1 
 
 
308 aa  57.8  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0674  glycosyl transferase family 2  35.35 
 
 
382 aa  57.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0968  hypothetical protein  29.9 
 
 
235 aa  57.4  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.683686  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0595  glycosyl transferase family protein  34.04 
 
 
402 aa  57  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4643  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 
485 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0337  glycosyl transferase family 2  26.46 
 
 
349 aa  57  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4731  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 
485 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5026  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 
485 aa  57  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
410 aa  56.6  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1325  glycosyl transferase family protein  35.87 
 
 
255 aa  56.6  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0141129  hitchhiker  0.00457446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  25.7 
 
 
623 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  24.12 
 
 
302 aa  56.6  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1835  glycosyl transferase family protein  23.37 
 
 
395 aa  56.2  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3182  glycosyl transferase family 2  26.01 
 
 
322 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001770  probable glycosyl transferase  37.23 
 
 
292 aa  55.8  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0179  N-glycosyltransferase  30.63 
 
 
451 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574055  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2763  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 
324 aa  55.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.32347  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0065  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  32 
 
 
398 aa  55.8  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  32.28 
 
 
1115 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  27.54 
 
 
312 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  34.41 
 
 
455 aa  55.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  33 
 
 
302 aa  55.1  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0218  glycosyl transferase family protein  24.09 
 
 
379 aa  54.7  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  25.11 
 
 
520 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  26.29 
 
 
321 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  33.64 
 
 
418 aa  54.3  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  32.35 
 
 
752 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3832  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.73 
 
 
413 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.956349  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  28.35 
 
 
272 aa  54.3  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2254  glycosyl transferase family 2  25.83 
 
 
486 aa  54.3  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  25.11 
 
 
505 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  32.99 
 
 
334 aa  53.9  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0154  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 
268 aa  53.9  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  25.11 
 
 
662 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  30.3 
 
 
421 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1158  glycosyl transferase family protein  36.27 
 
 
403 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5173  glycosyl transferase family 2  39.56 
 
 
330 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.65386  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  35.16 
 
 
812 aa  53.9  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04326  N-glycosyltransferase  32.08 
 
 
417 aa  53.9  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780445  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2540  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 
219 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  25.11 
 
 
633 aa  53.5  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0310  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.5 
 
 
643 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0913  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.23 
 
 
341 aa  53.5  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000688111  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  31.37 
 
 
322 aa  53.5  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  33.33 
 
 
421 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1917  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
317 aa  53.1  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.795527 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1232  glycosyl transferase family protein  28.93 
 
 
362 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2307  glycosyl transferase family protein  34.19 
 
 
360 aa  53.1  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  26.74 
 
 
597 aa  53.1  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3101  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
396 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0259  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 
643 aa  52.8  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158733  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 
441 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  28.7 
 
 
441 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  34.07 
 
 
689 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>