More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1325 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1325  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 255 aa  526  1e-148  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0141129  hitchhiker  0.00457446 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  41.3 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2119  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.52 
 
 		 253 aa  159  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.731271 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1651  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.09 
 
 		 266 aa  158  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590239  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1469  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.26 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134346  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.26 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  39.26 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1683  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.26 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3694  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.2 
 
 		 266 aa  153  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  34.69 
 
 		 244 aa  152  4e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3698  glycosyl transferase family protein  34.55 
 
 		 256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1796  glycosyltransferase  33.2 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2585  glycosyl transferase family 2  34.52 
 
 		 264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1378  glycosyl transferase family protein  35.66 
 
 		 249 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.687728  hitchhiker  0.00000635475 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5392  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 		 251 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.06 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2974  WbdN  31.87 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0521919  hitchhiker  0.0000000316715 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3031  glycosyl transferase family protein  36.59 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 		 247 aa  126  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1412  glycosyl transferase family protein  34.03 
 
 		 255 aa  123  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1570  glycosyl transferase family protein  31.23 
 
 		 252 aa  118  9e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2353  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.712246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1918  glycosyl transferase family 2  34.68 
 
 		 290 aa  116  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.238052  hitchhiker  0.00463208 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  32.9 
 
 		 347 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  32.18 
 
 		 337 aa  108  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3020  glycosyl transferase family protein  38.41 
 
 		 146 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.738813  normal  0.0744871 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1425  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 		 357 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 		 351 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 		 333 aa  105  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 		 347 aa  105  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  36.53 
 
 		 305 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 		 597 aa  103  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  31.74 
 
 		 274 aa  102  8e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  32.56 
 
 		 316 aa  101  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0676  teichuronic acid biosynthesis  31.95 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00829519  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  35.48 
 
 		 344 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  44.76 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  30.42 
 
 		 341 aa  99.4  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 		 365 aa  97.8  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 276 aa  97.4  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  27.62 
 
 		 334 aa  97.1  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  26.47 
 
 		 308 aa  96.3  5e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  28.75 
 
 		 347 aa  95.9  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1306  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 283 aa  95.5  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  42.2 
 
 		 337 aa  94.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  45.83 
 
 		 302 aa  94  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  37.3 
 
 		 326 aa  94  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  39.52 
 
 		 330 aa  94.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  41.9 
 
 		 390 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  37.3 
 
 		 326 aa  94.4  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  36.8 
 
 		 326 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  42.31 
 
 		 324 aa  92.4  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  37.3 
 
 		 326 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 		 663 aa  91.3  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  39.25 
 
 		 386 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  32.4 
 
 		 337 aa  90.5  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  27.83 
 
 		 338 aa  90.9  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  32.42 
 
 		 294 aa  90.1  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  42.11 
 
 		 310 aa  89.7  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0353  glycosyl transferase family 2  32.97 
 
 		 354 aa  89.7  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  38.89 
 
 		 362 aa  89  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  41.75 
 
 		 233 aa  89  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  31.14 
 
 		 299 aa  88.6  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  35 
 
 		 327 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  39.81 
 
 		 230 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  35 
 
 		 327 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  39.22 
 
 		 321 aa  88.2  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  28.78 
 
 		 321 aa  88.6  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7004  glycosyl transferase family 2  37.39 
 
 		 155 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  34.68 
 
 		 326 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  35 
 
 		 327 aa  88.2  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  35 
 
 		 327 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  34.13 
 
 		 300 aa  87.4  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.62 
 
 		 327 aa  87  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  35.62 
 
 		 327 aa  87  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1327  hypothetical protein  44.09 
 
 		 338 aa  86.7  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0232591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 		 280 aa  86.7  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.91 
 
 		 327 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  30.54 
 
 		 581 aa  86.3  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  40.4 
 
 		 289 aa  86.3  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  37.27 
 
 		 374 aa  85.9  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1691  glycosyl transferase family protein  24.89 
 
 		 273 aa  86.3  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  27.12 
 
 		 318 aa  85.9  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  30 
 
 		 295 aa  85.5  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.55 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 313 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0488  glycosyl transferase family protein  40.19 
 
 		 609 aa  85.1  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2951  glycosyl transferase family 2  31.45 
 
 		 357 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  41.24 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  35 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  34.23 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1355  glycosyl transferase family protein  34.52 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2039  glycosyl transferase family 2  36.43 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.294118  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14161  hypothetical protein  26.92 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0192453  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3927  glycosyl transferase family 2  41 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0129456 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  39.09 
 
 		 329 aa  84.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 		 1250 aa  84  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  41.67 
 
 		 341 aa  84.3  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  36.89 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>