114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2540 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2540  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 219 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3134  glycosyl transferase, group 2 family protein  62.33 
 
 		 217 aa  268  7e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0455635  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3001  glycosyl transferase family protein  63.26 
 
 		 217 aa  267  8.999999999999999e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5418  glycosyl transferase family protein  59.63 
 
 		 218 aa  242  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39706  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2505  glycosyl transferase family protein  54.42 
 
 		 219 aa  228  8e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3256  glycosyl transferase, group 2 family protein  53.95 
 
 		 219 aa  224  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0789044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2639  glycosyl transferase family protein  53.95 
 
 		 232 aa  224  8e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613658 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4939  glycosyl transferase family protein  53.85 
 
 		 227 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2655  glycosyl transferase family protein  53.77 
 
 		 223 aa  218  6e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584909  normal  0.786422 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2029  glycosyl transferase family protein  56.13 
 
 		 217 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80207  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2238  glycosyl transferase family 2  56.48 
 
 		 218 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5874  glycosyl transferase family protein  48.61 
 
 		 270 aa  193  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191955 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1798  glycosyl transferase family protein  40.54 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.521662  normal  0.0312048 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0022  glycosyl transferase family protein  44 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.647116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0557  glycosyl transferase family 2  42.06 
 
 		 250 aa  142  5e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0337  glycosyl transferase family protein  39.04 
 
 		 273 aa  109  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20090  glycosyl transferase  33.19 
 
 		 255 aa  105  8e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.308185  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0510  glycosyl transferase family 2  35.68 
 
 		 270 aa  102  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.319403  decreased coverage  0.000000276564 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0203  glycosyl transferase family 2  37.77 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.856102  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3270  glycosyl transferase family 2  34.45 
 
 		 247 aa  98.2  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  hitchhiker  0.0000443809 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2569  glycosyl transferase family 2  34.67 
 
 		 227 aa  90.9  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392565  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0578  glycosyl transferase family protein  33.86 
 
 		 419 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01090  uncharacterized LmbE-like protein  39.88 
 
 		 708 aa  84.7  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10920  acylphosphatase  30.86 
 
 		 393 aa  83.2  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.551581  normal  0.319268 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4101  glycosyl transferase family protein  31.5 
 
 		 390 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116147  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1343  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 		 522 aa  73.9  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725214  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4582  glycosyl transferase family 2  29.48 
 
 		 386 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.077978 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4212  glycosyl transferase family protein  29.88 
 
 		 386 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.787376  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4727  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 		 386 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0134814 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2977  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0799  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 		 369 aa  64.3  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.958251 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0560  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3596  glycosyl transferase family 2  26.09 
 
 		 418 aa  60.5  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  27.01 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1810  glycosyl transferase family protein  35.77 
 
 		 513 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0885657  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3205  glycosyltransferase  33 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150696  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  27.51 
 
 		 479 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3459  glycosyl transferase, group 2 family protein  33 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0198533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3232  glycosyl transferase, group 2 family protein  33 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0263281  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1742  glycosyltransferase  30.04 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3138  glycosyltransferase  33 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259725  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3442  glycosyl transferase, group 2 family protein  32 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.184184  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  34.65 
 
 		 479 aa  55.8  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1173  glycosyl transferase family 2  29.57 
 
 		 372 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3446  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.21 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3434  glycosyl transferase, group 2 family protein  32 
 
 		 253 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5107  glycosyl transferase family protein  26.1 
 
 		 364 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.120649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  28.16 
 
 		 337 aa  53.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1196  b-glycosyltransferase  26.29 
 
 		 349 aa  53.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.959593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1394  glycosyl transferase family 2  25.29 
 
 		 362 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.295637 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  39.19 
 
 		 694 aa  53.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  33.01 
 
 		 481 aa  52.8  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2236  glycosyl transferase family 2  26.21 
 
 		 343 aa  52.8  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  26.34 
 
 		 235 aa  52.8  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9270  glycosyltransferase-like protein  27.78 
 
 		 243 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2919  glycosyl transferase family 2  24.8 
 
 		 384 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1840  cell wall membrane glycosyltransferase  26.45 
 
 		 308 aa  50.4  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1078  glycosyl transferase family protein  24.3 
 
 		 232 aa  50.1  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892634  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  28.12 
 
 		 315 aa  50.1  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  26.73 
 
 		 422 aa  49.3  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1232  glycosyl transferase family protein  26.46 
 
 		 362 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1256  glycosyl transferase family protein  23.71 
 
 		 240 aa  48.9  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000223583  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0119  glycosyl transferase family protein  34.65 
 
 		 232 aa  48.5  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1675  glycosyl transferase family 2  24.52 
 
 		 415 aa  48.5  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2370  glycosyltransferase  29.27 
 
 		 319 aa  47.8  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0914  glycosyl transferase family 2  29.56 
 
 		 435 aa  47.8  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.262835  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0071  glycosyl transferase family 2  22.75 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1536  glycosyl transferase family 2  21.36 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  23.98 
 
 		 260 aa  46.6  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0140  glycosyl transferase family protein  28.49 
 
 		 244 aa  46.2  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2981  glycosyl transferase family 2  30.52 
 
 		 312 aa  46.2  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  34.96 
 
 		 672 aa  45.8  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1788  glycosyl transferase family protein  22.75 
 
 		 418 aa  45.8  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03040  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.95 
 
 		 231 aa  45.8  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  22.46 
 
 		 235 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1040  glycosyl transferase family 2  24.4 
 
 		 380 aa  45.4  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0435  glycosyltransferase  35 
 
 		 512 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  25.47 
 
 		 334 aa  44.7  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3609  glycosyl transferase family protein  33.67 
 
 		 319 aa  44.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23431  glycosyl transferase family protein  28.11 
 
 		 342 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0584  glycosyl transferase family protein  24.9 
 
 		 481 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  21.5 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3791  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  23.26 
 
 		 317 aa  43.9  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2333  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 327 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.012677  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1704  glycosyl transferase family 2  44.44 
 
 		 398 aa  43.9  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0161  glycosyl transferase family 2  31.78 
 
 		 475 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06620  glycosyl transferase family 2  25.41 
 
 		 221 aa  44.3  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02310  glycosyl transferase  28.57 
 
 		 354 aa  44.3  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0212  glycosyl transferase family 2  35.05 
 
 		 331 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.921554  normal  0.557032 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1366  glycosyl transferase family protein  34.38 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0383  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 		 331 aa  43.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3832  glycosyl transferase family 2  25.25 
 
 		 295 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5400  glycosyl transferase family 2  31.31 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.859637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3882  glycosyl transferase family 2  25.25 
 
 		 295 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.395304 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  23.38 
 
 		 1002 aa  42.7  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4098  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  26.4 
 
 		 1148 aa  42.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0938  glycosyl transferase family protein  31.52 
 
 		 317 aa  42.4  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2406  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 		 280 aa  42.4  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3944  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 		 242 aa  42.4  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5220  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 		 242 aa  42.4  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>