170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6919 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6919  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
408 aa  849    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1431  glycosyl transferase family 2  44.28 
 
 
376 aa  279  8e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.679301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3358  glycosyl transferase family 2  39.79 
 
 
389 aa  278  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0515299  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0221  glycosyl transferase family protein  41.94 
 
 
368 aa  270  4e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07871  hypothetical protein  41.14 
 
 
364 aa  262  1e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4080  glycosyl transferase family 2  38.46 
 
 
401 aa  258  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.606735  normal  0.10978 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1196  b-glycosyltransferase  37.93 
 
 
349 aa  195  1e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.959593  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0402  glycosyl transferase family 2  27.44 
 
 
359 aa  89.4  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.20489 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1040  glycosyl transferase family 2  29.51 
 
 
380 aa  86.7  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2182  b-glycosyltransferase  24.43 
 
 
379 aa  85.9  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.935401  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2238  glycosyl transferase family 2  24.9 
 
 
374 aa  77  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2174  polysaccharide-forming b-glycosyltransferase-like protein  23.26 
 
 
376 aa  75.9  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.486335 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2026  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
384 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1379  glycosyl transferase family protein  23.05 
 
 
367 aa  73.6  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.500878  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1890  glycosyl transferase family protein  27.06 
 
 
443 aa  69.3  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2236  glycosyl transferase family 2  21.34 
 
 
343 aa  67.4  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  23.41 
 
 
509 aa  63.9  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  23.6 
 
 
752 aa  60.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04930  putative transmembrane glycosyltransferase  26.78 
 
 
371 aa  60.5  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.74238  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  27.2 
 
 
694 aa  59.7  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0337  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 
349 aa  58.9  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0335  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 
346 aa  58.2  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1665  glycosyl transferase family 2  30.94 
 
 
401 aa  58.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  33.33 
 
 
441 aa  57  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
441 aa  57  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  33.33 
 
 
441 aa  57  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3771  glycosyl transferase family protein  22.32 
 
 
433 aa  57  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  33.33 
 
 
441 aa  57  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  33.33 
 
 
441 aa  57  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  33.02 
 
 
412 aa  57  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  33.33 
 
 
412 aa  57  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  22.66 
 
 
433 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  22.66 
 
 
433 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  25.85 
 
 
399 aa  56.2  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0663  hypothetical protein  22.57 
 
 
376 aa  55.1  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  30.07 
 
 
418 aa  54.7  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0968  hypothetical protein  27.84 
 
 
235 aa  54.7  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.683686  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  26.69 
 
 
792 aa  54.3  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1456  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 
241 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000411499  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  33.96 
 
 
418 aa  53.9  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  29.69 
 
 
236 aa  54.3  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1835  glycosyl transferase family protein  29.06 
 
 
395 aa  54.3  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  33.08 
 
 
235 aa  53.5  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  22.4 
 
 
433 aa  53.5  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  22.4 
 
 
433 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0595  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 
402 aa  53.5  0.000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  23.99 
 
 
1115 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04326  N-glycosyltransferase  28.57 
 
 
417 aa  53.1  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780445  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0674  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 
382 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  23.72 
 
 
927 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  24.29 
 
 
411 aa  52.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  23.72 
 
 
1115 aa  51.2  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  22.14 
 
 
433 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0752  N-glycosyltransferase  29.05 
 
 
433 aa  51.2  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  25.64 
 
 
256 aa  51.2  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  27.84 
 
 
445 aa  51.2  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  23.55 
 
 
1115 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1767  glycosyl transferase family 2  26.36 
 
 
331 aa  50.8  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  27.52 
 
 
421 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  24.62 
 
 
872 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  25.58 
 
 
477 aa  50.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2168  glycosyl transferase family 2  24.37 
 
 
391 aa  50.4  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0868  glycosyl transferase family 2  26.4 
 
 
331 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  22.66 
 
 
433 aa  50.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4035  glycosyl transferase family protein  23.03 
 
 
344 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0179  N-glycosyltransferase  22.38 
 
 
451 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574055  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4945  glycosyl transferase family protein  22.44 
 
 
651 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.420909  normal  0.200608 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5599  N-acetylglucosaminyltransferase  27.85 
 
 
262 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0041999  hitchhiker  0.0000000000128208 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  23.26 
 
 
1119 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  27.52 
 
 
421 aa  49.7  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5087  N-acetylglucosaminyltransferase, N-terminus (glycosyl transferase)  28.48 
 
 
218 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4562  glycosyl transferase family protein  22.44 
 
 
651 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.829181  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4650  glycosyl transferase family protein  22.44 
 
 
651 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.492865  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1491  glycosyl transferase family 2  24.16 
 
 
355 aa  49.3  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000591503 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  27.52 
 
 
421 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  23.76 
 
 
1101 aa  48.5  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0771  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 
339 aa  48.5  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.417869  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3111  glycosyl transferase family protein  22.71 
 
 
297 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3171  glycosyl transferase family protein  22.71 
 
 
297 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675731  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  25.1 
 
 
321 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  27.6 
 
 
311 aa  48.5  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3213  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
256 aa  48.5  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.595641 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1675  glycosyl transferase family 2  24.29 
 
 
415 aa  48.5  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2222  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
384 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0212  glycosyl transferase family 2  28.15 
 
 
331 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.921554  normal  0.557032 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3169  glycosyl transferase family 2  23.89 
 
 
344 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1428  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 
244 aa  48.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2129  N-glycosyltransferase  30.3 
 
 
444 aa  47.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.772993  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2143  N-glycosyltransferase  30.3 
 
 
444 aa  47.8  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.382592  normal  0.0135691 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2239  N-glycosyltransferase  30.3 
 
 
444 aa  47.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.423629  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  23.33 
 
 
428 aa  47.8  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0065  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  26.02 
 
 
398 aa  47.4  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0119  glycosyl transferase family protein  26.73 
 
 
232 aa  47.8  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  24.9 
 
 
1118 aa  47.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 
233 aa  47.4  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  23.26 
 
 
1115 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  31.96 
 
 
273 aa  47.4  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02661  glycosyltransferase  29.03 
 
 
248 aa  47.4  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4118  putative glycosyl transferase  21.18 
 
 
344 aa  47  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.910618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>