More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3553 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
477 aa  956    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  38.99 
 
 
528 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  35.25 
 
 
792 aa  177  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4928  glycosyl transferase family 2  33.63 
 
 
513 aa  177  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  34.04 
 
 
753 aa  177  5e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10710  membrane sugar transferase  31.77 
 
 
470 aa  164  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.456153 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3773  glycosyl transferase family 2  33.17 
 
 
484 aa  158  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1299  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
470 aa  156  9e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0628268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3324  glycosyl transferase family protein  32.54 
 
 
487 aa  154  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.624929 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1004  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 
470 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1021  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 
470 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1031  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 
470 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0821008  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2359  glycosyl transferase family 2  33.91 
 
 
487 aa  150  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000227961  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5057  glycosyl transferase family protein  31.41 
 
 
470 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 
924 aa  134  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  31.54 
 
 
305 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  29.73 
 
 
337 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  32.17 
 
 
305 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1244  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 
328 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.161463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1214  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 
328 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4464  glycosyl transferase family 2  34.63 
 
 
335 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  35.4 
 
 
328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3517  hypothetical protein  29.2 
 
 
337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000347699 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0770  glycosyl transferase family 2  29.56 
 
 
505 aa  110  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  35.27 
 
 
301 aa  110  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  35.75 
 
 
311 aa  106  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 
311 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  33.94 
 
 
315 aa  105  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 
322 aa  104  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  30.47 
 
 
304 aa  103  8e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2467  glycosyl transferase family protein  34.81 
 
 
322 aa  103  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  28.96 
 
 
345 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
321 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_002950  PG1880  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.15 
 
 
336 aa  101  3e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  30.97 
 
 
411 aa  99.4  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
1101 aa  99  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  30.04 
 
 
422 aa  98.6  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3182  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
322 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 
841 aa  97.4  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 
260 aa  97.8  4e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3451  hypothetical protein  27.56 
 
 
300 aa  97.4  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  30.57 
 
 
822 aa  97.1  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4035  glycosyl transferase family protein  31.65 
 
 
344 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  30.13 
 
 
461 aa  96.3  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0354  glycosyl transferase family 2  28.46 
 
 
331 aa  95.1  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4024  glycosyl transferase family protein  32.43 
 
 
322 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1818  glycosyl transferase family protein  32.73 
 
 
335 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2017  glycosyl transferase family protein  35.79 
 
 
322 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  30.09 
 
 
838 aa  94.4  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  29.79 
 
 
333 aa  94  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3835  hypothetical protein  26.18 
 
 
334 aa  94  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 
428 aa  93.2  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2989  family 2 glycosyl transferase  28.12 
 
 
322 aa  93.2  9e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4588  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 
307 aa  92.4  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.151626  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  25.76 
 
 
311 aa  92.8  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3045  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 
305 aa  92.4  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.144194  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  33.49 
 
 
345 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3169  glycosyl transferase family 2  27.52 
 
 
344 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1651  glycosyl transferase family 2  31.02 
 
 
313 aa  90.9  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1274  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 
303 aa  90.5  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3463  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 
332 aa  90.5  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0230104  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3115  glycosyl transferase family 2  44.92 
 
 
235 aa  89.4  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3110  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 
310 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  26.84 
 
 
322 aa  89  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3170  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 
310 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.845407 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2680  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 
426 aa  89  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1427  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.63 
 
 
338 aa  88.2  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  27.59 
 
 
403 aa  88.2  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  34.34 
 
 
289 aa  88.6  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  27.64 
 
 
1154 aa  87.8  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1850  glycosyl transferase family 2  27.39 
 
 
362 aa  87  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0119  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 
232 aa  87  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0466  glycosyl transferase family protein  29.43 
 
 
302 aa  86.7  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0600433  unclonable  0.0000113237 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0137  glycosyl transferase family protein  32.49 
 
 
296 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.145337  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  28.48 
 
 
355 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  29.46 
 
 
344 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0353  glycosyl transferase family 2  28.64 
 
 
312 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000439981  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0205  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 
339 aa  85.1  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  29.46 
 
 
344 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  33.86 
 
 
717 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  31.56 
 
 
836 aa  84.7  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1791  b-glycosyltransferase  26.46 
 
 
344 aa  84.3  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1703  glycosyl transferase family 2  27.52 
 
 
353 aa  84.3  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  31.6 
 
 
236 aa  84.3  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1813  glycosyl transferase family protein  28.26 
 
 
362 aa  84  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2894  hypothetical protein  31.36 
 
 
316 aa  83.6  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0314909 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1376  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.46 
 
 
369 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  26.15 
 
 
309 aa  82.8  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 
300 aa  82.8  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  33.07 
 
 
717 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3553  glycosyl transferase family 2  30.34 
 
 
619 aa  82.4  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0189873  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
748 aa  81.6  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2541  putative glycosyl transferase  28.89 
 
 
341 aa  81.6  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4025  glycosyl transferase family protein  30.86 
 
 
346 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1474  glycosyltransferase  25.45 
 
 
447 aa  81.3  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3930  glycosyl transferase family 2  29.35 
 
 
413 aa  81.3  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555455  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  27.05 
 
 
1099 aa  80.9  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  32.52 
 
 
235 aa  81.3  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1379  glycosyl transferase family protein  24.26 
 
 
367 aa  80.9  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.500878  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  30.28 
 
 
1120 aa  80.5  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>