More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0868 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0868  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
331 aa  676    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4093  glycosyl transferase family 2  30.68 
 
 
296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  29.04 
 
 
310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0428  glycosyl transferase family 2  32.78 
 
 
438 aa  106  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3353  glycosyl transferase family protein  28.8 
 
 
312 aa  99  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3219  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
314 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3930  glycosyl transferase family 2  34.21 
 
 
413 aa  96.7  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555455  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  32.08 
 
 
310 aa  94.7  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1586  glycosyl transferase family protein  34.75 
 
 
444 aa  93.6  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.807446  normal  0.639173 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3874  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 
313 aa  92.4  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0495804  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  28.79 
 
 
312 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0306  arylsulfatase  32.64 
 
 
1041 aa  90.1  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  30.65 
 
 
307 aa  89.7  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1449  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 
321 aa  88.6  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.192558  normal  0.0368416 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2904  glycosyl transferase family protein  29.23 
 
 
328 aa  88.6  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000158295 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1651  glycosyl transferase family 2  27.56 
 
 
313 aa  86.7  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2680  glycosyl transferase family protein  31.49 
 
 
426 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2151  glycosyl transferase family 2  31.12 
 
 
313 aa  85.9  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2107  glycosyl transferase family 2  31.12 
 
 
313 aa  85.9  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0268  glycosyl transferase family protein  27.38 
 
 
323 aa  85.9  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2971  glycosyl transferase family 2  26.4 
 
 
324 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
308 aa  84.3  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0269  glycosyl transferase family protein  24.23 
 
 
335 aa  83.6  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3433  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 
309 aa  82  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  27.08 
 
 
316 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3253  sulfatase  30.38 
 
 
1065 aa  80.1  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.189767  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2970  glycosyl transferase family 2  28.38 
 
 
322 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4122  glycosyl transferase family protein  26.51 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.408918  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1076  glycosyl transferase family 2  25.41 
 
 
305 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.647186  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1024  glycosyl transferase, group 2  25.89 
 
 
290 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.431041  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3045  putative glycosyl transferase  28.48 
 
 
338 aa  74.3  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109272  normal  0.871174 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  28.15 
 
 
305 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2393  glycosyl transferase family 2  24.82 
 
 
281 aa  72.8  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3253  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 
305 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.24393  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3054  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
305 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4681  glycosyl transferase family protein  30.22 
 
 
345 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627848  normal  0.36467 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3281  glycosyl transferase family 2  26.25 
 
 
307 aa  71.2  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2573  glycosyl transferase family 2  26.17 
 
 
338 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0962  glycosyl transferase family protein  26.19 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153227  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  29.46 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0434  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 
460 aa  70.1  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4125  glycosyl transferase family protein  24.3 
 
 
322 aa  69.7  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3738  glycosyl transferase family 2  30.22 
 
 
279 aa  69.3  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2562  succinoglycan biosynthesis protein exoM  26.54 
 
 
326 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3111  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 
297 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3171  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 
297 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675731  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2462  glycosyl transferase family 2  28.09 
 
 
421 aa  67  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.278728  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0339  glycosyl transferase family 2  26.46 
 
 
304 aa  67  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.479436  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2934  family 2 glycosyl transferase  35.71 
 
 
295 aa  67  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.349608 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2949  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 
392 aa  67  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1221  glycosyl transferase family protein  25.77 
 
 
326 aa  66.6  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.112085  normal  0.287305 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1519  glycosyl transferase family protein  29.88 
 
 
310 aa  66.2  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3194  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
455 aa  66.6  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
924 aa  66.2  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1248  glycosyltransferase  28.48 
 
 
310 aa  65.5  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0573246  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3045  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
305 aa  65.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.144194  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0518  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 
341 aa  65.5  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0912  b-glycosyltransferase  28.89 
 
 
334 aa  65.5  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.780532  normal  0.895852 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4958  glycosyl transferase family protein  24.85 
 
 
309 aa  64.7  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0168842 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  35.43 
 
 
300 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1581  glycosyl transferase family protein  29.88 
 
 
466 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3347  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 
308 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3185  glycosyl transferase family 2  24.16 
 
 
305 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2800  glycosyl transferase family 2  31.34 
 
 
309 aa  64.7  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  34.15 
 
 
305 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1552  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
299 aa  63.5  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  36.96 
 
 
333 aa  62.8  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5156  family 2 glycosyl transferase  28.57 
 
 
216 aa  62.8  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2765  glycosyl transferase family protein  28.23 
 
 
626 aa  62  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 
322 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1381  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.26 
 
 
302 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.247424  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  35.2 
 
 
335 aa  61.6  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1003  glycosyl transferase, group 2 family protein  29 
 
 
315 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2267  glycosyl transferase, group 2 family protein  29 
 
 
315 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58247  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.91 
 
 
327 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1292  glycosyl transferase, group 2 family protein  29 
 
 
315 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3033  glycosyl transferase, group 2 family protein  29 
 
 
315 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3162  glycosyl transferase, group 2 family protein  29 
 
 
315 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3195  glycosyl transferase family 2  26.07 
 
 
394 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  24.83 
 
 
652 aa  61.2  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  24.55 
 
 
327 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.55 
 
 
327 aa  60.5  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  27.87 
 
 
310 aa  60.5  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.55 
 
 
327 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1960  glycosyl transferase family protein  25.84 
 
 
326 aa  60.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.581867  normal  0.453603 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3998  glycosyl transferase family protein  27.66 
 
 
310 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.756459  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  24.55 
 
 
327 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0345  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 
279 aa  60.5  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0405304 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1549  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 
240 aa  60.5  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0584416  normal  0.851188 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.45 
 
 
327 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  25.45 
 
 
327 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1075  WecB/TagA/CpsF family glycosyl transferase  30.21 
 
 
561 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.255325  normal  0.693925 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  26.17 
 
 
754 aa  59.3  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  28.29 
 
 
270 aa  59.3  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0399  glycosyl transferase family 2  29.07 
 
 
454 aa  59.3  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0308  glycosyltransferase  37.89 
 
 
309 aa  58.5  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0119  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
232 aa  58.9  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  27.23 
 
 
1119 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1525  glycosyl transferase family protein  31.37 
 
 
240 aa  59.3  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201491  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1571  glycosyl transferase family 2  31.93 
 
 
342 aa  58.9  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.79772e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>