More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1581 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1581  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 466 aa  920    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0434  glycosyl transferase family 2  47.6 
 
 		 460 aa  253  5.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0428  glycosyl transferase family 2  37.47 
 
 		 438 aa  219  6e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1586  glycosyl transferase family protein  36.86 
 
 		 444 aa  216  8e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.807446  normal  0.639173 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2680  glycosyl transferase family protein  45.17 
 
 		 426 aa  179  7e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0399  glycosyl transferase family 2  39.22 
 
 		 454 aa  179  8e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3930  glycosyl transferase family 2  36.53 
 
 		 413 aa  169  8e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555455  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3195  glycosyl transferase family 2  33.75 
 
 		 394 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2949  glycosyl transferase family 2  38.52 
 
 		 392 aa  144  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2462  glycosyl transferase family 2  29.12 
 
 		 421 aa  136  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.278728  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2063  glycosyl transferase family 2  28.06 
 
 		 321 aa  99.4  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  28.35 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1651  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3347  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  29.1 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3253  glycosyl transferase family 2  33.48 
 
 		 305 aa  79.7  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.24393  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  29.31 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4122  glycosyl transferase family protein  29.71 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.408918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  27.87 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7656  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 		 313 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3054  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3433  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 		 309 aa  75.5  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2675  family 2 glycosyl transferase  30 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.384822 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4093  glycosyl transferase family 2  25.9 
 
 		 296 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 		 748 aa  72.8  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  24.89 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4588  glycosyl transferase family protein  29.21 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.151626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0441  glycosyl transferase family 2  32.68 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.266223  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  30.49 
 
 		 236 aa  69.7  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4681  glycosyl transferase family protein  28.68 
 
 		 345 aa  69.3  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627848  normal  0.36467 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2107  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  28.74 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  29.26 
 
 		 461 aa  69.3  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2151  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3353  glycosyl transferase family protein  28.73 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3392  glycosyl transferase family protein  24.71 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  29.67 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  25.4 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 		 353 aa  67.4  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00986  glycosyl transferase, family 2  27.8 
 
 		 303 aa  67  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0498062  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4811  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 		 296 aa  66.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0562573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 		 355 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2573  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3874  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0495804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0868  glycosyl transferase family 2  29.88 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10710  membrane sugar transferase  28.25 
 
 		 470 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.456153 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  24.55 
 
 		 528 aa  63.9  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6856  glycosyl transferase family 2  29.26 
 
 		 328 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2643  family 2 glycosyl transferase  36.07 
 
 		 321 aa  63.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  27.44 
 
 		 544 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  24.89 
 
 		 754 aa  62.4  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0422  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 		 1297 aa  62.4  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  32.36 
 
 		 753 aa  61.6  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  24 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1687  glycosyl transferase family protein  32.17 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.165254  normal  0.0664062 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  29.88 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 623 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  26.43 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  25.91 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  29.35 
 
 		 598 aa  60.5  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  22.99 
 
 		 338 aa  59.3  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3281  glycosyl transferase family 2  24.58 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  28.69 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1274  glycosyl transferase family 2  29.26 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1299  glycosyl transferase family protein  31.15 
 
 		 470 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0628268 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  24.23 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  25.55 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5057  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 		 470 aa  57  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1342  glycosyl transferase family protein  27.51 
 
 		 353 aa  57  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.371395 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3183  glycosyl transferase family 2  27.97 
 
 		 358 aa  57  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292304  decreased coverage  0.0000016442 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1306  glycosyl transferase family protein  27.51 
 
 		 321 aa  57  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627335  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0466  glycosyl transferase family protein  26.83 
 
 		 302 aa  57  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0600433  unclonable  0.0000113237 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2765  glycosyl transferase family protein  27.38 
 
 		 626 aa  56.6  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5280  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.39 
 
 		 273 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  26.88 
 
 		 403 aa  56.2  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2753  glycosyl transferase family 2  29.15 
 
 		 310 aa  55.8  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.8402 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 		 345 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1244  glycosyl transferase family 2  26.4 
 
 		 328 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.161463 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  26.86 
 
 		 775 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5124  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.39 
 
 		 273 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  29.15 
 
 		 301 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1214  glycosyl transferase family 2  26.4 
 
 		 328 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0602  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.33 
 
 		 282 aa  55.5  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000299087  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2354  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 		 297 aa  55.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.358669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  26 
 
 		 525 aa  55.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1323  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 281 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.315586 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5523  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.39 
 
 		 273 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3588  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 337 aa  54.7  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.690536  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3111  glycosyl transferase family protein  26.02 
 
 		 297 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3171  glycosyl transferase family protein  26.02 
 
 		 297 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2081  glycosyl transferase family 2  35.58 
 
 		 258 aa  54.3  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.15987 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5677  group 2 family glycosyl transferase  22.92 
 
 		 267 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 		 235 aa  54.3  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  28.79 
 
 		 1099 aa  54.3  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  24.29 
 
 		 305 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1062  glycosyl transferase family protein  27.09 
 
 		 318 aa  53.9  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.851458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1645  glycosyltransferase-like protein  28.62 
 
 		 573 aa  53.9  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.514144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0379  glycosyl transferase family protein  28.42 
 
 		 891 aa  53.9  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>