More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1274 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1274  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
303 aa  631  1e-180  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1272  glycosyl transferase family 2  27.69 
 
 
306 aa  98.6  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.294715  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  29.88 
 
 
305 aa  92.8  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 
305 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 
477 aa  90.5  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2111  glycosyl transferase family 2  32.21 
 
 
236 aa  87.8  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 
333 aa  82.8  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10710  membrane sugar transferase  24.91 
 
 
470 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.456153 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2859  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0761346  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 
311 aa  79.7  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0884  b-glycosyltransferase  27.27 
 
 
283 aa  79.3  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030368  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  22.95 
 
 
337 aa  79  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5590  glycosyl transferase family 2  29.15 
 
 
328 aa  77.8  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1791  b-glycosyltransferase  27.9 
 
 
344 aa  76.3  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  32.2 
 
 
345 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0137  glycosyl transferase family protein  34.15 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.145337  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3324  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 
487 aa  73.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.624929 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0742  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 
281 aa  72.8  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.18736  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5040  glycosyl transferase family 2  30.81 
 
 
323 aa  72.4  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.0567661 
 
 
-
 
NC_002950  PG1880  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.45 
 
 
336 aa  72  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  26.74 
 
 
308 aa  71.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
344 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
344 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0466  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
302 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0600433  unclonable  0.0000113237 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1570  hydrolase, HAD-superfamily, subfamily IIIA  27.32 
 
 
498 aa  70.5  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.892629  normal  0.0176466 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0119  glycosyl transferase family protein  26.47 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  30.1 
 
 
272 aa  70.9  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4464  glycosyl transferase family 2  27.89 
 
 
335 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01307  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  24.62 
 
 
326 aa  70.1  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0354  glycosyl transferase family 2  26.12 
 
 
331 aa  69.7  0.00000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0379  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
891 aa  69.7  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
325 aa  69.3  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4928  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
513 aa  69.3  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  25.26 
 
 
233 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2643  family 2 glycosyl transferase  31.66 
 
 
321 aa  67.4  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3253  glycosyl transferase family 2  31.85 
 
 
305 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.24393  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4384  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 
328 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1198  glycosyl transferase family protein  24.69 
 
 
318 aa  67.4  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4024  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 
322 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3835  hypothetical protein  28.24 
 
 
334 aa  67  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3463  glycosyl transferase family protein  26.51 
 
 
332 aa  67  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0230104  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  25.98 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 
924 aa  66.6  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  25.49 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  28.82 
 
 
345 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11260  histidinol-phosphate phosphatase family protein  31.19 
 
 
499 aa  65.1  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130521  normal  0.23358 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1382  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 
333 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6447  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 
333 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0237769  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1299  glycosyl transferase family protein  25.58 
 
 
470 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0628268 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08321  glycosyl transferase family protein  29.65 
 
 
305 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.389273  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1813  glycosyl transferase family 2  26.43 
 
 
272 aa  65.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3347  glycosyl transferase family protein  26.44 
 
 
308 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  24.1 
 
 
322 aa  64.3  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5657  glycosyl transferase family 2  22.46 
 
 
303 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.49465 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
270 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2467  glycosyl transferase family protein  26.01 
 
 
322 aa  63.9  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6038  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 
333 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 
315 aa  63.5  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02586  glycosyl transferase  28.36 
 
 
292 aa  63.5  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00173399  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4035  glycosyl transferase family protein  25.33 
 
 
344 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6397  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 
333 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.441453  normal  0.138484 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5057  glycosyl transferase family protein  24.71 
 
 
470 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  25.61 
 
 
260 aa  62.4  0.000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2476  glycosyl transferase family 2  26.96 
 
 
310 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0156  glycosyl transferase family protein  25.71 
 
 
310 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  22.42 
 
 
304 aa  62.4  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3353  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 
312 aa  62  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
525 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4025  glycosyl transferase family protein  28.95 
 
 
346 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0146  glycosyl transferase family 2  25.7 
 
 
313 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  25.5 
 
 
340 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  23.59 
 
 
1120 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3169  glycosyl transferase family 2  24.55 
 
 
344 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2017  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 
322 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  28.28 
 
 
316 aa  60.5  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0716  HAD family hydrolase  28.37 
 
 
501 aa  60.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.358199  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3632  glycosyl transferase family 2  26.47 
 
 
310 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3182  glycosyl transferase family 2  26.54 
 
 
322 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05340  Glycosyl transferase, family 2  28.43 
 
 
321 aa  60.1  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000520172  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  25.48 
 
 
322 aa  60.1  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  25 
 
 
310 aa  60.1  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1878  glycosyl transferase family 2  24.34 
 
 
597 aa  60.1  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  29.93 
 
 
753 aa  60.1  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3457  b-glycosyltransferase  29.21 
 
 
302 aa  60.1  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0284988 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2800  glycosyl transferase family 2  27.85 
 
 
309 aa  60.1  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16631  glycosyl transferase family protein  24.76 
 
 
314 aa  59.3  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.505772 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0883  glycosyl transferase family protein  29.9 
 
 
310 aa  59.3  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.178472 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3392  glycosyl transferase family protein  26.38 
 
 
287 aa  58.9  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07881  glycosyl transferase family protein  25.24 
 
 
310 aa  58.9  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111057  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2949  glycosyl transferase family 2  27.04 
 
 
392 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  24.89 
 
 
403 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2811  glycosyl transferase family 2  28 
 
 
307 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.104457 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  27.27 
 
 
236 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1536  glycosyl transferase family 2  25.52 
 
 
238 aa  58.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5649  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 
333 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0900976  normal  0.264223 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0203  glycosyl transferase family protein  24.19 
 
 
313 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.326499 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0968  hypothetical protein  26.67 
 
 
235 aa  58.5  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.683686  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1078  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
232 aa  58.9  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892634  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0508  glycosyl transferase family protein  25.75 
 
 
351 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.239818  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 
479 aa  57.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>