More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0466 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0466  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
302 aa  617  1e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0600433  unclonable  0.0000113237 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0137  glycosyl transferase family protein  43.01 
 
 
296 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.145337  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0138  glycosyl transferase family protein  39.04 
 
 
293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39175  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  31.4 
 
 
528 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  31.14 
 
 
924 aa  97.8  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 
753 aa  95.9  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  29.43 
 
 
477 aa  86.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  32.39 
 
 
325 aa  87  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  28.83 
 
 
305 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 
304 aa  85.9  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  31.84 
 
 
328 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  33.62 
 
 
321 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1299  glycosyl transferase family protein  30.1 
 
 
470 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0628268 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  33.82 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5057  glycosyl transferase family protein  30.1 
 
 
470 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4928  glycosyl transferase family 2  32 
 
 
513 aa  79.7  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0540  glycosyl transferase family 2  26.72 
 
 
310 aa  79.7  0.00000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3930  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 
413 aa  79  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555455  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3347  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 
308 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  25.34 
 
 
305 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1004  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 
470 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4588  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
307 aa  77  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.151626  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1021  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 
470 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1031  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 
470 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0821008  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4035  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 
344 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  26.72 
 
 
337 aa  75.5  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1214  glycosyl transferase family 2  27.76 
 
 
328 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1244  glycosyl transferase family 2  27.76 
 
 
328 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.161463 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4024  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
322 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 
322 aa  73.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0146  glycosyl transferase family 2  32.52 
 
 
313 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0203  glycosyl transferase family protein  32.04 
 
 
313 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.326499 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3169  glycosyl transferase family 2  30.33 
 
 
344 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10710  membrane sugar transferase  33.33 
 
 
470 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.456153 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  29.53 
 
 
345 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  27.57 
 
 
1077 aa  72  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  30.35 
 
 
333 aa  72  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3678  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 
289 aa  71.6  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  25.62 
 
 
1739 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1987  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.82 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1386  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.82 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.343804  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  31.95 
 
 
792 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1274  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 
303 aa  71.2  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3045  glycosyl transferase family protein  31.55 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.144194  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5246  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 
348 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0170348 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1010  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.82 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.374388  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1298  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.82 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.472979  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3168  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.82 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3039  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.82 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2274  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.82 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.102891  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2856  family 2 glycosyl transferase  28.11 
 
 
326 aa  71.2  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1097  glycosyl transferase family protein  31.39 
 
 
326 aa  70.1  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000713189  normal  0.938252 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0287  glycosyl transferase family 2  31.55 
 
 
315 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.201037  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3182  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
322 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 
311 aa  69.3  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  28.3 
 
 
309 aa  68.9  0.00000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2643  family 2 glycosyl transferase  33 
 
 
321 aa  68.9  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19750  predicted glycosyltransferase  32.44 
 
 
664 aa  67.8  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2811  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
307 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.104457 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1818  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 
335 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 
748 aa  67.4  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2253  glycosyl transferase family 2  28.27 
 
 
331 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.628199  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  26.36 
 
 
315 aa  67  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2191  glycosyl transferase family 2  28.27 
 
 
331 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4384  glycosyl transferase family protein  29.05 
 
 
328 aa  67  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  30.1 
 
 
344 aa  67  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  30.1 
 
 
344 aa  67  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2680  glycosyl transferase family protein  31.12 
 
 
426 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  24.52 
 
 
785 aa  66.6  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3875  glycosyl transferase family 2  30.1 
 
 
331 aa  66.6  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1272  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.294715  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  27.02 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6038  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
333 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1248  glycosyltransferase  31.02 
 
 
310 aa  65.9  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0573246  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5590  glycosyl transferase family 2  29.77 
 
 
328 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1366  glycosyl transferase family protein  27.46 
 
 
331 aa  65.1  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.959052  normal  0.0372616 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  28.22 
 
 
272 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3111  glycosyl transferase family protein  28.36 
 
 
297 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3171  glycosyl transferase family protein  28.36 
 
 
297 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675731  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 
841 aa  64.3  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1382  glycosyl transferase family protein  32.83 
 
 
333 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6447  glycosyl transferase family protein  32.83 
 
 
333 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0237769  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16631  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 
314 aa  63.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.505772 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1878  glycosyl transferase family 2  27.04 
 
 
597 aa  63.2  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 
525 aa  63.2  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5443  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 
333 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.966664  hitchhiker  0.00908127 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  30.66 
 
 
316 aa  62.8  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  26.98 
 
 
401 aa  63.2  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  29.02 
 
 
310 aa  62.8  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 
313 aa  62.4  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0140  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 
244 aa  62  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 
274 aa  62  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0792  glycosyl transferase family protein  24.22 
 
 
376 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.77414 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  30.52 
 
 
1267 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6397  glycosyl transferase family protein  32.65 
 
 
333 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.441453  normal  0.138484 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1482  glycosyl transferase family protein  32.13 
 
 
1162 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345967  normal  0.675162 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  25.63 
 
 
1340 aa  61.2  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  27.93 
 
 
1759 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  24.34 
 
 
322 aa  61.6  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>