More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0399 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0399  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
454 aa  907    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0428  glycosyl transferase family 2  36.71 
 
 
438 aa  176  7e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2949  glycosyl transferase family 2  42.97 
 
 
392 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3195  glycosyl transferase family 2  34.48 
 
 
394 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0434  glycosyl transferase family 2  42.51 
 
 
460 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1581  glycosyl transferase family protein  39.22 
 
 
466 aa  162  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2462  glycosyl transferase family 2  33.53 
 
 
421 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.278728  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1586  glycosyl transferase family protein  38.93 
 
 
444 aa  152  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.807446  normal  0.639173 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3930  glycosyl transferase family 2  36.66 
 
 
413 aa  151  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555455  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2680  glycosyl transferase family protein  38.22 
 
 
426 aa  147  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  27.86 
 
 
308 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  30.7 
 
 
310 aa  95.9  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1651  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
313 aa  90.5  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  27.31 
 
 
316 aa  89  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3874  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 
313 aa  87  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0495804  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2151  glycosyl transferase family 2  31.72 
 
 
313 aa  86.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2107  glycosyl transferase family 2  31.72 
 
 
313 aa  86.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 
310 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  26.83 
 
 
528 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2801  glycosyl transferase family 2  32.48 
 
 
328 aa  83.6  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2063  glycosyl transferase family 2  23.78 
 
 
321 aa  83.2  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  33.47 
 
 
307 aa  82.8  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4093  glycosyl transferase family 2  27.75 
 
 
296 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3433  glycosyl transferase family protein  29 
 
 
309 aa  81.3  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3998  glycosyl transferase family protein  32.29 
 
 
310 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.756459  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  26.74 
 
 
924 aa  81.3  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 
304 aa  77  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0926  glycosyl transferase family 2  30.4 
 
 
310 aa  76.6  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2573  glycosyl transferase family 2  27.56 
 
 
338 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0268  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 
323 aa  75.5  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  30.63 
 
 
300 aa  75.5  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 
312 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3281  glycosyl transferase family 2  21.94 
 
 
307 aa  74.7  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0893  glycosyl transferase family 2  42.19 
 
 
337 aa  73.9  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4453  glycosyl transferase family 2  43.36 
 
 
314 aa  72.8  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00986  glycosyl transferase, family 2  29.03 
 
 
303 aa  72.8  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0498062  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3347  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
308 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3392  glycosyl transferase family protein  25.35 
 
 
287 aa  72  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1449  glycosyl transferase family protein  28.75 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.192558  normal  0.0368416 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1299  glycosyl transferase family protein  31.62 
 
 
470 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0628268 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4928  glycosyl transferase family 2  31.97 
 
 
513 aa  70.9  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7656  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 
313 aa  70.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2800  glycosyl transferase family 2  38.71 
 
 
309 aa  70.9  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0441  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 
315 aa  70.5  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.266223  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0962  glycosyl transferase family protein  28.95 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153227  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  29.51 
 
 
477 aa  70.1  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2588  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 
306 aa  70.1  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2675  family 2 glycosyl transferase  28.93 
 
 
315 aa  69.7  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.384822 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  32 
 
 
544 aa  70.1  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0998  glycosyl transferase family 2  42.98 
 
 
312 aa  69.7  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565096 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0150  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
331 aa  69.7  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2753  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 
310 aa  69.3  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.8402 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
324 aa  68.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4122  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 
311 aa  68.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.408918  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1519  glycosyl transferase family protein  31.85 
 
 
310 aa  67.8  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0306  arylsulfatase  30.6 
 
 
1041 aa  67.8  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4811  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 
296 aa  67.8  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0562573  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5657  glycosyl transferase family 2  23.17 
 
 
303 aa  67.4  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.49465 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  23.71 
 
 
337 aa  67  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5057  glycosyl transferase family protein  31.47 
 
 
470 aa  67  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0379  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
891 aa  66.6  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3353  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
312 aa  66.6  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  28.14 
 
 
838 aa  66.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  27.64 
 
 
322 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3253  glycosyl transferase family 2  30.26 
 
 
305 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.24393  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  25.44 
 
 
340 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  28.09 
 
 
1340 aa  66.6  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4681  glycosyl transferase family protein  26.15 
 
 
345 aa  66.6  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627848  normal  0.36467 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5590  glycosyl transferase family 2  27.64 
 
 
328 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  27.49 
 
 
305 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  27.92 
 
 
321 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1981  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.22 
 
 
295 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.620324  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3033  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.22 
 
 
315 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186654  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3162  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.22 
 
 
315 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2904  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 
328 aa  64.7  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000158295 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1381  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.22 
 
 
302 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.247424  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1292  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.22 
 
 
315 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5508  glycosyl transferase family 2  33.47 
 
 
283 aa  64.7  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0164497  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2267  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.22 
 
 
315 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58247  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1003  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.22 
 
 
315 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4035  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 
344 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5644  glycosyl transferase family protein  30.91 
 
 
307 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223754  normal  0.273017 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 
623 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1075  WecB/TagA/CpsF family glycosyl transferase  29.91 
 
 
561 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.255325  normal  0.693925 
 
 
-
 
NC_002936  DET0203  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.45 
 
 
331 aa  63.2  0.000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.97495  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1076  glycosyl transferase family 2  27.56 
 
 
305 aa  63.2  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.647186  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2894  hypothetical protein  30.17 
 
 
316 aa  63.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0314909 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0345  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 
279 aa  63.2  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0405304 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4588  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 
307 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.151626  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  24.71 
 
 
260 aa  62.8  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3773  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 
484 aa  62.4  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1987  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.17 
 
 
333 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1386  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.17 
 
 
333 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.343804  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  30.51 
 
 
301 aa  62  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3039  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.17 
 
 
333 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2274  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.17 
 
 
333 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.102891  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1298  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.17 
 
 
333 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.472979  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1010  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.17 
 
 
333 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.374388  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0742  glycosyl transferase family 2  28.23 
 
 
281 aa  61.6  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.18736  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  31.67 
 
 
334 aa  61.6  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>