More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0441 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0441  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
315 aa  629  1e-179  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.266223  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2675  family 2 glycosyl transferase  50.48 
 
 
315 aa  289  4e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.384822 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  53.49 
 
 
598 aa  287  2e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7656  glycosyl transferase family 2  49.35 
 
 
313 aa  276  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6856  glycosyl transferase family 2  44.86 
 
 
328 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  50.32 
 
 
623 aa  265  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6733  glycosyl transferase family 2  44.37 
 
 
333 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3588  glycosyl transferase family 2  47.55 
 
 
337 aa  241  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.690536  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2677  glycosyl transferase family protein  48.12 
 
 
317 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3928  glycosyl transferase family 2  50 
 
 
532 aa  218  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3846  glycosyl transferase family protein  37.38 
 
 
311 aa  212  7.999999999999999e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7666  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  40.28 
 
 
1132 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0926  glycosyl transferase family 2  38.52 
 
 
310 aa  170  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2956  glycosyl transferase family 2  33.87 
 
 
319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0150  glycosyl transferase family protein  34.67 
 
 
331 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0203  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.59 
 
 
331 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.97495  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_191  group 2 glycosyl transferase  33.7 
 
 
322 aa  152  8e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.941219  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0540  glycosyl transferase family 2  36.43 
 
 
310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1063  glycosyl transferase family 2  34.89 
 
 
307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.991977 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3054  glycosyl transferase family protein  37.37 
 
 
305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2753  glycosyl transferase family 2  33.22 
 
 
310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.8402 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3253  glycosyl transferase family 2  39.09 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.24393  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3998  glycosyl transferase family protein  38.82 
 
 
310 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.756459  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  29.8 
 
 
310 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  28.52 
 
 
310 aa  105  7e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2107  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 
313 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2151  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 
313 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3433  glycosyl transferase family protein  29.47 
 
 
309 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  27.67 
 
 
308 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00986  glycosyl transferase, family 2  30.2 
 
 
303 aa  98.2  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0498062  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3874  glycosyl transferase family protein  29.27 
 
 
313 aa  96.7  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0495804  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  29.01 
 
 
312 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4093  glycosyl transferase family 2  27.42 
 
 
296 aa  93.2  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  32.16 
 
 
307 aa  87.8  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1651  glycosyl transferase family 2  27.43 
 
 
313 aa  87  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4122  glycosyl transferase family protein  27.95 
 
 
311 aa  86.3  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.408918  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1519  glycosyl transferase family protein  34.43 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0399  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 
454 aa  81.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  34.55 
 
 
924 aa  80.1  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0434  glycosyl transferase family 2  32.54 
 
 
460 aa  79.7  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3281  glycosyl transferase family 2  27.64 
 
 
307 aa  79  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  26.5 
 
 
316 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02588  Glycosyl transferase, family 2  26.56 
 
 
281 aa  77.4  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.156049  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2462  glycosyl transferase family 2  27.24 
 
 
421 aa  77  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.278728  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1581  glycosyl transferase family protein  32.81 
 
 
466 aa  72.8  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1123  glycosyl transferase family protein  29.65 
 
 
315 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0764134 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1075  WecB/TagA/CpsF family glycosyl transferase  31.56 
 
 
561 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.255325  normal  0.693925 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
304 aa  70.9  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0306  arylsulfatase  27.97 
 
 
1041 aa  69.7  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2971  glycosyl transferase family 2  26.72 
 
 
324 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2949  glycosyl transferase family 2  28.78 
 
 
392 aa  65.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2573  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 
338 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3930  glycosyl transferase family 2  32.24 
 
 
413 aa  65.9  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555455  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4811  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 
296 aa  65.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0562573  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  26.94 
 
 
528 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  28.85 
 
 
836 aa  64.3  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2680  glycosyl transferase family protein  31.91 
 
 
426 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2532  putative glycosyl transferase  27.75 
 
 
317 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.218216 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5280  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.04 
 
 
273 aa  63.2  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5124  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.04 
 
 
273 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5523  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.04 
 
 
273 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4914  glycosyl transferase family protein  30.66 
 
 
319 aa  62  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141789 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
544 aa  62  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2801  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 
328 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4538  glycosyl transferase family protein  28.26 
 
 
319 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3825  glycosyl transferase family protein  28.26 
 
 
319 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3699  glycosyl transferase family protein  28.26 
 
 
319 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.780358 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2480  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.07 
 
 
326 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0466  glycosyl transferase family protein  29.85 
 
 
302 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0600433  unclonable  0.0000113237 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3253  sulfatase  26.51 
 
 
1065 aa  60.8  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.189767  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2618  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.63 
 
 
326 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0913  putative glycosyltransferase  29.13 
 
 
1066 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193043  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  29.36 
 
 
748 aa  60.5  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
260 aa  60.1  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5677  group 2 family glycosyl transferase  28.22 
 
 
267 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2271  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 
319 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3353  glycosyl transferase family protein  29.38 
 
 
312 aa  59.7  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1366  glycosyl transferase family protein  26.82 
 
 
331 aa  59.3  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.959052  normal  0.0372616 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1960  glycosyl transferase family 2  32 
 
 
310 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3392  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 
287 aa  59.3  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1062  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 
318 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.851458 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1244  glycosyl transferase family 2  23.77 
 
 
328 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.161463 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1536  glycosyl transferase family 2  31.07 
 
 
238 aa  58.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1214  glycosyl transferase family 2  23.77 
 
 
328 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2856  family 2 glycosyl transferase  25.45 
 
 
326 aa  58.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  26.24 
 
 
233 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2241  glycosyl transferase family 2, involved in cell wall biogenesis  31.43 
 
 
310 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0118567  normal  0.43942 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  28.72 
 
 
1340 aa  57.4  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5551  glycosyl transferase family protein  28.32 
 
 
319 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  31.1 
 
 
841 aa  57.4  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  23.68 
 
 
722 aa  57.4  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  28.19 
 
 
838 aa  57  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0548  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.25 
 
 
315 aa  57  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3728  glycosyl transferase family protein  28.32 
 
 
319 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.703441  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1781  glycosyl transferase family 2  26.18 
 
 
326 aa  57.4  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.456914  normal  0.601286 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0308  glycosyltransferase  28.81 
 
 
309 aa  56.6  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2253  glycosyl transferase family 2  25.21 
 
 
331 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.628199  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2191  glycosyl transferase family 2  25.21 
 
 
331 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  21.19 
 
 
346 aa  57  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0428  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 
438 aa  56.2  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>