More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3846 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3846  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 311 aa  638    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  40.58 
 
 		 623 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0441  glycosyl transferase family 2  38.34 
 
 		 315 aa  205  9e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.266223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7656  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 		 313 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2675  family 2 glycosyl transferase  35.39 
 
 		 315 aa  196  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.384822 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6733  glycosyl transferase family 2  34.31 
 
 		 333 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  36.01 
 
 		 598 aa  178  8e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6856  glycosyl transferase family 2  34.73 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3588  glycosyl transferase family 2  33.64 
 
 		 337 aa  163  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.690536  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2956  glycosyl transferase family 2  30.28 
 
 		 319 aa  152  5.9999999999999996e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2677  glycosyl transferase family protein  32.81 
 
 		 317 aa  139  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0926  glycosyl transferase family 2  30.83 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0540  glycosyl transferase family 2  32.64 
 
 		 310 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0150  glycosyl transferase family protein  31.23 
 
 		 331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2753  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 310 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.8402 
 
 
-
 
NC_002936  DET0203  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.51 
 
 		 331 aa  124  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.97495  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3928  glycosyl transferase family 2  34.18 
 
 		 532 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_191  group 2 glycosyl transferase  32.92 
 
 		 322 aa  124  3e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.941219  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1063  glycosyl transferase family 2  27.83 
 
 		 307 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.991977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7666  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  30.36 
 
 		 1132 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  30.12 
 
 		 310 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 		 924 aa  91.3  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3054  glycosyl transferase family protein  31.65 
 
 		 305 aa  89.7  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3253  glycosyl transferase family 2  31.4 
 
 		 305 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.24393  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2151  glycosyl transferase family 2  31.17 
 
 		 313 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2107  glycosyl transferase family 2  31.17 
 
 		 313 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3874  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0495804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  24.23 
 
 		 308 aa  79  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3433  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  29.15 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2573  glycosyl transferase family 2  29.71 
 
 		 338 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4122  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 311 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.408918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4093  glycosyl transferase family 2  26.56 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  27.04 
 
 		 316 aa  69.3  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  30.37 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1651  glycosyl transferase family 2  25.91 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  31.13 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2971  glycosyl transferase family 2  26.95 
 
 		 324 aa  65.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 		 344 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 		 344 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  29.67 
 
 		 477 aa  64.3  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3998  glycosyl transferase family protein  25.23 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.756459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 		 748 aa  63.5  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00986  glycosyl transferase, family 2  26.75 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0498062  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0804  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 		 725 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16838 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3393  glycosyl transferase family protein  34.65 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  25.71 
 
 		 754 aa  62  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  27.47 
 
 		 710 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  26.14 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  24.65 
 
 		 857 aa  61.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 		 725 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  30.14 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2885  glycosyl transferase family protein  29.65 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.418881  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.5 
 
 		 610 aa  58.5  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0769  glycosyl transferase family 2  27.57 
 
 		 732 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.034944 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 		 662 aa  58.9  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 		 367 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 		 709 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2048  glycosyl transferase family protein  38.54 
 
 		 553 aa  57.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 		 709 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2255  glycosyl transferase, group 1/glycosyl transferase, group 2  27.15 
 
 		 740 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1662  glycosyl transferase family protein  28.23 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.363785  hitchhiker  0.00433752 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5438  N-acetylglucosaminyltransferase  28.91 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 		 301 aa  57  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1024  glycosyl transferase, group 2  27.27 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.431041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  29 
 
 		 838 aa  57.8  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1818  glycosyl transferase family protein  25.59 
 
 		 335 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  26.47 
 
 		 617 aa  56.6  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2949  glycosyl transferase family 2  28.85 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 728 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  25.66 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  26.89 
 
 		 461 aa  55.8  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  25.86 
 
 		 717 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2943  glycosyl transferase family 2  26.91 
 
 		 332 aa  55.8  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  33.04 
 
 		 785 aa  55.8  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  27.63 
 
 		 792 aa  55.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  26.55 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0217  glycosyl transferase family protein  34.09 
 
 		 409 aa  55.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  27.92 
 
 		 422 aa  55.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0434  glycosyl transferase family 2  30.51 
 
 		 460 aa  55.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2801  glycosyl transferase family 2  24.36 
 
 		 328 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  25.82 
 
 		 233 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  22.84 
 
 		 1334 aa  55.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02588  Glycosyl transferase, family 2  22.59 
 
 		 281 aa  55.5  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.156049  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  33.61 
 
 		 289 aa  55.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  27.97 
 
 		 355 aa  55.1  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.08 
 
 		 351 aa  54.7  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000526958 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  22.61 
 
 		 321 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0245  glycosyl transferase family 2  28.91 
 
 		 380 aa  54.7  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  25.43 
 
 		 717 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  25.1 
 
 		 305 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 		 333 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1578  cell wall membrane glycosyltransferase  33.66 
 
 		 349 aa  53.9  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  29.61 
 
 		 268 aa  54.3  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1355  glycosyl transferase family protein  33.05 
 
 		 310 aa  53.9  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  26.82 
 
 		 311 aa  53.9  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  23.12 
 
 		 321 aa  53.5  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3219  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 		 314 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5165  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  33.33 
 
 		 1168 aa  53.5  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.390829 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>