More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0775 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 617 aa  1256    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  41.94 
 
 		 733 aa  341  2e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  45.06 
 
 		 710 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  45.95 
 
 		 775 aa  324  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  37.04 
 
 		 958 aa  323  4e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  39.65 
 
 		 721 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  42.4 
 
 		 717 aa  317  5e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  45.16 
 
 		 728 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0852  glycosyl transferase family protein  38.02 
 
 		 765 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  30.97 
 
 		 1334 aa  311  2e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  32.64 
 
 		 709 aa  310  5e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  32.64 
 
 		 709 aa  310  5e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  41.71 
 
 		 717 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  36.23 
 
 		 1275 aa  306  6e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  40.22 
 
 		 602 aa  302  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  35.83 
 
 		 723 aa  300  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  34.44 
 
 		 731 aa  298  2e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1792  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.4 
 
 		 809 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  39.22 
 
 		 1486 aa  296  5e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  33.21 
 
 		 632 aa  296  6e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  33.57 
 
 		 625 aa  294  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  33.57 
 
 		 625 aa  294  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  34.5 
 
 		 1509 aa  290  7e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  38.31 
 
 		 625 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0354  glycosyl transferase family protein  32.5 
 
 		 658 aa  286  7e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  34.24 
 
 		 1152 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  34.82 
 
 		 1067 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  32.21 
 
 		 1152 aa  280  6e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  33.51 
 
 		 1644 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  33.51 
 
 		 1644 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0929  glycosyl transferase family protein  38.27 
 
 		 796 aa  272  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  38.89 
 
 		 808 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.4 
 
 		 1561 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.04 
 
 		 610 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  30.76 
 
 		 996 aa  267  5e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4883  glycosyl transferase family protein  37.39 
 
 		 653 aa  260  6e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830469  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  34.29 
 
 		 1182 aa  260  6e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0729  glycosyl transferase family protein  33.51 
 
 		 586 aa  259  9e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155064  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  36.69 
 
 		 988 aa  259  1e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1842  glycosyl transferase family 2  38.77 
 
 		 531 aa  259  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  38.32 
 
 		 729 aa  258  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  38.12 
 
 		 684 aa  257  4e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  39.2 
 
 		 635 aa  256  7e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  33.86 
 
 		 746 aa  255  2.0000000000000002e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1841  glycosyl transferase family 2  39.82 
 
 		 652 aa  253  6e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  35.92 
 
 		 1359 aa  246  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  36.22 
 
 		 832 aa  244  1.9999999999999999e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4005  glycosyl transferase family 2  35.06 
 
 		 790 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0600  glycosyl transferase family 2  37.44 
 
 		 684 aa  243  7e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149205 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  45.9 
 
 		 670 aa  243  7.999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  41.54 
 
 		 662 aa  238  3e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0563  glycosyl transferase family 2  37.68 
 
 		 555 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.158623 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3207  glycosyl transferase family protein  33.79 
 
 		 576 aa  234  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  36.76 
 
 		 632 aa  230  5e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2009  glycosyl transferase  30.95 
 
 		 810 aa  229  8e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0422  glycosyl transferase family protein  33.75 
 
 		 1297 aa  228  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4882  glycosyl transferase family protein  37.74 
 
 		 526 aa  228  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.763618  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  35.87 
 
 		 880 aa  227  5.0000000000000005e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  33.96 
 
 		 1991 aa  227  6e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  38.92 
 
 		 1759 aa  227  6e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1971  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 		 1084 aa  226  7e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0599  glycosyl transferase family 2  36.48 
 
 		 551 aa  226  8e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  33.27 
 
 		 742 aa  226  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  31.87 
 
 		 983 aa  225  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0804  glycosyl transferase family 2  34.7 
 
 		 725 aa  224  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16838 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  34.59 
 
 		 725 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0769  glycosyl transferase family 2  34.22 
 
 		 732 aa  220  6e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.034944 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  32.51 
 
 		 742 aa  219  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0588  glycosyl transferase family protein  34.67 
 
 		 551 aa  219  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3488  glycosyl transferase family protein  37.19 
 
 		 539 aa  218  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  32.39 
 
 		 742 aa  217  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0236  hypothetical protein  29.07 
 
 		 783 aa  212  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000717832  normal  0.75423 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2052  glycosyl transferase family 2  33.57 
 
 		 794 aa  205  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.039975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  28.24 
 
 		 857 aa  204  5e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1062  glycosyl transferase family protein  32.45 
 
 		 783 aa  203  8e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2613  glycosyl transferase family protein  32.86 
 
 		 556 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  29.64 
 
 		 958 aa  196  8.000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0725  glycosyl transferase family protein  29.34 
 
 		 734 aa  193  7e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.492928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1508  glycosyl transferase family protein  31.1 
 
 		 1198 aa  182  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  28.33 
 
 		 1188 aa  179  9e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0548  glycosyl transferase family protein  32.81 
 
 		 784 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  31.74 
 
 		 2046 aa  171  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1529  glycosyl transferase family 2  38.91 
 
 		 748 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1946  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.11 
 
 		 1191 aa  162  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3469  glycosyl transferase family protein  26.05 
 
 		 1190 aa  162  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2886  glycosyl transferase family 2  28.11 
 
 		 1213 aa  162  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.242978  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1918  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.68 
 
 		 1173 aa  157  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1517  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 		 974 aa  154  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3468  glycosyl transferase family protein  30.75 
 
 		 968 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4280  hypothetical protein  30.6 
 
 		 1171 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2650  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 		 1177 aa  150  5e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06183  O-antigen biosynthesis protein  29.87 
 
 		 1165 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00444077  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00983  O-antigen biosynthesis protein  29.87 
 
 		 1165 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2593  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 1187 aa  149  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.842346  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2031  glycosyltransferase  37.69 
 
 		 1003 aa  147  5e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3712  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 		 965 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1947  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.18 
 
 		 968 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50300  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1694 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0552832  decreased coverage  0.000853187 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4009  glycosyl transferase, group 1  31.98 
 
 		 1386 aa  144  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0638  glycosyltransferase  34.46 
 
 		 972 aa  142  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.770569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>