More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1776 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 311 aa  644    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  95.5 
 
 		 311 aa  579  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2467  glycosyl transferase family protein  52.92 
 
 		 322 aa  306  3e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  41.72 
 
 		 328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  35.94 
 
 		 315 aa  132  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01307  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  34.11 
 
 		 326 aa  129  8.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2333  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 		 327 aa  125  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.012677  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05340  Glycosyl transferase, family 2  34.43 
 
 		 321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000520172  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1198  glycosyl transferase family protein  31.93 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2017  glycosyl transferase family protein  34.36 
 
 		 322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  33.83 
 
 		 477 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  25.69 
 
 		 337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  27.7 
 
 		 528 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0119  glycosyl transferase family protein  32.98 
 
 		 232 aa  94.4  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  31.41 
 
 		 233 aa  94  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2580  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 		 277 aa  93.2  5e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000593359  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2111  glycosyl transferase family 2  34.17 
 
 		 236 aa  87.8  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  40.95 
 
 		 236 aa  86.3  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1366  glycosyl transferase family protein  33.68 
 
 		 247 aa  85.9  7e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  31 
 
 		 479 aa  83.6  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3463  glycosyl transferase family protein  27.18 
 
 		 332 aa  82.4  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0230104  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  28.39 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  25.76 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1536  glycosyl transferase family 2  30.81 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 		 924 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  30.04 
 
 		 479 aa  81.3  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1818  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 		 335 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 		 345 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  31.91 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1078  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 		 232 aa  79  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892634  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1256  glycosyl transferase family protein  30.81 
 
 		 240 aa  79  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000223583  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2046  glycosyl transferase family 2  28.64 
 
 		 341 aa  77.4  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2011  glycosyl transferase family 2  25.75 
 
 		 335 aa  77.4  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.814426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  27.96 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  25.34 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  30.05 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  27.15 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0487  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4035  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 		 344 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  30.05 
 
 		 841 aa  75.9  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 		 544 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3442  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.15 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.184184  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 		 340 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  30.32 
 
 		 233 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  30.46 
 
 		 1035 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3434  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.15 
 
 		 253 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  26.09 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1461  glycosyl transferase family 2  32.63 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  29.21 
 
 		 481 aa  73.9  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  27.93 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  25.15 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3182  glycosyl transferase family 2  33.14 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3169  glycosyl transferase family 2  28.64 
 
 		 344 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1376  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.36 
 
 		 369 aa  72.4  0.000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3205  glycosyltransferase  28.64 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150696  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1200  glycosyl transferase family 2  39.29 
 
 		 237 aa  72  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3446  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.64 
 
 		 253 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 		 785 aa  71.6  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3045  glycosyl transferase family protein  40.43 
 
 		 305 aa  72.4  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.144194  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0430  glycosyl transferase family 2  31.09 
 
 		 473 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3553  glycosyl transferase family 2  28.09 
 
 		 619 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0189873  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1791  b-glycosyltransferase  27.23 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4914  family 2 glycosyl transferase  29.09 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3232  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.14 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0263281  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  37.84 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3301  family 2 glycosyl transferase  29.53 
 
 		 469 aa  70.5  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144563  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4024  glycosyl transferase family protein  25.77 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3138  glycosyltransferase  28.14 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259725  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  26.9 
 
 		 461 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0353  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000439981  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  27.64 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  29.61 
 
 		 753 aa  70.5  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4464  glycosyl transferase family 2  27.7 
 
 		 335 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.1 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0681  glycosyl transferase family 2  30.47 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  30.39 
 
 		 344 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  30.39 
 
 		 344 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3459  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.14 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0198533  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3023  glycosyl transferase family 2  45.45 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1813  glycosyl transferase family protein  26.05 
 
 		 362 aa  69.3  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  25.91 
 
 		 475 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  28.83 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  25.91 
 
 		 475 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1552  glycosyl transferase family 2  29.51 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3115  glycosyl transferase family 2  34.15 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1777  glycosyl transferase family 2  36.19 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0109155 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1850  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 362 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0670  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.996244 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1549  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0584416  normal  0.851188 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1651  glycosyl transferase family 2  26.37 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3745  glycosyl transferase family 2  27.48 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0508  glycosyl transferase family protein  24.88 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.239818  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  30 
 
 		 792 aa  67.4  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0354  glycosyl transferase family 2  25.76 
 
 		 331 aa  67  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  39.18 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1274  glycosyl transferase family 2  25.49 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  24.58 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>