More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0804 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  96.14 
 
 
725 aa  1293    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  53.25 
 
 
742 aa  662    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0769  glycosyl transferase family 2  80.9 
 
 
732 aa  1113    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.034944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0804  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
725 aa  1431    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16838 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  53.11 
 
 
742 aa  641    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  54.42 
 
 
742 aa  644    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  33.68 
 
 
1486 aa  328  2.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  34.95 
 
 
1152 aa  321  3e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  35.01 
 
 
1152 aa  321  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  37.13 
 
 
1275 aa  310  8e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 
632 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  34.02 
 
 
733 aa  302  1e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  36.16 
 
 
709 aa  302  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  36.16 
 
 
709 aa  302  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  33.16 
 
 
746 aa  300  5e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  36.22 
 
 
625 aa  300  6e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  36.22 
 
 
625 aa  300  6e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  32.53 
 
 
1067 aa  300  8e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  34.8 
 
 
625 aa  293  6e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0852  glycosyl transferase family protein  31.18 
 
 
765 aa  293  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0725  glycosyl transferase family protein  34.53 
 
 
734 aa  291  2e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.492928  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  33.91 
 
 
723 aa  289  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  35.57 
 
 
832 aa  286  1.0000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  27.94 
 
 
958 aa  285  3.0000000000000004e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  29.79 
 
 
1334 aa  285  3.0000000000000004e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  28.71 
 
 
731 aa  283  8.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  34.2 
 
 
857 aa  282  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.09 
 
 
1561 aa  278  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 
1509 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  34.02 
 
 
721 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  35.24 
 
 
988 aa  273  6e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  35.09 
 
 
1182 aa  273  9e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  31.94 
 
 
1991 aa  272  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  34.41 
 
 
717 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  35.23 
 
 
983 aa  267  5e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 
996 aa  267  5e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  34.79 
 
 
1644 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  34.79 
 
 
1644 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  35.02 
 
 
710 aa  263  8e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  35.78 
 
 
775 aa  259  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  33.38 
 
 
717 aa  257  5e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0354  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 
658 aa  254  5.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  34.66 
 
 
728 aa  248  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  34.5 
 
 
880 aa  244  3e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4005  glycosyl transferase family 2  31.62 
 
 
790 aa  242  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318857  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  33.16 
 
 
602 aa  240  8e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  34.17 
 
 
617 aa  238  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2052  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 
794 aa  231  5e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.039975  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.53 
 
 
610 aa  229  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  36.42 
 
 
684 aa  225  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  28.97 
 
 
2046 aa  225  3e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0236  hypothetical protein  28.87 
 
 
783 aa  224  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000717832  normal  0.75423 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1971  glycosyl transferase family 2  33.02 
 
 
1084 aa  222  1.9999999999999999e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0600  glycosyl transferase family 2  36.66 
 
 
684 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.149205 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4883  glycosyl transferase family protein  34.35 
 
 
653 aa  210  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830469  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  36.38 
 
 
670 aa  209  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2009  glycosyl transferase  28.02 
 
 
810 aa  208  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1841  glycosyl transferase family 2  34.97 
 
 
652 aa  205  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0422  glycosyl transferase family protein  32.02 
 
 
1297 aa  203  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1842  glycosyl transferase family 2  34.55 
 
 
531 aa  195  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4882  glycosyl transferase family protein  36.96 
 
 
526 aa  195  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.763618  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  32.85 
 
 
1359 aa  195  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  37.97 
 
 
635 aa  194  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3488  glycosyl transferase family protein  36.26 
 
 
539 aa  192  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2613  glycosyl transferase family protein  31.56 
 
 
556 aa  192  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2886  glycosyl transferase family 2  31.78 
 
 
1213 aa  191  4e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.242978  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1792  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.14 
 
 
809 aa  191  5e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0729  glycosyl transferase family protein  29.87 
 
 
586 aa  191  5e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155064  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  33.94 
 
 
662 aa  189  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0563  glycosyl transferase family 2  35.1 
 
 
555 aa  189  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.158623 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  34.51 
 
 
1759 aa  188  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0588  glycosyl transferase family protein  36.5 
 
 
551 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0599  glycosyl transferase family 2  35.45 
 
 
551 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  34.14 
 
 
808 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0929  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 
796 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  31.36 
 
 
958 aa  173  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3633  glycosyl transferase, group 1  33.41 
 
 
510 aa  170  7e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.015452  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3207  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 
576 aa  170  9e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  34.35 
 
 
729 aa  167  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1529  glycosyl transferase family 2  24.63 
 
 
748 aa  157  8e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  29.78 
 
 
632 aa  156  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1508  glycosyl transferase family protein  29.4 
 
 
1198 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3720  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 
1193 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  25.31 
 
 
1188 aa  146  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50300  hypothetical protein  28.62 
 
 
1694 aa  146  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0552832  decreased coverage  0.000853187 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1062  glycosyl transferase family protein  36.6 
 
 
783 aa  138  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1946  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.51 
 
 
1191 aa  137  8e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4280  hypothetical protein  29.77 
 
 
1171 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1482  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
1162 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345967  normal  0.675162 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4009  glycosyl transferase, group 1  36.07 
 
 
1386 aa  135  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3469  glycosyl transferase family protein  27.45 
 
 
1190 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65715  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1476  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 
1192 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.891442 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2031  glycosyltransferase  30.93 
 
 
1003 aa  131  4.0000000000000003e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3348  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 
1074 aa  128  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0861977  normal  0.0615574 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1517  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
974 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206981  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  32.3 
 
 
2401 aa  126  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  24.62 
 
 
872 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1974  glycosyl transferase family 2  33.58 
 
 
853 aa  122  3e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  31.85 
 
 
525 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00983  O-antigen biosynthesis protein  29.55 
 
 
1165 aa  121  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>