More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1651 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1651  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
313 aa  648    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  33.47 
 
 
312 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
310 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4122  glycosyl transferase family protein  34.44 
 
 
311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.408918  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3281  glycosyl transferase family 2  31.33 
 
 
307 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  32.74 
 
 
316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3433  glycosyl transferase family protein  36.02 
 
 
309 aa  126  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  33.48 
 
 
310 aa  119  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  29.34 
 
 
308 aa  112  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4093  glycosyl transferase family 2  27.4 
 
 
296 aa  112  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0428  glycosyl transferase family 2  36.44 
 
 
438 aa  112  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2107  glycosyl transferase family 2  31.65 
 
 
313 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2151  glycosyl transferase family 2  31.65 
 
 
313 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3874  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 
313 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0495804  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1519  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 
310 aa  97.8  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1586  glycosyl transferase family protein  34.15 
 
 
444 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.807446  normal  0.639173 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  32.88 
 
 
924 aa  96.3  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3253  glycosyl transferase family 2  27.46 
 
 
305 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.24393  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0269  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
335 aa  93.2  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  28.81 
 
 
307 aa  92.8  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3930  glycosyl transferase family 2  35.11 
 
 
413 aa  91.3  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555455  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  31.02 
 
 
477 aa  90.9  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2573  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 
338 aa  90.9  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0399  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
454 aa  90.5  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1449  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 
321 aa  90.5  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.192558  normal  0.0368416 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2956  glycosyl transferase family 2  30.51 
 
 
319 aa  90.1  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2904  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 
328 aa  89.7  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000158295 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3353  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
312 aa  88.6  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3054  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 
305 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0868  glycosyl transferase family 2  27.56 
 
 
331 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00986  glycosyl transferase, family 2  28.83 
 
 
303 aa  87  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0498062  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  29.64 
 
 
598 aa  86.7  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  26.76 
 
 
528 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4035  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 
344 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0926  glycosyl transferase family 2  27.43 
 
 
310 aa  82.4  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  26.95 
 
 
236 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0268  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
323 aa  80.1  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0540  glycosyl transferase family 2  28.12 
 
 
310 aa  80.5  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3253  sulfatase  24.28 
 
 
1065 aa  79.7  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.189767  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3169  glycosyl transferase family 2  28.81 
 
 
344 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  24.89 
 
 
337 aa  79  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2675  family 2 glycosyl transferase  29.14 
 
 
315 aa  79  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.384822 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0150  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 
331 aa  78.2  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1581  glycosyl transferase family protein  29.84 
 
 
466 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2765  glycosyl transferase family protein  24.89 
 
 
626 aa  76.6  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  28.22 
 
 
333 aa  76.6  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 
892 aa  76.3  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 
235 aa  75.9  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7656  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 
313 aa  75.9  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1063  glycosyl transferase family 2  28.22 
 
 
307 aa  75.1  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.991977 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1123  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 
315 aa  75.5  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0764134 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0441  glycosyl transferase family 2  27.43 
 
 
315 aa  75.1  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.266223  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.61 
 
 
610 aa  74.7  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3998  glycosyl transferase family protein  27.71 
 
 
310 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.756459  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  27.11 
 
 
703 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1200  glycosyl transferase family 2  29.83 
 
 
237 aa  75.1  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  27.03 
 
 
824 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 
623 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2856  family 2 glycosyl transferase  28.51 
 
 
326 aa  74.7  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0306  arylsulfatase  24.3 
 
 
1041 aa  73.2  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1742  glycosyltransferase  32.56 
 
 
281 aa  73.2  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02588  Glycosyl transferase, family 2  28.41 
 
 
281 aa  72.8  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.156049  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6856  glycosyl transferase family 2  28.16 
 
 
328 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2677  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 
317 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1100  glycosyl transferase family 2  27.39 
 
 
316 aa  72.4  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  32.77 
 
 
327 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.77 
 
 
327 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.77 
 
 
327 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
328 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.93 
 
 
327 aa  71.2  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.93 
 
 
327 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  24.78 
 
 
754 aa  71.2  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  31.93 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  31.93 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0912  b-glycosyltransferase  24.6 
 
 
334 aa  70.9  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.780532  normal  0.895852 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2680  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 
426 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0203  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.69 
 
 
331 aa  70.1  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.97495  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4681  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 
345 aa  70.1  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627848  normal  0.36467 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3928  glycosyl transferase family 2  30.12 
 
 
532 aa  70.1  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  35.04 
 
 
1157 aa  70.5  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  25.46 
 
 
344 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  39.13 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4125  glycosyl transferase family protein  24.38 
 
 
322 aa  69.7  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0962  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.153227  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  25.46 
 
 
344 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
1035 aa  69.7  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2462  glycosyl transferase family 2  26.69 
 
 
421 aa  69.7  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.278728  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2753  glycosyl transferase family 2  28.05 
 
 
310 aa  69.3  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.8402 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  24.88 
 
 
305 aa  69.3  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2532  putative glycosyl transferase  27.92 
 
 
317 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.218216 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 
748 aa  68.9  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1366  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 
331 aa  68.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.959052  normal  0.0372616 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  39.56 
 
 
390 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4024  glycosyl transferase family protein  25.68 
 
 
322 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3347  glycosyl transferase family protein  25.91 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  26.09 
 
 
428 aa  67.8  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4958  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0168842 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  26.37 
 
 
311 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_191  group 2 glycosyl transferase  29.08 
 
 
322 aa  67.8  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.941219  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  28.5 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.231634 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>