More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2889 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  100 
 
 
316 aa  657    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3281  glycosyl transferase family 2  44.9 
 
 
307 aa  256  3e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1651  glycosyl transferase family 2  32.74 
 
 
313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  30.47 
 
 
310 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4122  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
311 aa  112  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.408918  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  28.42 
 
 
312 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  31.69 
 
 
308 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00986  glycosyl transferase, family 2  29.01 
 
 
303 aa  101  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0498062  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3433  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
309 aa  95.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.503328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3353  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 
312 aa  95.5  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4531  family 2 glycosyl transferase  30 
 
 
310 aa  94.7  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1519  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
310 aa  93.6  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  26.15 
 
 
307 aa  92  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2151  glycosyl transferase family 2  26.61 
 
 
313 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2107  glycosyl transferase family 2  26.61 
 
 
313 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  23.03 
 
 
304 aa  90.9  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4093  glycosyl transferase family 2  25.58 
 
 
296 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1586  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 
444 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.807446  normal  0.639173 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3874  glycosyl transferase family protein  26.47 
 
 
313 aa  90.1  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0495804  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3253  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 
305 aa  89.7  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.24393  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0399  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
454 aa  89  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  28.96 
 
 
623 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0428  glycosyl transferase family 2  28.82 
 
 
438 aa  88.2  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 
924 aa  87.8  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  28.64 
 
 
333 aa  83.6  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2949  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
392 aa  83.2  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  25.83 
 
 
325 aa  81.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0868  glycosyl transferase family 2  27.08 
 
 
331 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0308  glycosyltransferase  25.6 
 
 
309 aa  81.3  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3219  glycosyl transferase family 2  27.95 
 
 
314 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0926  glycosyl transferase family 2  27.66 
 
 
310 aa  80.1  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3930  glycosyl transferase family 2  29.65 
 
 
413 aa  80.5  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555455  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2573  glycosyl transferase family 2  28.33 
 
 
338 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3169  glycosyl transferase family 2  26.7 
 
 
344 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2753  glycosyl transferase family 2  24.6 
 
 
310 aa  80.1  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.8402 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4811  glycosyl transferase family protein  25.61 
 
 
296 aa  80.1  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0562573  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3054  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 
305 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2970  glycosyl transferase family 2  33.83 
 
 
322 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0518  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 
341 aa  78.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  25.45 
 
 
305 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  25.56 
 
 
841 aa  77  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0540  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 
310 aa  77  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0379  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 
891 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  33.61 
 
 
362 aa  75.5  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  34.38 
 
 
1157 aa  74.7  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2956  glycosyl transferase family 2  25.21 
 
 
319 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0306  arylsulfatase  24.51 
 
 
1041 aa  74.3  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1552  glycosyl transferase family 2  26.73 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5156  family 2 glycosyl transferase  33.98 
 
 
216 aa  74.7  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3253  sulfatase  26.29 
 
 
1065 aa  75.1  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.189767  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1913  glycosyl transferase family 2  34.23 
 
 
286 aa  73.9  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3588  glycosyl transferase family 2  25.78 
 
 
337 aa  73.6  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.690536  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0912  b-glycosyltransferase  23.56 
 
 
334 aa  73.6  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.780532  normal  0.895852 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1442  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  34.26 
 
 
325 aa  73.2  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3392  glycosyl transferase family protein  26.15 
 
 
287 aa  73.2  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3738  glycosyl transferase family 2  31.62 
 
 
279 aa  73.2  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1818  glycosyl transferase family protein  27.13 
 
 
335 aa  72.8  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1154  glycosyl transferase family 2  33.61 
 
 
217 aa  72.4  0.000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4143  glycosyl transferase family protein  32.43 
 
 
291 aa  72.4  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.89997 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2971  glycosyl transferase family 2  24.26 
 
 
324 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  32.17 
 
 
301 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1842  glycosyl transferase family 2  36.17 
 
 
884 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  23.19 
 
 
315 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1449  glycosyl transferase family protein  39.81 
 
 
321 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.192558  normal  0.0368416 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2562  succinoglycan biosynthesis protein exoM  25.71 
 
 
326 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1581  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
466 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  25.65 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  41.94 
 
 
544 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 
311 aa  70.5  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0263  glycosyl transferase family protein  32.5 
 
 
341 aa  70.1  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 
824 aa  70.5  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1415  glycosyl transferase family protein  35.51 
 
 
312 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435994 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3933  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.5 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2904  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 
328 aa  70.1  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000158295 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3690  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.5 
 
 
329 aa  70.1  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1221  glycosyl transferase family protein  25.71 
 
 
326 aa  70.1  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.112085  normal  0.287305 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  25.12 
 
 
528 aa  70.1  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3791  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  35.24 
 
 
317 aa  69.7  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3187  glycosyl transferase family protein  24.83 
 
 
333 aa  69.7  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0795878  hitchhiker  0.00955476 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4035  glycosyl transferase family protein  25.45 
 
 
344 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1700  glycosyl transferase family protein  34.58 
 
 
312 aa  69.3  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0275555 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1106  glycosyl transferase  32.35 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.648038  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5040  glycosyl transferase family 2  26.73 
 
 
323 aa  69.3  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.0567661 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2371  glycosyltransferase  26.97 
 
 
326 aa  69.3  0.00000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  28.49 
 
 
327 aa  69.3  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  34.71 
 
 
300 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4958  glycosyl transferase family protein  25.45 
 
 
309 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0168842 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08131  glycosyl transferase family protein  26.11 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  23.71 
 
 
337 aa  67.8  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  26.26 
 
 
322 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  25.41 
 
 
1015 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3029  glycosyl transferase family protein  37.25 
 
 
293 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1407  putative glycosyl transferase  30.58 
 
 
243 aa  67.4  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  26.7 
 
 
703 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7656  glycosyl transferase family 2  25.31 
 
 
313 aa  67  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3998  glycosyl transferase family protein  24.77 
 
 
310 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.756459  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.07 
 
 
327 aa  67  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.07 
 
 
327 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3347  glycosyl transferase family protein  23.96 
 
 
308 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>