More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_06120 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  67.31 
 
 		 822 aa  1114    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  53.68 
 
 		 841 aa  853    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  54.18 
 
 		 836 aa  828    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  100 
 
 		 838 aa  1679    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  37.7 
 
 		 841 aa  496  1e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0418  hypothetical protein  50.25 
 
 		 462 aa  389  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.510346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2676  glycosyl transferase, group 1  41.37 
 
 		 569 aa  289  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2744  glycosyl transferase, group 1  41.37 
 
 		 568 aa  284  6.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0287035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2758  glycosyl transferase, group 1  37.88 
 
 		 627 aa  255  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  33.24 
 
 		 355 aa  173  1e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  30.52 
 
 		 320 aa  157  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  32.09 
 
 		 350 aa  150  7e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  30.79 
 
 		 353 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  33.99 
 
 		 341 aa  147  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 359 aa  141  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  31.48 
 
 		 348 aa  141  6e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  32.03 
 
 		 337 aa  140  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  28.71 
 
 		 358 aa  137  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  34.3 
 
 		 302 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 		 346 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  32.32 
 
 		 318 aa  130  9.000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  32.35 
 
 		 337 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  35.81 
 
 		 291 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  36.04 
 
 		 282 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  34.13 
 
 		 340 aa  129  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  34.55 
 
 		 283 aa  128  5e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 		 321 aa  127  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 		 345 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4006  glycosyl transferase family 2  34.9 
 
 		 342 aa  124  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2173  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 		 337 aa  124  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  36.52 
 
 		 1340 aa  123  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 		 298 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  28.15 
 
 		 338 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  35.45 
 
 		 2401 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  31.2 
 
 		 279 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  29.13 
 
 		 336 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1328  glycosyl transferase family protein  34.72 
 
 		 332 aa  119  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  34.09 
 
 		 288 aa  119  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 294 aa  118  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  31.38 
 
 		 703 aa  117  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  34.55 
 
 		 291 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  31 
 
 		 322 aa  115  3e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2362  glycosyl transferase family 2  35.81 
 
 		 335 aa  115  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  33.62 
 
 		 322 aa  115  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6387  glycosyl transferase family 2  29.19 
 
 		 340 aa  115  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0741751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  29.21 
 
 		 314 aa  114  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0818  hypothetical protein  27.3 
 
 		 339 aa  114  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  30.42 
 
 		 331 aa  114  9e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  28.68 
 
 		 330 aa  114  9e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0843  hypothetical protein  27.3 
 
 		 339 aa  113  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1748  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 		 300 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  28.73 
 
 		 325 aa  112  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3682  glycosyl transferase family protein  36.64 
 
 		 330 aa  113  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.735798  normal  0.011793 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 		 994 aa  112  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  30.63 
 
 		 305 aa  111  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3095  glycosyl transferase family 2  32.58 
 
 		 337 aa  111  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0262384  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  32.9 
 
 		 336 aa  110  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  26.85 
 
 		 307 aa  110  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  30.32 
 
 		 303 aa  110  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  31.3 
 
 		 284 aa  109  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  30.4 
 
 		 286 aa  109  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  31.68 
 
 		 378 aa  109  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  27.99 
 
 		 358 aa  109  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  32.42 
 
 		 282 aa  108  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  32.17 
 
 		 345 aa  108  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0426  glycosyl transferase family protein  33.73 
 
 		 366 aa  109  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0815896  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  35.59 
 
 		 340 aa  108  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 		 1106 aa  108  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  32.88 
 
 		 1267 aa  107  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  28.06 
 
 		 305 aa  107  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0054  glycosyl transferase family 2  31.67 
 
 		 557 aa  107  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 312 aa  107  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 		 300 aa  107  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  33.21 
 
 		 337 aa  106  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 		 308 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  27.42 
 
 		 313 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 329 aa  106  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 		 824 aa  105  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 		 401 aa  105  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1753  glycosyl transferase family protein  25.87 
 
 		 297 aa  105  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.625707 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0564  glycosyl transferase family protein  26.35 
 
 		 330 aa  105  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  26.39 
 
 		 346 aa  105  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  32.53 
 
 		 1267 aa  105  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2920  glycosyl transferase family protein  26.39 
 
 		 339 aa  104  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  27.55 
 
 		 1739 aa  103  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  30.21 
 
 		 311 aa  103  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.51 
 
 		 311 aa  103  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0313  rhamnosyl transferase related protein  30.29 
 
 		 342 aa  103  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0691397 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0792  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 		 376 aa  103  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.77414 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  30.32 
 
 		 290 aa  103  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  32.13 
 
 		 308 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  30.47 
 
 		 328 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  28.57 
 
 		 320 aa  103  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4025  glycosyl transferase family protein  30.38 
 
 		 346 aa  102  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  31.02 
 
 		 334 aa  102  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2348  glycosyl transferase  34.31 
 
 		 1837 aa  102  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  34 
 
 		 683 aa  100  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06130  predicted glycosyltransferase  33.2 
 
 		 323 aa  100  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134894  normal  0.704926 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  32.78 
 
 		 299 aa  100  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  28.45 
 
 		 892 aa  99.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>