More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0759 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
340 aa  681    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  64.53 
 
 
329 aa  421  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  64.4 
 
 
313 aa  389  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  50.33 
 
 
317 aa  280  3e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  45.66 
 
 
714 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  45.45 
 
 
334 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  35.84 
 
 
324 aa  176  7e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  36.18 
 
 
324 aa  169  5e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  32.85 
 
 
652 aa  169  7e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  34.93 
 
 
324 aa  168  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  38.87 
 
 
311 aa  164  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  36.32 
 
 
298 aa  162  7e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  36.24 
 
 
312 aa  162  8.000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.12 
 
 
311 aa  161  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  43.04 
 
 
324 aa  157  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  37.29 
 
 
334 aa  156  4e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.97 
 
 
355 aa  156  4e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  34.18 
 
 
705 aa  155  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 
387 aa  150  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  35.02 
 
 
308 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  34.38 
 
 
299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  38.74 
 
 
318 aa  146  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  33.6 
 
 
310 aa  145  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  30.47 
 
 
294 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  36.61 
 
 
304 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  36.67 
 
 
333 aa  143  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  33.57 
 
 
336 aa  143  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  34.91 
 
 
324 aa  142  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  31.68 
 
 
318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  32.99 
 
 
299 aa  140  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  31.35 
 
 
318 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  31.35 
 
 
318 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  33.45 
 
 
289 aa  138  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  31.77 
 
 
318 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  35.94 
 
 
307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.72 
 
 
379 aa  136  4e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1773  glycosyl transferase family protein  34.03 
 
 
303 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.314835  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  33.83 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  31.31 
 
 
361 aa  133  5e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  33.86 
 
 
293 aa  132  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  33.73 
 
 
310 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 
306 aa  127  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  28.06 
 
 
290 aa  126  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  34.24 
 
 
310 aa  125  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  33.86 
 
 
340 aa  125  8.000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  34.03 
 
 
360 aa  125  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  31.18 
 
 
313 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 
314 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  33.71 
 
 
274 aa  124  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2729  glycosyl transferase family protein  36.52 
 
 
298 aa  123  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  30.07 
 
 
306 aa  123  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  30.29 
 
 
345 aa  122  8e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  36.26 
 
 
282 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  33.92 
 
 
303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  30.22 
 
 
624 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  32.44 
 
 
311 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  33.86 
 
 
691 aa  119  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  30.6 
 
 
679 aa  119  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  32.69 
 
 
306 aa  119  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 
317 aa  119  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  33.09 
 
 
283 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  35.32 
 
 
305 aa  118  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 
337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 
994 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 
322 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  31.94 
 
 
318 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  32.7 
 
 
298 aa  116  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  37.07 
 
 
291 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  31.37 
 
 
286 aa  115  7.999999999999999e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  38.03 
 
 
336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0858  b-glycosyltransferase  31.43 
 
 
301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.043059  normal  0.0575748 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  30.18 
 
 
312 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  33.07 
 
 
691 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  31.38 
 
 
327 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 
308 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3624  glycosyl transferase family 2  33.73 
 
 
319 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  28.93 
 
 
346 aa  114  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  32.68 
 
 
691 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  31.91 
 
 
703 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  32.17 
 
 
1152 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2884  glycosyl transferase family protein  30.11 
 
 
305 aa  113  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.379417  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  32 
 
 
301 aa  113  5e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3301  glycosyl transferase family protein  33.73 
 
 
319 aa  112  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  35.06 
 
 
822 aa  112  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  31.5 
 
 
683 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4703  glycosyl transferase family 2  30.89 
 
 
334 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261222  normal  0.175733 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 
824 aa  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  33.91 
 
 
300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2348  glycosyl transferase  33.46 
 
 
1837 aa  110  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0298  b-glycosyltransferase  27.69 
 
 
260 aa  110  3e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.917677  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  32.61 
 
 
318 aa  110  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  31.15 
 
 
378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1854  glycosyl transferase family 2  34.45 
 
 
307 aa  110  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0256  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 
334 aa  109  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0188043  normal  0.110004 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  34.15 
 
 
296 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  34.15 
 
 
296 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  34.15 
 
 
296 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  33.77 
 
 
305 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  35.59 
 
 
838 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  34.63 
 
 
282 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>