More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2720 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  98.43 
 
 		 318 aa  653    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 318 aa  660    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  98.43 
 
 		 318 aa  651    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  90.57 
 
 		 318 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  55.27 
 
 		 336 aa  368  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  39.25 
 
 		 324 aa  212  7e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  39.1 
 
 		 324 aa  207  3e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  38.11 
 
 		 324 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  36.49 
 
 		 324 aa  198  9e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  40.15 
 
 		 311 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  37.17 
 
 		 312 aa  189  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  35.42 
 
 		 313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  38.61 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  36.23 
 
 		 334 aa  177  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  36.33 
 
 		 293 aa  169  6e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  34.87 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  36.4 
 
 		 705 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  35.59 
 
 		 652 aa  154  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  34.09 
 
 		 304 aa  151  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.29 
 
 		 355 aa  150  3e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  31.37 
 
 		 361 aa  149  8e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  35.65 
 
 		 334 aa  143  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  37.13 
 
 		 360 aa  140  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  31.35 
 
 		 340 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  33.59 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2729  glycosyl transferase family protein  37.12 
 
 		 298 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  32.95 
 
 		 307 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  32.39 
 
 		 289 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  32.99 
 
 		 311 aa  136  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  32.91 
 
 		 333 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 		 294 aa  135  9e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  34.05 
 
 		 329 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  34.98 
 
 		 318 aa  134  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  30.12 
 
 		 290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  32.29 
 
 		 299 aa  132  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  29.84 
 
 		 306 aa  132  6.999999999999999e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  31.16 
 
 		 306 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  34.75 
 
 		 313 aa  129  7.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  30.03 
 
 		 327 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0094  glycosyl transferase family 2  32.75 
 
 		 312 aa  129  9.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  33.61 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 		 327 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  32.29 
 
 		 299 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  29.45 
 
 		 308 aa  126  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0837  glycosyl transferase family protein  32.78 
 
 		 330 aa  125  8.000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  33.58 
 
 		 282 aa  125  9e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3624  glycosyl transferase family 2  31.42 
 
 		 319 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  31.94 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  29.77 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  31.93 
 
 		 317 aa  124  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 308 aa  122  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.38 
 
 		 311 aa  122  8e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  31.17 
 
 		 714 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 		 327 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  29.34 
 
 		 297 aa  119  9e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.84 
 
 		 379 aa  118  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  27 
 
 		 324 aa  117  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0842  hypothetical protein  29.34 
 
 		 297 aa  116  5e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4181  glycosyl transferase family 2  30.8 
 
 		 297 aa  116  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.208224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  30.87 
 
 		 387 aa  116  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3301  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 		 319 aa  116  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5877  glycosyl transferase family protein  30.55 
 
 		 303 aa  115  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.191547  normal  0.690247 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4473  glycosyl transferase family protein  31.62 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.966057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2507  glycosyl transferase family protein  36.87 
 
 		 221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  34.87 
 
 		 317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0965  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 		 275 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.253321  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4256  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 		 336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.586342  normal  0.139884 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  25.85 
 
 		 321 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0736  glycosyl transferase family protein  31.91 
 
 		 326 aa  109  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.59773 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0899  glycosyl transferase family 2  32.42 
 
 		 281 aa  109  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0840  hypothetical protein  30.73 
 
 		 296 aa  109  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2401  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 		 340 aa  109  7.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 		 325 aa  109  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  30.07 
 
 		 314 aa  109  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6339  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 		 285 aa  108  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2292  glycosyl transferase family protein  32.59 
 
 		 281 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02870  hypothetical protein  26.24 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1773  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.314835  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1140  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.55 
 
 		 286 aa  106  5e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  26.48 
 
 		 303 aa  106  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  29.77 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0693  glycosyl transferase family 2  30.21 
 
 		 277 aa  104  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0791  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 		 342 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.965247 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3153  putative glycosyl transferase WbiF  30.04 
 
 		 318 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4318  glycosyl transferase family 2  28.52 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.592459  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  29.64 
 
 		 301 aa  103  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0934  putative glycosyl transferase  30.04 
 
 		 318 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.164411  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1854  glycosyl transferase family 2  28.73 
 
 		 307 aa  103  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3130  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.04 
 
 		 276 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  26.88 
 
 		 300 aa  102  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1841  putative glycosyl transferase  29.91 
 
 		 266 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.718732  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3093  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.04 
 
 		 276 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2764  putative glycosyl transferase  29.91 
 
 		 266 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266345  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1979  glycosyl transferase, putative  29.91 
 
 		 276 aa  102  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4437  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>