More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1013 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 334 aa  698    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  79.01 
 
 		 324 aa  548  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  75.62 
 
 		 324 aa  494  1e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  62.65 
 
 		 324 aa  451  1e-125  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  41.8 
 
 		 324 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  36.91 
 
 		 336 aa  215  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  39.76 
 
 		 311 aa  205  7e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  36.3 
 
 		 318 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  37.25 
 
 		 312 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  36.23 
 
 		 318 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  36.23 
 
 		 318 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  36.23 
 
 		 318 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  35.63 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  40.69 
 
 		 652 aa  187  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  33.98 
 
 		 317 aa  179  8e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  34.7 
 
 		 705 aa  177  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1590  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.33 
 
 		 331 aa  177  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  36.68 
 
 		 313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  32.45 
 
 		 334 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  36.11 
 
 		 310 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.09 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  38.56 
 
 		 329 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  36.15 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  34.87 
 
 		 311 aa  166  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  37.66 
 
 		 340 aa  166  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  37.18 
 
 		 333 aa  160  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  37.29 
 
 		 714 aa  160  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  32.22 
 
 		 317 aa  159  7e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  36.02 
 
 		 313 aa  157  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 		 299 aa  156  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1168  glycosyl transferase family protein  28.36 
 
 		 330 aa  155  7e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.427988 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  33.21 
 
 		 324 aa  155  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  35.25 
 
 		 306 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  34.03 
 
 		 306 aa  152  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  35.32 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  32.51 
 
 		 308 aa  149  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 		 325 aa  147  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  32.52 
 
 		 327 aa  145  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  33.88 
 
 		 360 aa  145  9e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  35.34 
 
 		 307 aa  145  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 		 387 aa  145  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  35.27 
 
 		 289 aa  143  5e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  32.05 
 
 		 304 aa  142  8e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 		 314 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1773  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.314835  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  32.73 
 
 		 361 aa  140  3.9999999999999997e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.57 
 
 		 311 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  32.95 
 
 		 318 aa  139  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  34.48 
 
 		 282 aa  139  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  28.68 
 
 		 294 aa  135  9e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  32.18 
 
 		 310 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  32.92 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3301  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 		 319 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3624  glycosyl transferase family 2  31.09 
 
 		 319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  29.52 
 
 		 327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  29.15 
 
 		 327 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  31.06 
 
 		 306 aa  129  7.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.36 
 
 		 379 aa  129  8.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  31.7 
 
 		 340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  29.26 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0256  glycosyl transferase family 2  28.91 
 
 		 334 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0188043  normal  0.110004 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 		 318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0842  hypothetical protein  29.6 
 
 		 297 aa  126  5e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0858  b-glycosyltransferase  30.93 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.043059  normal  0.0575748 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2875  glycosyl transferase family 2  31.75 
 
 		 324 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0837  glycosyl transferase family protein  32.39 
 
 		 330 aa  123  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  26.18 
 
 		 290 aa  123  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0657  glycosyl transferase family 2  33.06 
 
 		 307 aa  122  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  27.51 
 
 		 314 aa  122  8e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4485  glycosyl transferase family 2  35 
 
 		 312 aa  122  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.874808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2967  glycosyl transferase family 2  31.75 
 
 		 324 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4473  glycosyl transferase family protein  29.1 
 
 		 340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.966057  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1341  glycosyl transferase family 2  32.47 
 
 		 272 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000344524  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2729  glycosyl transferase family protein  32.1 
 
 		 298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 		 318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  32.07 
 
 		 401 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4256  glycosyl transferase family protein  25.26 
 
 		 336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.586342  normal  0.139884 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  30.49 
 
 		 345 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2884  glycosyl transferase family protein  29.19 
 
 		 305 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.379417  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2031  family 2 glycosyl transferase  30.51 
 
 		 274 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 		 1739 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  30.38 
 
 		 1340 aa  113  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  30.4 
 
 		 341 aa  113  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5877  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 		 303 aa  113  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.191547  normal  0.690247 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  31.72 
 
 		 308 aa  113  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0762  glycosyl transferase family 2  27.54 
 
 		 331 aa  113  5e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4181  glycosyl transferase family 2  28.9 
 
 		 297 aa  113  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.208224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  31.47 
 
 		 336 aa  113  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0094  glycosyl transferase family 2  29.78 
 
 		 312 aa  112  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  30.82 
 
 		 691 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0736  glycosyl transferase family protein  29 
 
 		 326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.59773 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  30.94 
 
 		 378 aa  110  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0409  glycosyl transferase family 2  30.2 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.535242  hitchhiker  0.0010651 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0233  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.2 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.885705  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3552  glycosyl transferase family 2  29.1 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.139728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  29.25 
 
 		 336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  30.47 
 
 		 691 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 		 308 aa  109  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>