More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1590 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1590  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
331 aa  685    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1168  glycosyl transferase family protein  51.21 
 
 
330 aa  335  7.999999999999999e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.427988 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0762  glycosyl transferase family 2  49.7 
 
 
331 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  34.14 
 
 
324 aa  177  3e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  31.42 
 
 
324 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  32.33 
 
 
334 aa  162  6e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  31.72 
 
 
324 aa  161  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  30.29 
 
 
652 aa  109  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  33.76 
 
 
298 aa  101  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 
311 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
312 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 
324 aa  100  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 
333 aa  96.7  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.07 
 
 
311 aa  93.2  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.48 
 
 
355 aa  92.4  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
705 aa  92.4  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  30.64 
 
 
312 aa  89.7  6e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 
318 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  28.88 
 
 
387 aa  89.4  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  27.76 
 
 
361 aa  88.6  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 
360 aa  87  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  26.58 
 
 
313 aa  87  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  28.83 
 
 
325 aa  85.1  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  25.72 
 
 
318 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  27.7 
 
 
304 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 
340 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  25.72 
 
 
318 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  25.72 
 
 
318 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
401 aa  83.6  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  25.74 
 
 
336 aa  82.4  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0256  glycosyl transferase family 2  31.39 
 
 
334 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0188043  normal  0.110004 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  29.54 
 
 
299 aa  81.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  27.05 
 
 
314 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  28.63 
 
 
2401 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  27.72 
 
 
310 aa  79.3  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0094  glycosyl transferase family 2  24.75 
 
 
312 aa  79.3  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  27.47 
 
 
293 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 
317 aa  78.6  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  38.13 
 
 
318 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  26.47 
 
 
308 aa  77.8  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 
289 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3624  glycosyl transferase family 2  29.81 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 
313 aa  77  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  27.51 
 
 
329 aa  76.6  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.09 
 
 
379 aa  75.9  0.0000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  27.46 
 
 
306 aa  75.9  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  23.55 
 
 
294 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  29.58 
 
 
1162 aa  75.5  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  28.9 
 
 
282 aa  75.1  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3301  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 
319 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  28.15 
 
 
325 aa  75.1  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  27.9 
 
 
714 aa  75.1  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
299 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  30.81 
 
 
303 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3130  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.41 
 
 
276 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 
318 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  24.44 
 
 
306 aa  73.2  0.000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0934  putative glycosyl transferase  25 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.164411  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3153  putative glycosyl transferase WbiF  25 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1841  putative glycosyl transferase  25.41 
 
 
266 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.718732  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1979  glycosyl transferase, putative  25.41 
 
 
276 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 
841 aa  72  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  26.39 
 
 
310 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3093  glycosyl transferase, group 2 family protein  25 
 
 
276 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  25.38 
 
 
334 aa  72  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
306 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2764  putative glycosyl transferase  25.41 
 
 
266 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266345  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  25.82 
 
 
327 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  30.87 
 
 
691 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  27.36 
 
 
340 aa  70.1  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  31.9 
 
 
691 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0233  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.92 
 
 
315 aa  69.3  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.885705  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0409  glycosyl transferase family 2  28.92 
 
 
315 aa  69.3  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.535242  hitchhiker  0.0010651 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  30.14 
 
 
1119 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  29.86 
 
 
305 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  25.46 
 
 
324 aa  68.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
489 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4473  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 
340 aa  68.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.966057  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
691 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0842  hypothetical protein  23.02 
 
 
297 aa  67.4  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  28.86 
 
 
308 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3185  glycosyl transferase family protein  23.79 
 
 
297 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  29.71 
 
 
310 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0837  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  25.7 
 
 
305 aa  67  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0858  b-glycosyltransferase  25.42 
 
 
301 aa  67  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.043059  normal  0.0575748 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4437  glycosyl transferase family protein  34.88 
 
 
331 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2264  glycosyl transferase family 2  25.94 
 
 
270 aa  67  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.503819  normal  0.135779 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  23.13 
 
 
341 aa  67  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  24.15 
 
 
330 aa  66.6  0.0000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  25.24 
 
 
308 aa  66.6  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 
683 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2920  glycosyl transferase family protein  24.79 
 
 
339 aa  65.1  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  28.05 
 
 
378 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  25.68 
 
 
308 aa  64.7  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1480  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  23.64 
 
 
276 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  30.28 
 
 
1523 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  23.96 
 
 
455 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>