More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3740 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 1523 aa  3107    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  91.79 
 
 		 1523 aa  2794    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  40.47 
 
 		 1268 aa  681    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  44.85 
 
 		 1162 aa  402  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  37.52 
 
 		 785 aa  292  3e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  37.17 
 
 		 1435 aa  272  2.9999999999999997e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3376  glycosyl transferase family 2  43.59 
 
 		 669 aa  219  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  33.26 
 
 		 1340 aa  213  3e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0378  glycosyl transferase family protein  47.81 
 
 		 342 aa  212  5e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.799613 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  42.39 
 
 		 369 aa  203  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  36.96 
 
 		 1119 aa  182  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1852  glycosyl transferase family 2  45.49 
 
 		 825 aa  176  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2592  methyltransferase type 11  42.29 
 
 		 219 aa  160  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3718  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.76 
 
 		 616 aa  158  8e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  35.6 
 
 		 457 aa  155  4e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2347  glycosyl transferase family 2  47.92 
 
 		 1562 aa  154  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0312  hypothetical protein  46.2 
 
 		 216 aa  150  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.121352 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0252  glycosyl transferase family 2  30.97 
 
 		 677 aa  150  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0934  methyltransferase type 12  37.73 
 
 		 228 aa  146  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3814  TPR repeat-containing protein  27.31 
 
 		 615 aa  147  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  40.57 
 
 		 215 aa  142  3.9999999999999997e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2011  hypothetical protein  43.83 
 
 		 199 aa  142  6e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.714234 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1128  glycosyl transferase family 2  30.59 
 
 		 414 aa  142  6e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  36.11 
 
 		 616 aa  141  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4077  hypothetical protein  35.78 
 
 		 229 aa  140  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1132  hypothetical protein  35.65 
 
 		 229 aa  139  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1112  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  35.09 
 
 		 229 aa  140  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1293  hypothetical protein  35.65 
 
 		 229 aa  139  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00493379 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1225  hypothetical protein  35.65 
 
 		 229 aa  139  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1332  hypothetical protein  35 
 
 		 229 aa  139  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1264  hypothetical protein  35.32 
 
 		 229 aa  139  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0030  glycosyl transferase family 2  40.93 
 
 		 797 aa  139  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0565776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  38.21 
 
 		 280 aa  137  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  36.18 
 
 		 624 aa  137  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1370  hypothetical protein  34.55 
 
 		 229 aa  137  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1408  glycosyl transferase family protein  32.33 
 
 		 640 aa  136  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  37.3 
 
 		 679 aa  135  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1106  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  35.62 
 
 		 229 aa  134  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1388  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 		 421 aa  134  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.739804  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1119  methyltransferase type 12  35.02 
 
 		 229 aa  133  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.582685  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2807  glycosyl transferase family protein  31.14 
 
 		 419 aa  130  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1402  glycosyl transferase family protein  32.72 
 
 		 646 aa  130  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  27.08 
 
 		 2401 aa  129  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2476  methyltransferase type 12  44.05 
 
 		 229 aa  129  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.48496 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2178  glycosyl transferase family protein  36.75 
 
 		 1256 aa  127  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1386  glycosyl transferase family protein  29.45 
 
 		 657 aa  127  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  35.46 
 
 		 270 aa  127  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 		 680 aa  127  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1410  glycosyl transferase family protein  37.06 
 
 		 826 aa  125  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3006  methyltransferase type 12  35.98 
 
 		 681 aa  125  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.633739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  38.81 
 
 		 303 aa  122  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0885  glycosyl transferase family 2  33.46 
 
 		 817 aa  122  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2557  glycosyl transferase family protein  30.81 
 
 		 499 aa  122  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1695  methyltransferase type 11  41.38 
 
 		 211 aa  122  6e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0925048  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  36.73 
 
 		 1317 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  31.88 
 
 		 1444 aa  120  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0044  glycosyl transferase family protein  32.62 
 
 		 746 aa  119  6.9999999999999995e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2023  glycosyl transferase family protein  36.46 
 
 		 385 aa  117  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 		 337 aa  117  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2521  glycosyl transferase family 2  39.36 
 
 		 444 aa  117  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00644687  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 		 1739 aa  116  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  35.98 
 
 		 298 aa  116  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1835  methyltransferase type 12  34.84 
 
 		 231 aa  115  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6296  glycosyl transferase family 2  32.08 
 
 		 814 aa  115  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 		 996 aa  115  6e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  32.18 
 
 		 700 aa  115  8.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  31.56 
 
 		 1314 aa  115  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2559  glycosyl transferase family 2  39.49 
 
 		 754 aa  114  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5502  Methyltransferase type 12  41.28 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.222085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  33.07 
 
 		 289 aa  114  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  35.92 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 		 1287 aa  113  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  34.35 
 
 		 360 aa  113  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1349  methyltransferase type 11  34.48 
 
 		 581 aa  112  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00108025  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  36.75 
 
 		 298 aa  112  6e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 		 300 aa  112  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  31.42 
 
 		 723 aa  112  7.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  32.93 
 
 		 415 aa  111  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  30.27 
 
 		 1312 aa  111  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2617  glycosyl transferase family 2  43.11 
 
 		 444 aa  110  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000160485  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1760  glycosyl transferase family 2  27.49 
 
 		 392 aa  109  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  35.65 
 
 		 334 aa  107  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4180  glycosyl transferase family 2  29.05 
 
 		 506 aa  107  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  30.49 
 
 		 320 aa  107  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1575  Methyltransferase type 12  38.36 
 
 		 746 aa  107  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1485  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.58 
 
 		 427 aa  107  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0313881  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  27.71 
 
 		 1600 aa  107  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1736  glycosyl transferase family 2  27.22 
 
 		 392 aa  107  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1836  methyltransferase FkbM family  35.38 
 
 		 1673 aa  106  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  29.72 
 
 		 1077 aa  106  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  33.87 
 
 		 525 aa  106  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3537  glycosyl transferase family 2  36.53 
 
 		 397 aa  105  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  33.86 
 
 		 302 aa  105  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1337  glycosyl transferase family protein  34.58 
 
 		 438 aa  104  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00375711  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0549  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 		 818 aa  103  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0567321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  33.9 
 
 		 311 aa  103  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1372  glycosyl transferase family protein  32.11 
 
 		 633 aa  103  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.371979  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  33.05 
 
 		 312 aa  103  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6257  glycosyl transferase family protein  37.29 
 
 		 987 aa  103  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0286803  normal  0.0257469 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3371  glycosyl transferase family protein  34.52 
 
 		 396 aa  103  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.547122  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>