More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1836 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1836  methyltransferase FkbM family  100 
 
 
1673 aa  3332    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6296  glycosyl transferase family 2  38.35 
 
 
814 aa  457  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6257  glycosyl transferase family protein  41 
 
 
987 aa  389  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0286803  normal  0.0257469 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2494  glycosyl transferase family 2  39.33 
 
 
1059 aa  388  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
1287 aa  388  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  40.25 
 
 
1312 aa  388  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2218  glycosyl transferase family protein  38.8 
 
 
1035 aa  385  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.966726 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  37.11 
 
 
1444 aa  380  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1576  glycosyl transferase family protein  38.34 
 
 
1313 aa  375  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.897283 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  38.65 
 
 
1317 aa  371  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  39.83 
 
 
1314 aa  370  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0044  glycosyl transferase family protein  39.3 
 
 
746 aa  369  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2175  glycosyl transferase family 2  38.61 
 
 
995 aa  370  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1204  glycosyl transferase family protein  37.95 
 
 
1322 aa  365  4e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221379  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  26.72 
 
 
723 aa  310  2.0000000000000002e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2627  glycosyl transferase family protein  34.48 
 
 
1185 aa  299  3e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112993  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2178  glycosyl transferase family protein  31.57 
 
 
1256 aa  275  6e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2886  glycosyl transferase family 2  37.95 
 
 
1008 aa  270  2e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0431865 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1895  glycosyl transferase family protein  40.79 
 
 
953 aa  229  3e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207282  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1793  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.03 
 
 
862 aa  206  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.101573 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0930  glycosyl transferase family protein  34.63 
 
 
827 aa  204  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0478435 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1402  glycosyl transferase family protein  40.36 
 
 
852 aa  194  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0549  glycosyl transferase family protein  41.54 
 
 
818 aa  189  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0567321  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1063  glycosyl transferase family protein  40.96 
 
 
818 aa  187  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4121  glycosyl transferase family protein  30.54 
 
 
850 aa  169  4e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276059  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3712  FkbM family methyltransferase  30.73 
 
 
411 aa  124  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  32.35 
 
 
1600 aa  120  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4165  FkbM family methyltransferase  31.79 
 
 
278 aa  115  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4307  Glycosyltransferase-like protein  30.93 
 
 
597 aa  114  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  32.19 
 
 
1523 aa  110  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  32.75 
 
 
1162 aa  108  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  28.24 
 
 
1523 aa  106  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0236  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 
1067 aa  104  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 
785 aa  102  7e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3682  FkbM family methyltransferase  28.78 
 
 
279 aa  101  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
680 aa  99.8  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  31.66 
 
 
1435 aa  99.8  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  30.52 
 
 
1268 aa  97.8  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  27.85 
 
 
1119 aa  90.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  27.76 
 
 
1340 aa  88.6  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05411  putative glycosyl transferase  32.34 
 
 
387 aa  85.9  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.42422  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  26.21 
 
 
369 aa  82.8  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4437  glycosyl transferase family protein  25.83 
 
 
331 aa  81.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0791  glycosyl transferase family protein  25.62 
 
 
342 aa  79  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.965247 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 
616 aa  76.3  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  28.21 
 
 
313 aa  75.1  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02687  hypothetical protein  28 
 
 
279 aa  74.3  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.475562  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  31.11 
 
 
303 aa  72.8  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0515  FkbM family methyltransferase  29.07 
 
 
385 aa  72.4  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  28.96 
 
 
334 aa  72  0.00000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  27.38 
 
 
353 aa  71.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  28.92 
 
 
355 aa  71.2  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0432  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 
348 aa  70.5  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
305 aa  70.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2875  glycosyl transferase family 2  31.41 
 
 
324 aa  71.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  28.63 
 
 
2401 aa  69.7  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0259  glycosyl transferase family protein  25.55 
 
 
658 aa  69.7  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  32.58 
 
 
300 aa  69.3  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  29.89 
 
 
298 aa  69.3  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  31.23 
 
 
311 aa  68.9  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2894  methyltransferase FkbM  25.39 
 
 
296 aa  68.9  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2967  glycosyl transferase family 2  31.05 
 
 
324 aa  68.6  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  22.47 
 
 
994 aa  68.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  32.07 
 
 
310 aa  68.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  31.89 
 
 
327 aa  67.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  25.7 
 
 
320 aa  67  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  25.9 
 
 
525 aa  66.6  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2344  glycosyl transferase family 2  27.04 
 
 
301 aa  66.6  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.0000247035 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  28.25 
 
 
308 aa  66.6  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  26.97 
 
 
340 aa  66.2  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  25.1 
 
 
361 aa  65.1  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 
293 aa  65.1  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  25.77 
 
 
679 aa  64.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  26.2 
 
 
337 aa  64.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  24.6 
 
 
624 aa  64.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4783  methyltransferase FkbM  29.38 
 
 
265 aa  63.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  27.09 
 
 
337 aa  63.5  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  37.6 
 
 
700 aa  63.2  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  31.98 
 
 
299 aa  62.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2807  glycosyl transferase family protein  24.5 
 
 
419 aa  62.8  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 
457 aa  63.2  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0885  glycosyl transferase family 2  32.04 
 
 
817 aa  62.4  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5202  FkbM family methyltransferase  27.03 
 
 
416 aa  62.4  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.327791  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
306 aa  61.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  28.69 
 
 
430 aa  61.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12969  hypothetical protein  30.05 
 
 
321 aa  62  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  25.21 
 
 
1077 aa  61.6  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  31.45 
 
 
282 aa  62  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1098  FkbM family methyltransferase  27.57 
 
 
264 aa  61.6  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.81 
 
 
610 aa  60.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  24.62 
 
 
1739 aa  60.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2883  methyltransferase FkbM family  28.37 
 
 
309 aa  61.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.241941  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 
314 aa  61.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 
415 aa  60.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  26.16 
 
 
311 aa  60.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.99 
 
 
322 aa  60.1  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  30.81 
 
 
327 aa  60.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 
841 aa  60.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1565  glycosyl transferase family 2  22.9 
 
 
970 aa  60.5  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000603283  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 
312 aa  60.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>