More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0652 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  100 
 
 
1119 aa  2316    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3695  methyltransferase type 12  47.71 
 
 
726 aa  202  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  35.31 
 
 
1523 aa  187  8e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  36.96 
 
 
1523 aa  181  5.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4320  Methyltransferase type 11  31.88 
 
 
395 aa  180  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.548543  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  41.56 
 
 
1162 aa  172  3e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  38.11 
 
 
1435 aa  158  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  33.75 
 
 
369 aa  146  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  36.51 
 
 
1268 aa  144  8e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  36.51 
 
 
1340 aa  142  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  27.52 
 
 
1293 aa  141  7e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1407  methyltransferase type 11  36.95 
 
 
260 aa  141  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.266871  normal  0.495193 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  33.1 
 
 
785 aa  140  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2641  hypothetical protein  34.47 
 
 
392 aa  139  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602501  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1496  Methyltransferase type 11  37.8 
 
 
728 aa  137  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0542283  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2822  hypothetical protein  34.59 
 
 
392 aa  136  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2727  hypothetical protein  34.21 
 
 
392 aa  135  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.298348  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0105  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 
385 aa  132  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4118  glycosyl transferase group 1  34.02 
 
 
383 aa  132  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0967144  hitchhiker  0.00000000882956 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1306  glycosyl transferase group 1  29.34 
 
 
422 aa  130  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.622401  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1400  Methyltransferase type 11  38.28 
 
 
728 aa  129  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.527052  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
457 aa  125  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4021  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 
382 aa  125  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  31.54 
 
 
305 aa  124  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  30.5 
 
 
679 aa  124  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0827  glycosyl transferase group 1  27.08 
 
 
350 aa  124  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  31.92 
 
 
616 aa  124  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  27.68 
 
 
814 aa  123  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4112  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 
385 aa  122  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  30.35 
 
 
624 aa  121  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1819  hypothetical protein  27.27 
 
 
388 aa  121  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000132371  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2340  glycosyl transferase, group 1  27.03 
 
 
397 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107482  normal  0.0271805 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19360  hypothetical protein  27.55 
 
 
319 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2459  methyltransferase type 11  30.62 
 
 
729 aa  119  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.127037  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0058  glycosyltransferase-like protein  25.95 
 
 
443 aa  117  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0885  glycosyl transferase family 2  28.62 
 
 
817 aa  114  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2281  glycosyl transferase, group 1  28.19 
 
 
389 aa  114  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1195  hypothetical protein  25.94 
 
 
420 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.291365  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 
280 aa  112  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  26.93 
 
 
783 aa  111  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  31.44 
 
 
270 aa  111  9.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2899  hypothetical protein  27.32 
 
 
394 aa  110  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.394156  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2703  hypothetical protein  25.79 
 
 
394 aa  111  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0632784  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0268  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.07 
 
 
477 aa  110  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3620  glycosyltransferase  28.03 
 
 
443 aa  109  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270845  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 
1314 aa  109  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  32.35 
 
 
1317 aa  108  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  31.32 
 
 
1312 aa  108  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0257  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  24.59 
 
 
411 aa  108  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0141248  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0266  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.59 
 
 
411 aa  108  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2210  glycosyl transferase, group 1  28.63 
 
 
392 aa  107  9e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.516379  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0265  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.31 
 
 
427 aa  107  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0256  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  25.31 
 
 
427 aa  107  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188802  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0259  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  24.8 
 
 
477 aa  106  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.636404  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  28.34 
 
 
1739 aa  106  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  30.08 
 
 
700 aa  106  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0280  glycosyl transferase group 1  28 
 
 
403 aa  105  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1963  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 
406 aa  105  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000383254 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  33.49 
 
 
430 aa  105  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0549  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 
818 aa  105  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0567321  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2529  hypothetical protein  28.61 
 
 
376 aa  105  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  32.61 
 
 
289 aa  104  9e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0170  glycosyl transferase group 1  30.26 
 
 
394 aa  104  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.269733  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  30 
 
 
1444 aa  104  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 
415 aa  104  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4703  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
390 aa  103  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  31.05 
 
 
303 aa  103  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3059  glycosyl transferase, group 1  31.2 
 
 
416 aa  102  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.304674  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4204  glycosyl transferase, group 1  26.45 
 
 
398 aa  102  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186805  normal  0.199136 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2692  hypothetical protein  27.72 
 
 
370 aa  102  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  26.8 
 
 
783 aa  102  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0087  glycosyltransferase  30.42 
 
 
412 aa  101  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  27.42 
 
 
680 aa  101  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1063  glycosyl transferase family protein  28.06 
 
 
818 aa  101  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3854  hypothetical protein  25.67 
 
 
407 aa  99.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0171  hypothetical protein  28.94 
 
 
391 aa  99.8  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2439  glycosyl transferase, group 1  32.05 
 
 
388 aa  99.8  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  30.12 
 
 
1287 aa  99.8  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  33.62 
 
 
303 aa  99  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3804  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 
582 aa  98.2  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2557  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 
499 aa  97.4  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  27.09 
 
 
313 aa  96.7  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 
298 aa  97.1  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  29.37 
 
 
1077 aa  96.7  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  29.76 
 
 
293 aa  96.3  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1485  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.4 
 
 
427 aa  95.9  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0313881  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  29.8 
 
 
378 aa  94.7  9e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  33.77 
 
 
300 aa  94.7  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0179  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 
404 aa  94.7  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.160562  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3975  polysaccharide pyruvyl transferase  25.9 
 
 
1225 aa  94.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.584875 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 
525 aa  94.4  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4180  glycosyl transferase family 2  25.61 
 
 
506 aa  93.6  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  27.76 
 
 
723 aa  92.8  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 
824 aa  92.8  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  29.62 
 
 
1359 aa  92.8  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2218  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 
1035 aa  92.4  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.966726 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5260  glycosyltransferase  26.57 
 
 
405 aa  92.4  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2178  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 
1256 aa  92.4  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2494  glycosyl transferase family 2  27.76 
 
 
1059 aa  92  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2175  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 
995 aa  92  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>