More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2557 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2557  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 499 aa  1024    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4180  glycosyl transferase family 2  40 
 
 		 506 aa  388  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  33.25 
 
 		 457 aa  184  4.0000000000000006e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  29.84 
 
 		 369 aa  153  7e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  30.81 
 
 		 1523 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  30.33 
 
 		 1523 aa  117  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  30.19 
 
 		 1268 aa  114  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  27.62 
 
 		 1162 aa  110  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  29.1 
 
 		 1340 aa  110  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  32.52 
 
 		 785 aa  109  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  25.81 
 
 		 1119 aa  97.4  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  30.2 
 
 		 320 aa  97.4  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 		 1435 aa  93.2  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  28.96 
 
 		 337 aa  90.5  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2807  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 		 419 aa  89.7  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 		 1739 aa  89  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  29.38 
 
 		 280 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  27.35 
 
 		 2401 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 		 329 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  24.54 
 
 		 430 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  27.08 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2031  family 2 glycosyl transferase  25.82 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  27.52 
 
 		 616 aa  79.3  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  21.16 
 
 		 312 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  25.68 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  22.54 
 
 		 338 aa  77.4  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  25 
 
 		 1444 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 		 902 aa  76.6  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  23.83 
 
 		 324 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  26.84 
 
 		 298 aa  75.9  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  27.06 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3804  glycosyl transferase family protein  36.97 
 
 		 582 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  20.33 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  23.08 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  24.11 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1565  glycosyl transferase family 2  28.02 
 
 		 970 aa  73.6  0.000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000603283  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  24.66 
 
 		 679 aa  73.6  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  23.01 
 
 		 340 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  27.52 
 
 		 311 aa  73.2  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  25.61 
 
 		 723 aa  73.2  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 		 336 aa  72  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  23.5 
 
 		 1314 aa  72  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 303 aa  72.4  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  23.97 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  24.49 
 
 		 624 aa  72  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1341  glycosyl transferase family 2  23.71 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000344524  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  23.72 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2173  glycosyl transferase family 2  21.88 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  23.91 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  23 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0069  glycosyl transferase family 2  22.22 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.866174  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  26.81 
 
 		 860 aa  70.1  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  25.33 
 
 		 525 aa  70.1  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0842  hypothetical protein  24.35 
 
 		 297 aa  69.7  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  25.86 
 
 		 994 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  22.13 
 
 		 324 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 841 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0114  glycosyl transferase family 2  25.35 
 
 		 410 aa  68.6  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3109  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  25.52 
 
 		 1600 aa  67.8  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  21.97 
 
 		 1312 aa  67.8  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  25.91 
 
 		 1317 aa  67.4  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  20.39 
 
 		 341 aa  67  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 328 aa  67  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3216  glycosyl transferase family 2  24.77 
 
 		 302 aa  67  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1485  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.07 
 
 		 427 aa  66.6  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0313881  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2178  glycosyl transferase family protein  25.46 
 
 		 1256 aa  66.2  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  24.77 
 
 		 300 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  21.18 
 
 		 415 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  20.35 
 
 		 336 aa  65.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  23.77 
 
 		 289 aa  65.5  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  21.67 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1818  glycosyl transferase family protein  26.03 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1887  glycosyl transferase family 2  24.9 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  20.78 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1748  glycosyl transferase family protein  23.87 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2086  glycosyl transferase family protein  32.48 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0454  glycosyl transferase family 2  28.8 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.797965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  21.78 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  22.81 
 
 		 700 aa  63.5  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0426  glycosyl transferase family protein  23.14 
 
 		 366 aa  63.5  0.000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0815896  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  23.02 
 
 		 996 aa  62.8  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.42 
 
 		 379 aa  62.8  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  23.38 
 
 		 294 aa  63.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0044  glycosyl transferase family protein  24.43 
 
 		 746 aa  63.2  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  23.05 
 
 		 334 aa  62.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6387  glycosyl transferase family 2  21.7 
 
 		 340 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0741751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  20.22 
 
 		 311 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  28.17 
 
 		 309 aa  62.4  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  22.49 
 
 		 325 aa  62.4  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  21.85 
 
 		 331 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1377  glycosyl transferase family protein  25.12 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0605163 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  24.7 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  20.87 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  24.02 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2920  glycosyl transferase family protein  20.88 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4006  glycosyl transferase family 2  21.95 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0564  glycosyl transferase family protein  23.14 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  24.4 
 
 		 727 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>