299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0549 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0549  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
818 aa  1643    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0567321  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1063  glycosyl transferase family protein  76.16 
 
 
818 aa  1232    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1402  glycosyl transferase family protein  38.34 
 
 
852 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1793  glycosyl transferase, group 2 family protein  40 
 
 
862 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.101573 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0930  glycosyl transferase family protein  40.22 
 
 
827 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0478435 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  35.86 
 
 
1287 aa  195  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  35.24 
 
 
1314 aa  189  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  40.21 
 
 
1312 aa  189  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1836  methyltransferase FkbM family  40.59 
 
 
1673 aa  183  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  33.5 
 
 
1444 aa  182  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2178  glycosyl transferase family protein  38.28 
 
 
1256 aa  180  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6296  glycosyl transferase family 2  37.78 
 
 
814 aa  173  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2494  glycosyl transferase family 2  33.86 
 
 
1059 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1204  glycosyl transferase family protein  37.79 
 
 
1322 aa  167  9e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221379  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0044  glycosyl transferase family protein  35.4 
 
 
746 aa  165  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2886  glycosyl transferase family 2  39.65 
 
 
1008 aa  165  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0431865 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2175  glycosyl transferase family 2  36.24 
 
 
995 aa  163  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2218  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 
1035 aa  163  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.966726 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1895  glycosyl transferase family protein  35.18 
 
 
953 aa  163  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207282  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2627  glycosyl transferase family protein  32.67 
 
 
1185 aa  159  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112993  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6257  glycosyl transferase family protein  38.66 
 
 
987 aa  159  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0286803  normal  0.0257469 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1576  glycosyl transferase family protein  38.64 
 
 
1313 aa  155  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.897283 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  35.69 
 
 
1317 aa  152  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  31.43 
 
 
723 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4121  glycosyl transferase family protein  35.59 
 
 
850 aa  145  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276059  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  26.97 
 
 
785 aa  110  8.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  32.02 
 
 
1162 aa  107  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  27.84 
 
 
1119 aa  105  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  30.47 
 
 
679 aa  104  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 
1523 aa  103  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  33.6 
 
 
680 aa  102  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  32.13 
 
 
624 aa  100  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 
1523 aa  99.8  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  28.29 
 
 
1435 aa  97.1  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05411  putative glycosyl transferase  30.21 
 
 
387 aa  96.7  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.42422  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 
1268 aa  92  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  22.69 
 
 
369 aa  90.9  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  28.91 
 
 
1600 aa  90.9  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  27.2 
 
 
1340 aa  87.4  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 
457 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
280 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0509  glycosyl transferase family 2  28.13 
 
 
1075 aa  78.6  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.0268717 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2596  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 
315 aa  77.8  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00437692  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0259  glycosyl transferase family protein  28.26 
 
 
658 aa  76.6  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  26.39 
 
 
616 aa  75.9  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 
303 aa  75.5  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  29.8 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  26.1 
 
 
703 aa  73.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  29.65 
 
 
311 aa  73.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02687  hypothetical protein  28 
 
 
279 aa  72.4  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.475562  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0885  glycosyl transferase family 2  28.28 
 
 
817 aa  72  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  29 
 
 
1106 aa  71.6  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  25.59 
 
 
700 aa  71.6  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 
282 aa  70.9  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  24.57 
 
 
1739 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  28.21 
 
 
353 aa  70.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 
310 aa  69.7  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  28.94 
 
 
617 aa  68.9  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.7 
 
 
610 aa  68.2  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 
282 aa  67.8  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  24.8 
 
 
320 aa  67.4  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  24.71 
 
 
733 aa  67.4  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0278  glycosyl transferase family 2  25.45 
 
 
576 aa  66.2  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.859999  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  26.94 
 
 
313 aa  66.2  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  28.45 
 
 
312 aa  66.6  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  25.4 
 
 
994 aa  66.2  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  25.25 
 
 
289 aa  65.9  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4005  glycosyl transferase family 2  26.75 
 
 
790 aa  65.5  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318857  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2875  glycosyl transferase family 2  28.15 
 
 
324 aa  65.5  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  25.78 
 
 
337 aa  65.1  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  24.38 
 
 
902 aa  65.1  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  25.69 
 
 
1077 aa  65.1  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0432  glycosyl transferase family protein  25.47 
 
 
348 aa  64.7  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  23.44 
 
 
832 aa  64.7  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  31.18 
 
 
299 aa  64.3  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  26.29 
 
 
321 aa  63.9  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  27 
 
 
283 aa  63.5  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  22.85 
 
 
988 aa  63.5  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2344  glycosyl transferase family 2  24.68 
 
 
301 aa  63.5  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.0000247035 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2967  glycosyl transferase family 2  28.15 
 
 
324 aa  63.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  25.19 
 
 
355 aa  62.8  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
318 aa  62.8  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2352  glycosyl transferase family 2  30.62 
 
 
337 aa  62  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013468  hitchhiker  0.0000313698 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  29.34 
 
 
320 aa  62.4  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  25.79 
 
 
302 aa  62.4  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0729  glycosyl transferase family protein  26.26 
 
 
586 aa  62  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155064  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  23.51 
 
 
632 aa  62  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  28.74 
 
 
841 aa  61.6  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  23.27 
 
 
723 aa  61.6  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  29.51 
 
 
299 aa  61.2  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  25.93 
 
 
341 aa  60.8  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  24.71 
 
 
325 aa  60.8  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1711  glycosyl transferase family 2  25.21 
 
 
337 aa  60.8  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9788799999999997e-27 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  23.98 
 
 
860 aa  60.5  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  21.98 
 
 
1334 aa  60.5  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  21.43 
 
 
1509 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2807  glycosyl transferase family protein  24.48 
 
 
419 aa  60.5  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0557  hypothetical protein  26.87 
 
 
284 aa  60.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17155  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  24.07 
 
 
996 aa  60.5  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>