194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4121 on replicon NC_009958
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009958  Dshi_4121  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 850 aa  1694    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  32.77 
 
 		 1287 aa  248  4e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  33.13 
 
 		 1314 aa  244  6e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  33.54 
 
 		 1312 aa  236  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  31.26 
 
 		 1317 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6296  glycosyl transferase family 2  27.66 
 
 		 814 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0044  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 		 746 aa  197  7e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2178  glycosyl transferase family protein  28.34 
 
 		 1256 aa  195  3e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2494  glycosyl transferase family 2  32.21 
 
 		 1059 aa  194  8e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  30.08 
 
 		 1444 aa  190  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2218  glycosyl transferase family protein  31.73 
 
 		 1035 aa  189  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.966726 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6257  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 		 987 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0286803  normal  0.0257469 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2627  glycosyl transferase family protein  29.49 
 
 		 1185 aa  183  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112993  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1836  methyltransferase FkbM family  30.32 
 
 		 1673 aa  182  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2175  glycosyl transferase family 2  31.33 
 
 		 995 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  27.81 
 
 		 723 aa  161  5e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1576  glycosyl transferase family protein  30.78 
 
 		 1313 aa  161  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.897283 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1204  glycosyl transferase family protein  29.14 
 
 		 1322 aa  160  7e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221379  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1793  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.29 
 
 		 862 aa  152  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.101573 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1402  glycosyl transferase family protein  36.01 
 
 		 852 aa  151  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0930  glycosyl transferase family protein  36.69 
 
 		 827 aa  150  9e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0478435 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0549  glycosyl transferase family protein  35.59 
 
 		 818 aa  145  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0567321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1063  glycosyl transferase family protein  35.11 
 
 		 818 aa  144  6e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2886  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 		 1008 aa  140  7.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0431865 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1895  glycosyl transferase family protein  37.82 
 
 		 953 aa  126  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207282  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 		 785 aa  101  5e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05411  putative glycosyl transferase  29.85 
 
 		 387 aa  97.8  7e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.42422  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 		 1340 aa  93.2  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  31.74 
 
 		 1523 aa  91.7  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  29.39 
 
 		 1523 aa  91.7  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  30.12 
 
 		 1600 aa  88.6  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 		 1268 aa  88.6  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  27.47 
 
 		 1435 aa  84.7  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 		 1162 aa  83.6  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  26.05 
 
 		 1119 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0259  glycosyl transferase family protein  27.09 
 
 		 658 aa  76.6  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  21.74 
 
 		 369 aa  76.3  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  29.32 
 
 		 680 aa  73.9  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  22.26 
 
 		 1077 aa  63.5  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  23.68 
 
 		 994 aa  63.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  28.99 
 
 		 700 aa  62.4  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0432  glycosyl transferase family protein  26.46 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  19.4 
 
 		 892 aa  60.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  23.72 
 
 		 2401 aa  59.7  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1711  glycosyl transferase family 2  23.85 
 
 		 337 aa  59.7  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9788799999999997e-27 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4307  Glycosyltransferase-like protein  27.07 
 
 		 597 aa  59.3  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  24.37 
 
 		 679 aa  59.3  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3277  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 		 273 aa  58.9  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  23.33 
 
 		 348 aa  58.9  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  27.03 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  24.01 
 
 		 289 aa  58.9  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0509  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 		 1075 aa  58.2  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.0268717 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  22.61 
 
 		 525 aa  58.2  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  25.61 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1565  glycosyl transferase family 2  20 
 
 		 970 aa  57.8  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000603283  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 		 902 aa  57.4  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3997  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 		 327 aa  57  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.615334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2348  glycosyl transferase  24.72 
 
 		 1837 aa  56.2  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  21.58 
 
 		 1152 aa  56.6  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2735  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 		 1220 aa  56.2  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  31.51 
 
 		 1509 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  26.58 
 
 		 324 aa  56.2  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  30.65 
 
 		 291 aa  55.8  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  27.06 
 
 		 311 aa  56.2  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  25.93 
 
 		 624 aa  55.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  27.71 
 
 		 303 aa  55.1  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  28.12 
 
 		 313 aa  54.3  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  22.31 
 
 		 457 aa  54.3  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0380  glycosyl transferase family 2  32.17 
 
 		 298 aa  53.9  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 		 376 aa  53.9  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 710 aa  53.9  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  23.85 
 
 		 860 aa  53.1  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 		 280 aa  53.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0321  glycosyl transferase family protein  32.38 
 
 		 342 aa  53.5  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  25.84 
 
 		 1739 aa  52.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1841  glycosyl transferase family 2  33.57 
 
 		 652 aa  52.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  25.5 
 
 		 306 aa  52.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2508  glycosyl transferase family 2  26.57 
 
 		 337 aa  52.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000796473  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 		 317 aa  52.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1373  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 		 1303 aa  52.8  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.13365  hitchhiker  0.0000853282 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 		 313 aa  52.4  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 		 299 aa  52.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  25.28 
 
 		 334 aa  52  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  27.5 
 
 		 321 aa  52  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  22.53 
 
 		 320 aa  52  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  23.93 
 
 		 717 aa  52  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  25.7 
 
 		 283 aa  51.6  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 		 321 aa  51.6  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3289  glycosyl transferase family 2  25.32 
 
 		 328 aa  51.6  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  21.07 
 
 		 290 aa  51.6  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  26.52 
 
 		 308 aa  51.6  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1485  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.95 
 
 		 427 aa  51.2  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0313881  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 		 290 aa  51.2  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 		 415 aa  51.2  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 		 616 aa  51.2  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  24.14 
 
 		 353 aa  51.2  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  27.98 
 
 		 299 aa  51.2  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  33.63 
 
 		 958 aa  50.8  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  26.52 
 
 		 300 aa  50.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 340 aa  50.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>