158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0278 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0278  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 576 aa  1189    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.859999  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  36.47 
 
 		 680 aa  360  4e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  32.75 
 
 		 1600 aa  319  1e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3056  hypothetical protein  29.95 
 
 		 293 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  27.48 
 
 		 723 aa  94.4  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2178  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 		 1256 aa  91.3  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  24.46 
 
 		 1444 aa  90.5  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  26.39 
 
 		 1312 aa  87.8  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  24.59 
 
 		 1523 aa  84.3  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 785 aa  84.7  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  24.77 
 
 		 1162 aa  83.2  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  26.17 
 
 		 1268 aa  82.8  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  24.59 
 
 		 1523 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  22.84 
 
 		 1314 aa  80.1  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 		 369 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2088  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.82 
 
 		 384 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  24.12 
 
 		 1435 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  23.33 
 
 		 457 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0044  glycosyl transferase family protein  23.85 
 
 		 746 aa  72  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0930  glycosyl transferase family protein  23.77 
 
 		 827 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0478435 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1793  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.5 
 
 		 862 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.101573 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  20.83 
 
 		 1287 aa  70.5  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  23.29 
 
 		 1317 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  22.22 
 
 		 1119 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  22.62 
 
 		 1340 aa  67  0.0000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  23.87 
 
 		 298 aa  66.6  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0549  glycosyl transferase family protein  24.11 
 
 		 818 aa  66.6  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0567321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0919  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 		 355 aa  66.6  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00244033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3593  glycosyl transferase family protein  27.75 
 
 		 346 aa  67  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00282179  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 		 679 aa  64.7  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1402  glycosyl transferase family protein  22.17 
 
 		 852 aa  64.7  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  20.18 
 
 		 616 aa  63.2  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  20.74 
 
 		 280 aa  62.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2865  glycosyl transferase family protein  22.18 
 
 		 345 aa  62  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000384977  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  22.32 
 
 		 624 aa  61.2  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  20.95 
 
 		 270 aa  60.8  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2627  glycosyl transferase family protein  19.76 
 
 		 1185 aa  60.5  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112993  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  21.3 
 
 		 1077 aa  59.3  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2508  glycosyl transferase family 2  25.5 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000796473  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  22.33 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  20.85 
 
 		 700 aa  57  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2323  hypothetical protein  24.76 
 
 		 250 aa  57  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1711  glycosyl transferase family 2  25.71 
 
 		 337 aa  56.6  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9788799999999997e-27 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1063  glycosyl transferase family protein  23.18 
 
 		 818 aa  56.2  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  19.91 
 
 		 525 aa  55.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 		 346 aa  56.2  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3624  glycosyl transferase family 2  25.88 
 
 		 319 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0432  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 348 aa  54.7  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  27.69 
 
 		 310 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  25.44 
 
 		 337 aa  52.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  23.66 
 
 		 892 aa  52.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6257  glycosyl transferase family protein  18.35 
 
 		 987 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0286803  normal  0.0257469 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1565  glycosyl transferase family 2  23.04 
 
 		 970 aa  52.8  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000603283  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  21.98 
 
 		 345 aa  52  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  24.54 
 
 		 528 aa  52  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3301  glycosyl transferase family protein  24.81 
 
 		 319 aa  52  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 355 aa  52  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7666  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  19.14 
 
 		 1132 aa  51.6  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  27.55 
 
 		 310 aa  51.2  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16631  glycosyl transferase family protein  27.08 
 
 		 314 aa  51.2  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.505772 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12320  glycosyl transferase  23.44 
 
 		 343 aa  51.2  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1578  cell wall membrane glycosyltransferase  30.68 
 
 		 349 aa  50.8  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  23.91 
 
 		 2401 aa  50.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1836  methyltransferase FkbM family  20.18 
 
 		 1673 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  23.12 
 
 		 324 aa  49.7  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1248  glycosyltransferase  27 
 
 		 310 aa  49.7  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0573246  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0883  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 310 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.178472 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  24.39 
 
 		 359 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  18.47 
 
 		 350 aa  49.7  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1268  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 		 369 aa  50.1  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.6355  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  22.37 
 
 		 1739 aa  50.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  22.58 
 
 		 294 aa  49.7  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  22.5 
 
 		 328 aa  49.3  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  24.79 
 
 		 994 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  22.43 
 
 		 322 aa  49.3  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  22.29 
 
 		 306 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  21.33 
 
 		 632 aa  49.7  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  23.66 
 
 		 398 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  23.16 
 
 		 841 aa  48.9  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2371  glycosyltransferase  23.08 
 
 		 326 aa  48.1  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  22.01 
 
 		 311 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1947  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.07 
 
 		 968 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  28.87 
 
 		 316 aa  47.8  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1913  glycosyl transferase family 2  25.15 
 
 		 286 aa  47.8  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  24.53 
 
 		 320 aa  47.8  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02310  glycosyl transferase  21.01 
 
 		 354 aa  47.8  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  21.95 
 
 		 325 aa  47.4  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1415  glycosyl transferase family protein  23.08 
 
 		 312 aa  47.4  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435994 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  26.17 
 
 		 348 aa  47.4  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  22.88 
 
 		 1644 aa  47  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0503  glycosyl transferase family protein  19.49 
 
 		 290 aa  47.4  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0779995  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0380  glycosyl transferase family 2  23.97 
 
 		 298 aa  47  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  22.88 
 
 		 1644 aa  47  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1508  glycosyl transferase family protein  20.73 
 
 		 1198 aa  47  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  25.64 
 
 		 703 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  22.12 
 
 		 318 aa  46.6  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  22.73 
 
 		 361 aa  47  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  24.43 
 
 		 300 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6296  glycosyl transferase family 2  20.59 
 
 		 814 aa  47  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  19 
 
 		 299 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>