More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1063 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0549  glycosyl transferase family protein  76.16 
 
 		 818 aa  1270    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0567321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1063  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 818 aa  1640    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1793  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.48 
 
 		 862 aa  204  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.101573 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  37.64 
 
 		 1287 aa  202  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0930  glycosyl transferase family protein  35.28 
 
 		 827 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0478435 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  43.01 
 
 		 1312 aa  196  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1402  glycosyl transferase family protein  38.14 
 
 		 852 aa  193  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6296  glycosyl transferase family 2  42.38 
 
 		 814 aa  188  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  39.61 
 
 		 1314 aa  188  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  37.84 
 
 		 1444 aa  187  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2178  glycosyl transferase family protein  37.07 
 
 		 1256 aa  182  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1836  methyltransferase FkbM family  40.22 
 
 		 1673 aa  179  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0044  glycosyl transferase family protein  41.26 
 
 		 746 aa  172  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1895  glycosyl transferase family protein  42.92 
 
 		 953 aa  171  6e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207282  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2494  glycosyl transferase family 2  38.66 
 
 		 1059 aa  169  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1204  glycosyl transferase family protein  38.8 
 
 		 1322 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2218  glycosyl transferase family protein  38.29 
 
 		 1035 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.966726 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2886  glycosyl transferase family 2  39.37 
 
 		 1008 aa  164  7e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0431865 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6257  glycosyl transferase family protein  35.75 
 
 		 987 aa  161  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0286803  normal  0.0257469 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2175  glycosyl transferase family 2  40.15 
 
 		 995 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1576  glycosyl transferase family protein  40.15 
 
 		 1313 aa  155  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.897283 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  35.31 
 
 		 1317 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2627  glycosyl transferase family protein  35.96 
 
 		 1185 aa  155  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112993  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  31.56 
 
 		 723 aa  147  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4121  glycosyl transferase family protein  35.11 
 
 		 850 aa  144  7e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  30.03 
 
 		 785 aa  110  9.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  27.63 
 
 		 1523 aa  103  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  28.06 
 
 		 1119 aa  100  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05411  putative glycosyl transferase  29.61 
 
 		 387 aa  99.4  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.42422  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  31.08 
 
 		 680 aa  98.6  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 		 1523 aa  97.1  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  31.74 
 
 		 624 aa  95.9  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  32.65 
 
 		 1162 aa  95.1  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  29.54 
 
 		 1340 aa  94  9e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  25.2 
 
 		 1435 aa  94.4  9e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  30.33 
 
 		 1600 aa  93.2  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 		 679 aa  92.4  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  24.19 
 
 		 369 aa  89.7  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  28.23 
 
 		 1268 aa  90.1  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  24.9 
 
 		 457 aa  79.7  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  26.77 
 
 		 280 aa  79  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0259  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 		 658 aa  77.8  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02687  hypothetical protein  27.8 
 
 		 279 aa  76.3  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.475562  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  30.67 
 
 		 616 aa  75.1  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  29.03 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2344  glycosyl transferase family 2  26.47 
 
 		 301 aa  73.6  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.0000247035 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1711  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 		 337 aa  70.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9788799999999997e-27 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  24.77 
 
 		 270 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  25.51 
 
 		 902 aa  69.7  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  29.51 
 
 		 303 aa  68.9  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0885  glycosyl transferase family 2  29.15 
 
 		 817 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  25.21 
 
 		 320 aa  68.9  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  24.42 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 		 1106 aa  68.2  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2596  glycosyl transferase family protein  27.98 
 
 		 315 aa  66.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00437692  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0509  glycosyl transferase family 2  31.91 
 
 		 1075 aa  66.2  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.0268717 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 		 401 aa  66.6  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  26.52 
 
 		 2401 aa  65.9  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 		 703 aa  65.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 		 300 aa  65.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  23.04 
 
 		 733 aa  65.5  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2807  glycosyl transferase family protein  26.44 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2352  glycosyl transferase family 2  30.52 
 
 		 337 aa  65.1  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013468  hitchhiker  0.0000313698 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  30.69 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0729  glycosyl transferase family protein  25.78 
 
 		 586 aa  64.7  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155064  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 		 282 aa  63.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  28.64 
 
 		 282 aa  62.4  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  26.18 
 
 		 525 aa  62.4  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2508  glycosyl transferase family 2  28.1 
 
 		 337 aa  62.4  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000796473  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4005  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 		 790 aa  61.6  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318857  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  30.99 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2875  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0432  glycosyl transferase family protein  25.9 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  23.68 
 
 		 632 aa  61.2  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  26.25 
 
 		 1275 aa  60.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  28.02 
 
 		 337 aa  60.5  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  22.59 
 
 		 824 aa  60.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  24.9 
 
 		 700 aa  60.5  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  25.29 
 
 		 334 aa  60.8  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  23.26 
 
 		 860 aa  60.8  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0557  hypothetical protein  25.73 
 
 		 284 aa  59.3  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17155  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0736  glycosyl transferase family protein  25.28 
 
 		 326 aa  59.7  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.59773 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  25.35 
 
 		 321 aa  59.7  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  23.79 
 
 		 994 aa  60.1  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  23.76 
 
 		 1077 aa  60.1  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  21.89 
 
 		 1509 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  27.88 
 
 		 346 aa  59.7  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.54 
 
 		 610 aa  58.9  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  22.92 
 
 		 1739 aa  59.3  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2967  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 		 324 aa  59.3  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  23.02 
 
 		 988 aa  59.3  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  23.83 
 
 		 723 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  27.64 
 
 		 337 aa  59.3  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  23.53 
 
 		 832 aa  59.3  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0114  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  24.8 
 
 		 1486 aa  58.9  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 		 841 aa  58.9  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  27 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>