More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0562 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
616 aa  1278    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  49.03 
 
 
679 aa  585  1e-166  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  48.04 
 
 
624 aa  583  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1988  glycosyl transferase group 1  48.01 
 
 
374 aa  310  5e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.590311  normal  0.0366847 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1720  glycosyl transferase, group 1  48.14 
 
 
377 aa  304  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.588865 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3884  glycosyl transferase group 1  48.44 
 
 
359 aa  303  7.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.242445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0855  glycosyl transferase, group 1  48.99 
 
 
359 aa  297  4e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2764  glycosyl transferase group 1  43.02 
 
 
357 aa  276  8e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  39.75 
 
 
1267 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  38.4 
 
 
1523 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  29.81 
 
 
1644 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  29.81 
 
 
1644 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  35.41 
 
 
1162 aa  141  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  36.11 
 
 
1523 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0763  glycosyl transferase group 1  32.07 
 
 
725 aa  140  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  33.67 
 
 
1267 aa  140  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  40.93 
 
 
300 aa  140  8.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  35.27 
 
 
303 aa  138  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  36.94 
 
 
320 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  33.46 
 
 
1268 aa  127  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  38.33 
 
 
298 aa  126  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  31.92 
 
 
1119 aa  124  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  33.48 
 
 
337 aa  124  7e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  33.2 
 
 
1219 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 
305 aa  120  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  34.04 
 
 
298 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  30.42 
 
 
1739 aa  118  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  34.4 
 
 
1340 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0139  glycosyl transferase family protein  33.87 
 
 
319 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.412068  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
334 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  32.67 
 
 
785 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 
369 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  33.94 
 
 
2401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  35.62 
 
 
337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  32.34 
 
 
311 aa  112  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  29.77 
 
 
311 aa  109  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  28.96 
 
 
310 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 
318 aa  108  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  31.08 
 
 
318 aa  108  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  31.78 
 
 
635 aa  108  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  27.97 
 
 
1232 aa  108  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  32.05 
 
 
401 aa  107  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  31.05 
 
 
3301 aa  107  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  40.34 
 
 
1635 aa  107  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0233  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.33 
 
 
315 aa  107  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.885705  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0409  glycosyl transferase family 2  31.33 
 
 
315 aa  107  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.535242  hitchhiker  0.0010651 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
308 aa  107  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  31.51 
 
 
361 aa  106  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  29.57 
 
 
632 aa  106  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
880 aa  106  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  33.79 
 
 
455 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1074  glycosyl transferase group 1  31.17 
 
 
404 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.168382  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  29.64 
 
 
625 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  29.64 
 
 
625 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  32.38 
 
 
330 aa  105  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
1359 aa  105  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  32.05 
 
 
670 aa  104  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  31.91 
 
 
700 aa  103  7e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  31.91 
 
 
1435 aa  103  8e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  30.2 
 
 
602 aa  103  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 
299 aa  103  9e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  34.2 
 
 
525 aa  103  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
314 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  31.49 
 
 
312 aa  103  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  37.17 
 
 
284 aa  102  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2484  glycosyl transferase, group 1  30.9 
 
 
856 aa  102  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.672737  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
958 aa  101  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  31.36 
 
 
325 aa  102  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.41 
 
 
610 aa  101  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0238  glycosyltransferase  27.12 
 
 
342 aa  100  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00200202  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  36.32 
 
 
270 aa  101  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2849  glycosyl transferase family protein  29.84 
 
 
824 aa  100  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 
304 aa  100  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 
742 aa  100  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1748  glycosyl transferase family protein  32.86 
 
 
300 aa  99.8  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 
324 aa  99.8  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4883  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 
653 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830469  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0250  glycosyl transferase family 2  28.26 
 
 
344 aa  99.8  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000000444925  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 
1509 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 
684 aa  99  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2068  hypothetical protein  26.67 
 
 
394 aa  99.4  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.505538  normal  0.336979 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  28.91 
 
 
299 aa  99.4  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2364  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
774 aa  98.6  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.869085  normal  0.0140446 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
329 aa  98.2  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0205  glycosyl transferase family protein  32.75 
 
 
339 aa  98.2  4e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
625 aa  98.2  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  29.84 
 
 
310 aa  97.8  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  32.11 
 
 
302 aa  97.8  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  27.17 
 
 
340 aa  97.4  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  28.99 
 
 
822 aa  97.4  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 
289 aa  97.1  8e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  27.34 
 
 
346 aa  97.1  8e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  31.39 
 
 
305 aa  97.1  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  29.32 
 
 
313 aa  97.1  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  28.26 
 
 
321 aa  96.7  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
742 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 
457 aa  96.7  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3301  glycosyl transferase family protein  29.84 
 
 
319 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  30.22 
 
 
333 aa  96.7  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2348  glycosyl transferase  29.92 
 
 
1837 aa  95.5  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>