More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2949 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
299 aa  614  1e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  81.37 
 
 
308 aa  514  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  71.38 
 
 
299 aa  432  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  60.07 
 
 
306 aa  369  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  45.97 
 
 
298 aa  270  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  45.48 
 
 
705 aa  259  4e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  38 
 
 
652 aa  229  5e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  44.01 
 
 
312 aa  217  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  43.22 
 
 
311 aa  209  5e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.52 
 
 
355 aa  201  9.999999999999999e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  40.78 
 
 
311 aa  199  7e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  39 
 
 
310 aa  192  7e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  39.39 
 
 
360 aa  191  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  34.84 
 
 
290 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  39.57 
 
 
306 aa  188  8e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1773  glycosyl transferase family protein  41.98 
 
 
303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.314835  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  38.93 
 
 
318 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  40.46 
 
 
314 aa  179  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  44.53 
 
 
317 aa  179  5.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  37.76 
 
 
313 aa  177  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.98 
 
 
379 aa  173  2.9999999999999996e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  36.82 
 
 
387 aa  172  5e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0256  glycosyl transferase family 2  35.15 
 
 
334 aa  165  8e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0188043  normal  0.110004 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  30.98 
 
 
297 aa  161  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  35.88 
 
 
293 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  34.31 
 
 
308 aa  161  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  36.74 
 
 
324 aa  157  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0842  hypothetical protein  30.98 
 
 
297 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  38.11 
 
 
325 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
324 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  37.39 
 
 
334 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  37.39 
 
 
324 aa  152  8.999999999999999e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  33.92 
 
 
312 aa  150  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  34.87 
 
 
324 aa  150  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  35.64 
 
 
333 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  32.46 
 
 
310 aa  150  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  34.78 
 
 
327 aa  149  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0840  hypothetical protein  31.87 
 
 
296 aa  149  8e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.23 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  34.38 
 
 
340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  33.21 
 
 
294 aa  144  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 
334 aa  143  4e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  35.86 
 
 
324 aa  143  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  32.63 
 
 
329 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  32.18 
 
 
289 aa  139  6e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  36.86 
 
 
282 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  33.22 
 
 
336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  35.04 
 
 
327 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  30.03 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  32.49 
 
 
318 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  34.52 
 
 
327 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  32.49 
 
 
318 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  32.49 
 
 
318 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  32.49 
 
 
318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 
313 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  32.71 
 
 
714 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4437  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
331 aa  124  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  35.16 
 
 
298 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2875  glycosyl transferase family 2  33.22 
 
 
324 aa  122  7e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  32.7 
 
 
283 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  31.56 
 
 
307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2967  glycosyl transferase family 2  32.87 
 
 
324 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  34.33 
 
 
337 aa  119  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6387  glycosyl transferase family 2  32.33 
 
 
340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0741751  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 
318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  33.33 
 
 
336 aa  117  3e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  30.18 
 
 
361 aa  117  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  32.46 
 
 
306 aa  116  6e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13294  dTDP-RHA:A-D-GlcNAc-diphosphoryl polyprenol-A-3-L-rhamnosyl transferase wbbL1  29.23 
 
 
301 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.621621 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0858  b-glycosyltransferase  29.03 
 
 
301 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.043059  normal  0.0575748 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  32.11 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  35.02 
 
 
284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  31.42 
 
 
300 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0693  glycosyl transferase family 2  29.71 
 
 
277 aa  113  3e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4703  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 
334 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261222  normal  0.175733 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2729  glycosyl transferase family protein  35.44 
 
 
298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0791  glycosyl transferase family protein  31.87 
 
 
342 aa  113  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.965247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
307 aa  112  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  32.43 
 
 
279 aa  112  8.000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3217  glycosyl transferase family 2  31.2 
 
 
455 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  32.42 
 
 
288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  32.39 
 
 
322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  29.23 
 
 
305 aa  110  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  30.51 
 
 
320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  32.61 
 
 
330 aa  108  8.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  34.06 
 
 
303 aa  108  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1341  glycosyl transferase family 2  32.64 
 
 
272 aa  108  9.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000344524  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  32.09 
 
 
314 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  30.38 
 
 
310 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 
318 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  27.01 
 
 
346 aa  107  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0094  glycosyl transferase family 2  29.26 
 
 
312 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4006  glycosyl transferase family 2  31.3 
 
 
342 aa  106  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0965  glycosyl transferase family protein  32.67 
 
 
275 aa  106  5e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.253321  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
305 aa  106  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  29.25 
 
 
338 aa  105  8e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3898  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 
298 aa  105  9e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  29.92 
 
 
314 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0837  glycosyl transferase family protein  32.23 
 
 
330 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>