More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0883 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  50.57 
 
 
1561 aa  670    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  52.95 
 
 
625 aa  637    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  54.2 
 
 
625 aa  679    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  50.27 
 
 
1509 aa  718    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  53.97 
 
 
632 aa  661    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  54.2 
 
 
625 aa  679    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
723 aa  1498    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  51.6 
 
 
958 aa  599  1e-170  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  52.81 
 
 
1275 aa  597  1e-169  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0852  glycosyl transferase family protein  49.74 
 
 
765 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  52.55 
 
 
709 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  52.55 
 
 
709 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  45.09 
 
 
733 aa  541  9.999999999999999e-153  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  48.58 
 
 
731 aa  532  1e-150  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  44.77 
 
 
1067 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  40.92 
 
 
1334 aa  508  9.999999999999999e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  45.12 
 
 
1152 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0354  glycosyl transferase family protein  46.5 
 
 
658 aa  496  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  45.12 
 
 
1152 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  44.29 
 
 
746 aa  488  1e-136  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4005  glycosyl transferase family 2  44.2 
 
 
790 aa  484  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318857  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  44.84 
 
 
721 aa  481  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  47.74 
 
 
710 aa  475  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  46.29 
 
 
717 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  49.55 
 
 
775 aa  464  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  46.47 
 
 
717 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0725  glycosyl transferase family protein  43.32 
 
 
734 aa  443  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.492928  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  38.37 
 
 
1182 aa  439  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  44.67 
 
 
728 aa  434  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  40.38 
 
 
1991 aa  431  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  40.07 
 
 
1486 aa  426  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  35.01 
 
 
988 aa  421  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  39.58 
 
 
602 aa  419  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  40.53 
 
 
832 aa  409  1e-113  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  41.17 
 
 
996 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  41.08 
 
 
880 aa  403  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  36.95 
 
 
742 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  39.2 
 
 
742 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1971  glycosyl transferase family 2  40.96 
 
 
1084 aa  399  1e-109  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  38.85 
 
 
742 aa  394  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  37.72 
 
 
983 aa  389  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2052  glycosyl transferase family 2  38.04 
 
 
794 aa  382  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.039975  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  39.07 
 
 
857 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2009  glycosyl transferase  36.4 
 
 
810 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  45.79 
 
 
610 aa  364  3e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0236  hypothetical protein  34.99 
 
 
783 aa  352  1e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000717832  normal  0.75423 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  34.76 
 
 
958 aa  318  2e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0729  glycosyl transferase family protein  35.46 
 
 
586 aa  310  5e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155064  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  35.47 
 
 
617 aa  298  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0929  glycosyl transferase family protein  35.59 
 
 
796 aa  293  5e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  30.8 
 
 
1644 aa  292  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  30.8 
 
 
1644 aa  292  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0769  glycosyl transferase family 2  33.62 
 
 
732 aa  292  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.034944 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1792  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.65 
 
 
809 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  37.77 
 
 
808 aa  280  6e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  36.01 
 
 
2046 aa  278  2e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0804  glycosyl transferase family 2  32.76 
 
 
725 aa  273  6e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16838 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3207  glycosyl transferase family protein  39.64 
 
 
576 aa  272  1e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  31.65 
 
 
725 aa  266  7e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  40.33 
 
 
1359 aa  265  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  37.39 
 
 
729 aa  265  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  34.22 
 
 
684 aa  259  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  33.17 
 
 
1759 aa  258  4e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  33.71 
 
 
670 aa  253  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1842  glycosyl transferase family 2  35.15 
 
 
531 aa  248  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0600  glycosyl transferase family 2  34.22 
 
 
684 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.149205 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1062  glycosyl transferase family protein  37.58 
 
 
783 aa  246  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2613  glycosyl transferase family protein  40.4 
 
 
556 aa  244  5e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  36.59 
 
 
635 aa  243  6e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1841  glycosyl transferase family 2  36.26 
 
 
652 aa  243  9e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1043  glycosyl transferase family 2  32.3 
 
 
1009 aa  241  4e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0124689  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4882  glycosyl transferase family protein  37.8 
 
 
526 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.763618  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0422  glycosyl transferase family protein  31.97 
 
 
1297 aa  236  2.0000000000000002e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4883  glycosyl transferase family protein  36.71 
 
 
653 aa  233  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830469  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  35.14 
 
 
632 aa  231  4e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0563  glycosyl transferase family 2  37.89 
 
 
555 aa  227  6e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.158623 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2886  glycosyl transferase family 2  31.09 
 
 
1213 aa  225  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.242978  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0548  glycosyl transferase family protein  35.91 
 
 
784 aa  221  5e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0588  glycosyl transferase family protein  37.89 
 
 
551 aa  218  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0599  glycosyl transferase family 2  37.96 
 
 
551 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 
662 aa  215  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1529  glycosyl transferase family 2  29.9 
 
 
748 aa  204  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3469  glycosyl transferase family protein  29.9 
 
 
1190 aa  204  6e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65715  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3488  glycosyl transferase family protein  34.95 
 
 
539 aa  203  7e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1508  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 
1198 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  32.6 
 
 
1188 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50300  hypothetical protein  29.05 
 
 
1694 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0552832  decreased coverage  0.000853187 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3720  glycosyl transferase family protein  29.88 
 
 
1193 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1946  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.33 
 
 
1191 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3348  glycosyl transferase family protein  27.32 
 
 
1074 aa  188  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0861977  normal  0.0615574 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1918  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.34 
 
 
1173 aa  183  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1517  glycosyl transferase family protein  31.04 
 
 
974 aa  180  9e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206981  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3468  glycosyl transferase family protein  32.01 
 
 
968 aa  178  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1947  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.59 
 
 
968 aa  172  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2650  glycosyl transferase family protein  26.01 
 
 
1177 aa  168  4e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1476  glycosyl transferase family protein  29.26 
 
 
1192 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.891442 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0638  glycosyltransferase  29.14 
 
 
972 aa  163  9e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.770569  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4280  hypothetical protein  29.81 
 
 
1171 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2031  glycosyltransferase  36.67 
 
 
1003 aa  160  8e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2593  glycosyl transferase family protein  26.35 
 
 
1187 aa  158  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.842346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>