294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1517 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1947  glycosyl transferase, group 2 family protein  49.52 
 
 
968 aa  930    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3468  glycosyl transferase family protein  49.74 
 
 
968 aa  951    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1517  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
974 aa  1998    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206981  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3712  glycosyl transferase family protein  56.67 
 
 
965 aa  1073    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1477  hypothetical protein  36.62 
 
 
905 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.559988 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  47.58 
 
 
1759 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  40.58 
 
 
1359 aa  394  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  38.86 
 
 
1188 aa  386  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4280  hypothetical protein  41.17 
 
 
1171 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2650  glycosyl transferase family protein  39.31 
 
 
1177 aa  358  2.9999999999999997e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1918  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.41 
 
 
1173 aa  355  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1482  glycosyl transferase family protein  38.06 
 
 
1162 aa  331  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345967  normal  0.675162 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00983  O-antigen biosynthesis protein  38.81 
 
 
1165 aa  328  3e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06183  O-antigen biosynthesis protein  38.81 
 
 
1165 aa  328  3e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00444077  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2593  glycosyl transferase family protein  33.84 
 
 
1187 aa  307  8.000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.842346  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3720  glycosyl transferase family protein  34.33 
 
 
1193 aa  293  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1508  glycosyl transferase family protein  33.27 
 
 
1198 aa  269  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1946  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.45 
 
 
1191 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3469  glycosyl transferase family protein  33.77 
 
 
1190 aa  262  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65715  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50300  hypothetical protein  35.84 
 
 
1694 aa  247  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0552832  decreased coverage  0.000853187 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1476  glycosyl transferase family protein  32.32 
 
 
1192 aa  235  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.891442 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  27.71 
 
 
731 aa  212  3e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0852  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 
765 aa  204  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  30.62 
 
 
746 aa  202  1.9999999999999998e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 
632 aa  198  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  32.24 
 
 
1275 aa  198  3e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 
709 aa  195  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  26.51 
 
 
1486 aa  195  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 
709 aa  195  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  28.61 
 
 
958 aa  186  2.0000000000000003e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  31.53 
 
 
602 aa  186  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  29.93 
 
 
733 aa  185  3e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 
996 aa  183  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  29.47 
 
 
1509 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.79 
 
 
610 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0236  hypothetical protein  29.21 
 
 
783 aa  172  4e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000717832  normal  0.75423 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.12 
 
 
1561 aa  171  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
832 aa  170  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 
625 aa  169  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 
625 aa  169  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  27.47 
 
 
625 aa  168  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  31.04 
 
 
723 aa  168  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  27.19 
 
 
1182 aa  167  9e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0725  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 
734 aa  166  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.492928  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2886  glycosyl transferase family 2  30.15 
 
 
1213 aa  165  5.0000000000000005e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.242978  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  24.06 
 
 
1152 aa  164  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  25.11 
 
 
1067 aa  164  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  24.06 
 
 
1152 aa  162  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  27.02 
 
 
988 aa  162  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0354  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 
658 aa  159  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  24.94 
 
 
1334 aa  157  7e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  34.7 
 
 
635 aa  155  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  29.76 
 
 
684 aa  155  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  31.91 
 
 
710 aa  154  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  27.34 
 
 
617 aa  152  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  28.6 
 
 
880 aa  150  8e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3207  glycosyl transferase family protein  31.17 
 
 
576 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  32.97 
 
 
670 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  25.93 
 
 
1991 aa  149  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  30.75 
 
 
717 aa  148  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0599  glycosyl transferase family 2  29.46 
 
 
551 aa  148  6e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  30.21 
 
 
717 aa  147  9e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2052  glycosyl transferase family 2  29.93 
 
 
794 aa  147  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.039975  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0729  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 
586 aa  144  9e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155064  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1842  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
531 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4882  glycosyl transferase family protein  33.58 
 
 
526 aa  144  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.763618  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0588  glycosyl transferase family protein  29.16 
 
 
551 aa  142  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0600  glycosyl transferase family 2  31.69 
 
 
684 aa  139  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.149205 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1062  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 
783 aa  138  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0563  glycosyl transferase family 2  28.72 
 
 
555 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.158623 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  26.68 
 
 
983 aa  135  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3488  glycosyl transferase family protein  30.64 
 
 
539 aa  135  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2613  glycosyl transferase family protein  30.66 
 
 
556 aa  134  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2009  glycosyl transferase  25.83 
 
 
810 aa  134  7.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1792  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.75 
 
 
809 aa  134  9e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  29.77 
 
 
662 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0929  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 
796 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1841  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 
652 aa  129  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0769  glycosyl transferase family 2  27.29 
 
 
732 aa  128  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.034944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  32.35 
 
 
775 aa  128  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  29.35 
 
 
721 aa  128  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0548  glycosyl transferase family protein  30.07 
 
 
784 aa  127  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4005  glycosyl transferase family 2  23.06 
 
 
790 aa  127  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318857  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  24.53 
 
 
1644 aa  126  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  24.53 
 
 
1644 aa  126  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  26.26 
 
 
742 aa  126  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4883  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 
653 aa  125  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830469  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  31.95 
 
 
808 aa  124  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  27.52 
 
 
742 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
725 aa  122  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  28.34 
 
 
728 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0804  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
725 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16838 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  26.93 
 
 
2046 aa  120  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  26.26 
 
 
742 aa  119  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  28.61 
 
 
632 aa  119  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  26.62 
 
 
729 aa  118  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0422  glycosyl transferase family protein  26.03 
 
 
1297 aa  115  4.0000000000000004e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  24.2 
 
 
857 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013124  Afer_1971  glycosyl transferase family 2  26.44 
 
 
1084 aa  113  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  23.1 
 
 
958 aa  101  9e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal 
 
 
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