More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1842 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4882  glycosyl transferase family protein  77.52 
 
 		 526 aa  682    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.763618  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1842  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 531 aa  1025    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3488  glycosyl transferase family protein  61.19 
 
 		 539 aa  499  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0563  glycosyl transferase family 2  54.26 
 
 		 555 aa  481  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.158623 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0599  glycosyl transferase family 2  55.37 
 
 		 551 aa  475  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0588  glycosyl transferase family protein  55.34 
 
 		 551 aa  475  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  36.76 
 
 		 733 aa  287  2.9999999999999996e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  43.85 
 
 		 710 aa  286  8e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  36.85 
 
 		 731 aa  282  9e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  41.47 
 
 		 684 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  42.23 
 
 		 717 aa  274  3e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  41.53 
 
 		 717 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0852  glycosyl transferase family protein  37.15 
 
 		 765 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  35.25 
 
 		 958 aa  266  5.999999999999999e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  37.75 
 
 		 632 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  40.78 
 
 		 728 aa  265  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0729  glycosyl transferase family protein  37.28 
 
 		 586 aa  264  3e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155064  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1841  glycosyl transferase family 2  41.94 
 
 		 652 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  36.41 
 
 		 625 aa  257  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  36.41 
 
 		 625 aa  257  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  42.19 
 
 		 670 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  40.81 
 
 		 808 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  41.9 
 
 		 775 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  38.51 
 
 		 1275 aa  255  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  31.74 
 
 		 1334 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  38.16 
 
 		 602 aa  255  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  35.08 
 
 		 709 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  35.08 
 
 		 709 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1792  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.8 
 
 		 809 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4883  glycosyl transferase family protein  43.93 
 
 		 653 aa  251  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830469  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  38.11 
 
 		 617 aa  250  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0929  glycosyl transferase family protein  40.79 
 
 		 796 aa  249  7e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1062  glycosyl transferase family protein  40.59 
 
 		 783 aa  249  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  33.71 
 
 		 1509 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.12 
 
 		 610 aa  247  4e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0600  glycosyl transferase family 2  40.9 
 
 		 684 aa  246  9e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149205 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  41.06 
 
 		 635 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  40.93 
 
 		 721 aa  244  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  35.41 
 
 		 1486 aa  244  3.9999999999999997e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.15 
 
 		 1561 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  33.49 
 
 		 1067 aa  236  9e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  48.26 
 
 		 662 aa  229  9e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  35.15 
 
 		 723 aa  229  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  30.94 
 
 		 746 aa  226  6e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  39.07 
 
 		 1759 aa  225  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 		 1152 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 		 1152 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  36.06 
 
 		 880 aa  224  4e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  33.86 
 
 		 625 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  44.78 
 
 		 1359 aa  217  5e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3207  glycosyl transferase family protein  33.41 
 
 		 576 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  37.77 
 
 		 729 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0548  glycosyl transferase family protein  38.98 
 
 		 784 aa  212  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  35.63 
 
 		 632 aa  206  8e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  34.21 
 
 		 832 aa  205  1e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  33.81 
 
 		 1182 aa  202  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  32.13 
 
 		 996 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  34.91 
 
 		 983 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  33.72 
 
 		 1991 aa  197  5.000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0354  glycosyl transferase family protein  28.67 
 
 		 658 aa  197  5.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  32.87 
 
 		 1644 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  32.87 
 
 		 1644 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  32.77 
 
 		 988 aa  194  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0769  glycosyl transferase family 2  37.03 
 
 		 732 aa  193  8e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.034944 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2052  glycosyl transferase family 2  30.66 
 
 		 794 aa  191  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.039975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2009  glycosyl transferase  29.13 
 
 		 810 aa  189  7e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2613  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 		 556 aa  187  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  33.26 
 
 		 742 aa  184  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0804  glycosyl transferase family 2  34.93 
 
 		 725 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16838 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  34.84 
 
 		 958 aa  182  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  32.06 
 
 		 857 aa  181  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  33.49 
 
 		 742 aa  180  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  33.57 
 
 		 742 aa  180  7e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0422  glycosyl transferase family protein  35.13 
 
 		 1297 aa  179  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4005  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 		 790 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  34.71 
 
 		 725 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2886  glycosyl transferase family 2  31.45 
 
 		 1213 aa  170  6e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.242978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3469  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 		 1190 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0725  glycosyl transferase family protein  30.18 
 
 		 734 aa  162  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.492928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3720  glycosyl transferase family protein  31.01 
 
 		 1193 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1529  glycosyl transferase family 2  33.52 
 
 		 748 aa  158  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  28.54 
 
 		 1188 aa  157  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1971  glycosyl transferase family 2  32.55 
 
 		 1084 aa  157  4e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1946  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.69 
 
 		 1191 aa  156  7e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3468  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 968 aa  156  7e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00983  O-antigen biosynthesis protein  32.77 
 
 		 1165 aa  156  8e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06183  O-antigen biosynthesis protein  32.77 
 
 		 1165 aa  156  8e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00444077  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1508  glycosyl transferase family protein  30.68 
 
 		 1198 aa  154  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2593  glycosyl transferase family protein  28 
 
 		 1187 aa  152  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.842346  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2650  glycosyl transferase family protein  31.77 
 
 		 1177 aa  148  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1918  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.32 
 
 		 1173 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1947  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.92 
 
 		 968 aa  146  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4280  hypothetical protein  32.08 
 
 		 1171 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50300  hypothetical protein  30.48 
 
 		 1694 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0552832  decreased coverage  0.000853187 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1517  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 974 aa  143  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3712  glycosyl transferase family protein  32.75 
 
 		 965 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  27.75 
 
 		 2046 aa  140  7e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0236  hypothetical protein  23.6 
 
 		 783 aa  139  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000717832  normal  0.75423 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2031  glycosyltransferase  33.49 
 
 		 1003 aa  134  3.9999999999999996e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4009  glycosyl transferase, group 1  33.19 
 
 		 1386 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>