More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4883 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4883  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
653 aa  1242    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830469  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1841  glycosyl transferase family 2  80.21 
 
 
652 aa  927    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  53.6 
 
 
684 aa  555  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  54.87 
 
 
635 aa  553  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  52.6 
 
 
670 aa  534  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0600  glycosyl transferase family 2  53.28 
 
 
684 aa  525  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.149205 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  35.01 
 
 
958 aa  311  2e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  37.76 
 
 
710 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  34.48 
 
 
733 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  35.66 
 
 
717 aa  303  7.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  35.99 
 
 
717 aa  299  1e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  35.55 
 
 
721 aa  298  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  43.38 
 
 
775 aa  296  8e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  38.15 
 
 
662 aa  293  8e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  32.32 
 
 
731 aa  290  7e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  39.62 
 
 
602 aa  285  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  35.84 
 
 
728 aa  280  4e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.06 
 
 
610 aa  280  5e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1842  glycosyl transferase family 2  43.93 
 
 
531 aa  279  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0852  glycosyl transferase family protein  37.33 
 
 
765 aa  277  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  31.72 
 
 
1486 aa  273  6e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  37.21 
 
 
625 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  37.21 
 
 
625 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  38.1 
 
 
617 aa  271  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0729  glycosyl transferase family protein  36.31 
 
 
586 aa  266  8e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155064  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  39.23 
 
 
1275 aa  264  3e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1792  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.24 
 
 
809 aa  263  8e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0929  glycosyl transferase family protein  37.81 
 
 
796 aa  259  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 
632 aa  258  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0563  glycosyl transferase family 2  45.12 
 
 
555 aa  259  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.158623 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  35.08 
 
 
709 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  35.08 
 
 
709 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  32.81 
 
 
1509 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  38.9 
 
 
808 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4882  glycosyl transferase family protein  43.59 
 
 
526 aa  258  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.763618  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  37.13 
 
 
625 aa  250  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0588  glycosyl transferase family protein  41.32 
 
 
551 aa  250  7e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  29.09 
 
 
1152 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0599  glycosyl transferase family 2  41.93 
 
 
551 aa  248  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  33.14 
 
 
1644 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  33.14 
 
 
1644 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  29.09 
 
 
1152 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3207  glycosyl transferase family protein  36.26 
 
 
576 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  27.61 
 
 
1067 aa  246  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3488  glycosyl transferase family protein  43.39 
 
 
539 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2009  glycosyl transferase  31.51 
 
 
810 aa  241  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  25.38 
 
 
746 aa  241  2.9999999999999997e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  36.94 
 
 
723 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0354  glycosyl transferase family protein  32.58 
 
 
658 aa  239  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  44.33 
 
 
1359 aa  239  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  27.26 
 
 
1334 aa  238  3e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
729 aa  235  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1062  glycosyl transferase family protein  34.44 
 
 
783 aa  232  1e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  34.31 
 
 
880 aa  232  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  44.44 
 
 
1759 aa  232  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.66 
 
 
1561 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2052  glycosyl transferase family 2  34.18 
 
 
794 aa  229  2e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.039975  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  32.81 
 
 
988 aa  224  3e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  33.99 
 
 
832 aa  224  4e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  32.56 
 
 
742 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  33.28 
 
 
632 aa  218  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  34.55 
 
 
983 aa  217  4e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  31.92 
 
 
996 aa  218  4e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0769  glycosyl transferase family 2  36.35 
 
 
732 aa  216  8e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.034944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  33.55 
 
 
725 aa  209  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  32.2 
 
 
742 aa  208  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  32.02 
 
 
742 aa  207  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0804  glycosyl transferase family 2  33.23 
 
 
725 aa  204  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16838 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  29.18 
 
 
857 aa  203  8e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  31.35 
 
 
1182 aa  202  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0422  glycosyl transferase family protein  34.81 
 
 
1297 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  28.32 
 
 
1991 aa  196  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0548  glycosyl transferase family protein  33.15 
 
 
784 aa  191  4e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0725  glycosyl transferase family protein  30.27 
 
 
734 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.492928  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  31.33 
 
 
958 aa  184  4.0000000000000006e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2613  glycosyl transferase family protein  35.53 
 
 
556 aa  177  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1529  glycosyl transferase family 2  27.75 
 
 
748 aa  177  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1508  glycosyl transferase family protein  32.09 
 
 
1198 aa  177  8e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3720  glycosyl transferase family protein  29.14 
 
 
1193 aa  173  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50300  hypothetical protein  31.51 
 
 
1694 aa  171  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0552832  decreased coverage  0.000853187 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  26.88 
 
 
1188 aa  171  5e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2886  glycosyl transferase family 2  29.85 
 
 
1213 aa  170  8e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.242978  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4005  glycosyl transferase family 2  29.45 
 
 
790 aa  163  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318857  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0914  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 
669 aa  162  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.357692 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3633  glycosyl transferase, group 1  31.72 
 
 
510 aa  160  7e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.015452  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1971  glycosyl transferase family 2  31.86 
 
 
1084 aa  158  3e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1482  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 
1162 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345967  normal  0.675162 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  28.46 
 
 
2046 aa  148  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2031  glycosyltransferase  29.91 
 
 
1003 aa  147  6e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2593  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 
1187 aa  144  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.842346  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0236  hypothetical protein  22.64 
 
 
783 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000717832  normal  0.75423 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2650  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 
1177 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4009  glycosyl transferase, group 1  32.43 
 
 
1386 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1918  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.68 
 
 
1173 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4280  hypothetical protein  29.87 
 
 
1171 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1946  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.43 
 
 
1191 aa  137  8e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1974  glycosyl transferase family 2  39.59 
 
 
853 aa  135  3e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  34.77 
 
 
2401 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3468  glycosyl transferase family protein  25.44 
 
 
968 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1517  glycosyl transferase family protein  26.5 
 
 
974 aa  130  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206981  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>